USP53

USP53
Ідентифікатори
Символи	USP53, ubiquitin specific peptidase 53
Зовнішні ІД	OMIM: 617431 MGI: 2139607 HomoloGene: 34521 GeneCards: USP53
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • cell-cell junction • bicellular tight junction • міжклітинні контакти • компонент клітини Біологічний процес • protein deubiquitination • слух • потенціал дії • GO:0097285 апоптоз • response to auditory stimulus • neuron apoptotic process • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54532	99526
Ensembl	ENSG00000145390	ENSMUSG00000039701
UniProt	Q70EK8	P15975
RefSeq (мРНК)	NM_019050 NM_001371395 NM_001371396 NM_001371397 NM_001371398 NM_001371399	NM_133857
RefSeq (білок)	NP_061923 NP_001358324 NP_001358325 NP_001358326 NP_001358327 NP_001358328	NP_598618
Локус (UCSC)	Хр. 4: 119.21 – 119.3 Mb	Хр. 3: 122.73 – 122.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP53 (англ. Ubiquitin specific peptidase 53) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 073 амінокислот, а молекулярна маса — 120 806.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAWVKFLRKP		GGNLGKVYQP		GSMLSLAPTK		GLLNEPGQNS		CFLNSAVQVL
WQLDIFRRSL		RVLTGHVCQG		DACIFCALKT		IFAQFQHSRE		KALPSDNIRH
ALAESFKDEQ		RFQLGLMDDA		AECFENMLER		IHFHIVPSRD		ADMCTSKSCI
THQKFAMTLY		EQCVCRSCGA		SSDPLPFTEF		VRYISTTALC		NEVERMLERH
ERFKPEMFAE		LLQAANTTDD		YRKCPSNCGQ		KIKIRRVLMN		CPEIVTIGLV
WDSEHSDLTE		AVVRNLATHL		YLPGLFYRVT		DENAKNSELN		LVGMICYTSQ
HYCAFAFHTK		SSKWVFFDDA		NVKEIGTRWK		DVVSKCIRCH		FQPLLLFYAN
PDGTAVSTED		ALRQVISWSH		YKSVAENMGC		EKPVIHKSDN		LKENGFGDQA
KQRENQKFPT		DNISSSNRSH		SHTGVGKGPA		KLSHIDQREK		IKDISRECAL
KAIEQKNLLS		SQRKDLEKGQ		RKDLGRHRDL		VDEDLSHFQS		GSPPAPNGFK
QHGNPHLYHS		QGKGSYKHDR		VVPQSRASAQ		IISSSKSQIL		APGEKITGKV
KSDNGTGYDT		DSSQDSRDRG		NSCDSSSKSR		NRGWKPMRET		LNVDSIFSES
EKRQHSPRHK		PNISNKPKSS		KDPSFSNWPK		ENPKQKGLMT		IYEDEMKQEI
GSRSSLESNG		KGAEKNKGLV		EGKVHGDNWQ		MQRTESGYES		SDHISNGSTN
LDSPVIDGNG		TVMDISGVKE		TVCFSDQITT		SNLNKERGDC		TSLQSQHHLE
GFRKELRNLE		AGYKSHEFHP		ESHLQIKNHL		IKRSHVHEDN		GKLFPSSSLQ
IPKDHNAREH		IHQSDEQKLE		KPNECKFSEW		LNIENSERTG		LPFHVDNSAS
GKRVNSNEPS		SLWSSHLRTV		GLKPETAPLI		QQQNIMDQCY		FENSLSTECI
IRSASRSDGC		QMPKLFCQNL		PPPLPPKKYA		ITSVPQSEKS		ESTPDVKLTE
VFKATSHLPK		HSLSTASEPS		LEVSTHMNDE		RHKETFQVRE		CFGNTPNCPS
SSSTNDFQAN		SGAIDAFCQP		ELDSISTCPN		ETVSLTTYFS		VDSCMTDTYR
LKYHQRPKLS		FPESSGFCNN		SLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4