UPK1B

UPK1B
Ідентифікатори
Символи	UPK1B, TSPAN20, UPIB, UPK1, uroplakin 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 602380 MGI: 98912 HomoloGene: 5065 GeneCards: UPK1B
Онтологія гена Молекулярна функція • structural molecule activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • екзосома • apical plasma membrane • мембрана • apical plasma membrane urothelial plaque Біологічний процес • cell surface receptor signaling pathway • epithelial cell differentiation • response to bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7348	22268
Ensembl	ENSG00000114638	ENSMUSG00000049436
UniProt	O75841	Q9Z2C6
RefSeq (мРНК)	NM_006952	NM_178924
RefSeq (білок)	NP_008883	NP_849255
Локус (UCSC)	Хр. 3: 119.17 – 119.21 Mb	Хр. 16: 38.59 – 38.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UPK1B (англ. Uroplakin 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 29 643.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKDNSTVRC		FQGLLIFGNV		IIGCCGIALT		AECIFFVSDQ		HSLYPLLEAT
DNDDIYGAAW		IGIFVGICLF		CLSVLGIVGI		MKSSRKILLA		YFILMFIVYA
FEVASCITAA		TQQDFFTPNL		FLKQMLERYQ		NNSPPNNDDQ		WKNNGVTKTW
DRLMLQDNCC		GVNGPSDWQK		YTSAFRTENN		DADYPWPRQC		CVMNNLKEPL
NLEACKLGVP		GFYHNQGCYE		LISGPMNRHA		WGVAWFGFAI		LCWTFWVLLG
TMFYWSRIEY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

• Finch J.L., Miller J., Aspinall J.O., Cowled P.A. (1999). Cloning of the human uroplakin 1B cDNA and analysis of its expression in urothelial-tumor cell lines and bladder-carcinoma tissue. Int. J. Cancer. 80: 533—538. PMID 9935153 DOI:10.1002/(SICI)1097-0215(19990209)80:4<533::AID-IJC9>3.0.CO;2-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Finch J.L., Webb G.C., Evdokiou A., Cowled P.A. (1997). Chromosomal localization of the human urothelial 'tetraspan' gene, UPK1B, to 3q13.3-q21 and detection of a TaqI polymorphism. Genomics. 40: 501—503. PMID 9073521 DOI:10.1006/geno.1996.4589

Див. також

• Хромосома 3