USP33

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
USP33
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи USP33, VDU1, ubiquitin specific peptidase 33
Зовнішні ІД OMIM: 615146 MGI: 2159711 HomoloGene: 8996 GeneCards: USP33
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_015017
NM_201624
NM_201626
NM_001076676
NM_001252486
NM_133247
NM_001355666
RefSeq (білок)
NP_001070144
NP_001239415
NP_573510
NP_001342595
Локус (UCSC) Хр. 1: 77.7 – 77.76 Mb Хр. 3: 152.05 – 152.1 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

USP33 (англ. Ubiquitin specific peptidase 33) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 942 амінокислот, а молекулярна маса — 106 727[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTGSNSHITILTLKVLPHFESLGKQEKIPNKMSAFRNHCPHLDSVGEITK
EDLIQKSLGTCQDCKVQGPNLWACLENRCSYVGCGESQVDHSTIHSQETK
HYLTVNLTTLRVWCYACSKEVFLDRKLGTQPSLPHVRQPHQIQENSVQDF
KIPSNTTLKTPLVAVFDDLDIEADEEDELRARGLTGLKNIGNTCYMNAAL
QALSNCPPLTQFFLDCGGLARTDKKPAICKSYLKLMTELWHKSRPGSVVP
TTLFQGIKTVNPTFRGYSQQDAQEFLRCLMDLLHEELKEQVMEVEEDPQT
ITTEETMEEDKSQSDVDFQSCESCSNSDRAENENGSRCFSEDNNETTMLI
QDDENNSEMSKDWQKEKMCNKINKVNSEGEFDKDRDSISETVDLNNQETV
KVQIHSRASEYITDVHSNDLSTPQILPSNEGVNPRLSASPPKSGNLWPGL
APPHKKAQSASPKRKKQHKKYRSVISDIFDGTIISSVQCLTCDRVSVTLE
TFQDLSLPIPGKEDLAKLHSSSHPTSIVKAGSCGEAYAPQGWIAFFMEYV
KRFVVSCVPSWFWGPVVTLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGV
KFCKVQNFPEILCIHLKRFRHELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPFLAKDS
PAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHYIAYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSES
TVQNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKF
KTFAEPGPISNNDFLCIHGGVPPRKAGYIEDLVLMLPQNIWDNLYSRYGG
GPAVNHLYICHTCQIEAEKIEKRRKTELEIFIRLNRAFQKEDSPATFYCI
SMQWFREWESFVKGKDGDPPGPIDNTKIAVTKCGNVMLRQGADSGQISEE
TWNFLQSIYGGGPEVILRPPVVHVDPDILQAEEKIEVETRSL

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ендоцитоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Jeong J.Y., Wang Y., Sytkowski A.J. (2009). Human selenium binding protein-1 (hSP56) interacts with VDU1 in a selenium-dependent manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 379: 583—588. PMID 19118533 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.12.110
  • Berthouze M., Venkataramanan V., Li Y., Shenoy S.K. (2009). The deubiquitinases USP33 and USP20 coordinate beta2 adrenergic receptor recycling and resensitization. EMBO J. 28: 1684—1696. PMID 19424180 DOI:10.1038/emboj.2009.128
  • Thorne C., Eccles R.L., Coulson J.M., Urbe S., Clague M.J. (2011). Isoform-specific localization of the deubiquitinase USP33 to the Golgi apparatus. Traffic. 12: 1563—1574. PMID 21801292 DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01261.x
  • Allen M.D., Bycroft M. (2007). The solution structure of the ZnF UBP domain of USP33/VDU1. Protein Sci. 16: 2072—2075. PMID 17766394 DOI:10.1110/ps.072967807

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20059 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q8TEY7 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2018. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]