USP38

USP38
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4RXX
Ідентифікатори
Символи	USP38, HP43.8KD, ubiquitin specific peptidase 38
Зовнішні ІД	OMIM: 618322 MGI: 1922091 HomoloGene: 12367 GeneCards: USP38
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84640	74841
Ensembl	ENSG00000170185	ENSMUSG00000038250
UniProt	Q8NB14	Q8BW70
RefSeq (мРНК)	NM_001290325 NM_001290326 NM_032557	NM_027554
RefSeq (білок)	NP_001277254 NP_001277255 NP_115946	NP_081830
Локус (UCSC)	Хр. 4: 143.18 – 143.22 Mb	Хр. 8: 81.71 – 81.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP38 (англ. Ubiquitin specific peptidase 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 042 амінокислот, а молекулярна маса — 116 546.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDKILEGLVS		SSHPLPLKRV		IVRKVVESAE		HWLDEAQCEA		MFDLTTRLIL
EGQDPFQRQV		GHQVLEAYAR		YHRPEFESFF		NKTFVLGLLH		QGYHSLDRKD
VAILDYIHNG		LKLIMSCPSV		LDLFSLLQVE		VLRMVCERPE		PQLCARLSDL
LTDFVQCIPK		GKLSITFCQQ		LVRTIGHFQC		VSTQERELRE		YVSQVTKVSN
LLQNIWKAEP		ATLLPSLQEV		FASISSTDAS		FEPSVALASL		VQHIPLQMIT
VLIRSLTTDP		NVKDASMTQA		LCRMIDWLSW		PLAQHVDTWV		IALLKGLAAV
QKFTILIDVT		LLKIELVFNR		LWFPLVRPGA		LAVLSHMLLS		FQHSPEAFHL
IVPHVVNLVH		SFKNDGLPSS		TAFLVQLTEL		IHCMMYHYSG		FPDLYEPILE
AIKDFPKPSE		EKIKLILNQS		AWTSQSNSLA		SCLSRLSGKS		ETGKTGLINL
GNTCYMNSVI		QALFMATDFR		RQVLSLNLNG		CNSLMKKLQH		LFAFLAHTQR
EAYAPRIFFE		ASRPPWFTPR		SQQDCSEYLR		FLLDRLHEEE		KILKVQASHK
PSEILECSET		SLQEVASKAA		VLTETPRTSD		GEKTLIEKMF		GGKLRTHIRC
LNCRSTSQKV		EAFTDLSLAF		CPSSSLENMS		VQDPASSPSI		QDGGLMQASV
PGPSEEPVVY		NPTTAAFICD		SLVNEKTIGS		PPNEFYCSEN		TSVPNESNKI
LVNKDVPQKP		GGETTPSVTD		LLNYFLAPEI		LTGDNQYYCE		NCASLQNAEK
TMQITEEPEY		LILTLLRFSY		DQKYHVRRKI		LDNVSLPLVL		ELPVKRITSF
SSLSESWSVD		VDFTDLSENL		AKKLKPSGTD		EASCTKLVPY		LLSSVVVHSG
ISSESGHYYS		YARNITSTDS		SYQMYHQSEA		LALASSQSHL		LGRDSPSAVF
EQDLENKEMS		KEWFLFNDSR		VTFTSFQSVQ		KITSRFPKDT		AYVLLYKKQH
STNGLSGNNP		TSGLWINGDP		PLQKELMDAI		TKDNKLYLQE		QELNARARAL
QAASASCSFR		PNGFDDNDPP		GSCGPTGGGG		GGGFNTVGRL		VF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179

Див. також

• Хромосома 4