USP45

USP45
Ідентифікатори
Символи	USP45, ubiquitin specific peptidase 45, LCA19
Зовнішні ІД	OMIM: 618439 MGI: 101850 HomoloGene: 17674 GeneCards: USP45
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • global genome nucleotide-excision repair • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein deubiquitination • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	85015	77593
Ensembl	ENSG00000123552	ENSMUSG00000040455
UniProt	Q70EL2	Q8K387
RefSeq (мРНК)	NM_001080481 NM_001346021 NM_001346022 NM_001346023 NM_001346024 NM_001346025 NM_001346026 NM_001346027 NM_001346028 NM_001346029 NM_001346030 NM_001346033 NM_032929	NM_001290425 NM_152825
RefSeq (білок)	NP_001073950 NP_001332950 NP_001332951 NP_001332952 NP_001332953 NP_001332954 NP_001332955 NP_001332956 NP_001332957 NP_001332958 NP_001332959 NP_001332962 NP_116318	NP_001277354 NP_690038
Локус (UCSC)	Хр. 6: 99.43 – 99.52 Mb	Хр. 4: 21.77 – 21.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP45 (англ. Ubiquitin specific peptidase 45) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 814 амінокислот, а молекулярна маса — 91 733.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRVKDPTKAL		PEKAKRSKRP		TVPHDEDSSD		DIAVGLTCQH		VSHAISVNHV
KRAIAENLWS		VCSECLKERR		FYDGQLVLTS		DIWLCLKCGF		QGCGKNSESQ
HSLKHFKSSR		TEPHCIIINL		STWIIWCYEC		DEKLSTHCNK		KVLAQIVDFL
QKHASKTQTS		AFSRIMKLCE		EKCETDEIQK		GGKCRNLSVR		GITNLGNTCF
FNAVMQNLAQ		TYTLTDLMNE		IKESSTKLKI		FPSSDSQLDP		LVVELSRPGP
LTSALFLFLH		SMKETEKGPL		SPKVLFNQLC		QKAPRFKDFQ		QQDSQELLHY
LLDAVRTEET		KRIQASILKA		FNNPTTKTAD		DETRKKVKAY		GKEGVKMNFI
DRIFIGELTS		TVMCEECANI		STVKDPFIDI		SLPIIEERVS		KPLLWGRMNK
YRSLRETDHD		RYSGNVTIEN		IHQPRAAKKH		SSSKDKSQLI		HDRKCIRKLS
SGETVTYQKN		ENLEMNGDSL		MFASLMNSES		RLNESPTDDS		EKEASHSESN
VDADSEPSES		ESASKQTGLF		RSSSGSGVQP		DGPLYPLSAG		KLLYTKETDS
GDKEMAEAIS		ELRLSSTVTG		DQDFDRENQP		LNISNNLCFL		EGKHLRSYSP
QNAFQTLSQS		YITTSKECSI		QSCLYQFTSM		ELLMGNNKLL		CENCTKNKQK
YQEETSFAEK		KVEGVYTNAR		KQLLISAVPA		VLILHLKRFH		QAGLSLRKVN
RHVDFPLMLD		LAPFCSATCK		NASVGDKVLY		GLYGIVEHSG		SMREGHYTAY
VKVRTPSRKL		SEHNTKKKNV		PGLKAADNES		AGQWVHVSDT		YLQVVPESRA
LSAQAYLLFY		ERVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6