USP6

USP6
Ідентифікатори
Символи	USP6, HRP1, TRE17, TRE2, TRESMCR, Tre-2, USP6-short, ubiquitin specific peptidase 6
Зовнішні ІД	OMIM: 604334 HomoloGene: 136783 GeneCards: USP6
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • nucleic acid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • calmodulin binding Клітинна компонента • цитоплазма • recycling endosome • ендосома • клітинна мембрана • лізосома • мембрана Біологічний процес • protein deubiquitination • regulation of vesicle-mediated transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • intracellular protein transport • regulation of vesicle fusion • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9098	н/д
Ensembl	ENSG00000129204	н/д
UniProt	P35125	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001304284 NM_004505 NM_005152	н/д
RefSeq (білок)	NP_001291213 NP_004496	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 5.12 – 5.18 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

USP6 (англ. Ubiquitin specific peptidase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 406 амінокислот, а молекулярна маса — 158 658.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDMVENADSL		QAQERKDILM		KYDKGHRAGL		PEDKGPEPVG		INSSIDRFGI
LHETELPPVT		AREAKKIRRE		MTRTSKWMEM		LGEWETYKHS		SKLIDRVYKG
IPMNIRGPVW		SVLLNIQEIK		LKNPGRYQIM		KERGKRSSEH		IHHIDLDVRT
TLRNHVFFRD		RYGAKQRELF		YILLAYSEYN		PEVGYCRDLS		HITALFLLYL
PEEDAFWALV		QLLASERHSL		PGFHSPNGGT		VQGLQDQQEH		VVPKSQPKTM
WHQDKEGLCG		QCASLGCLLR		NLIDGISLGL		TLRLWDVYLV		EGEQVLMPIT
SIALKVQQKR		LMKTSRCGLW		ARLRNQFFDT		WAMNDDTVLK		HLRASTKKLT
RKQGDLPPPA		KREQGSLAPR		PVPASRGGKT		LCKGYRQAPP		GPPAQFQRPI
CSASPPWASR		FSTPCPGGAV		REDTYPVGTQ		GVPSLALAQG		GPQGSWRFLE
WKSMPRLPTD		LDIGGPWFPH		YDFEWSCWVR		AISQEDQLAT		CWQAEHCGEV
HNKDMSWPEE		MSFTANSSKI		DRQKVPTEKG		ATGLSNLGNT		CFMNSSIQCV
SNTQPLTQYF		ISGRHLYELN		RTNPIGMKGH		MAKCYGDLVQ		ELWSGTQKSV
APLKLRRTIA		KYAPKFDGFQ		QQDSQELLAF		LLDGLHEDLN		RVHEKPYVEL
KDSDGRPDWE		VAAEAWDNHL		RRNRSIIVDL		FHGQLRSQVK		CKTCGHISVR
FDPFNFLSLP		LPMDSYMDLE		ITVIKLDGTT		PVRYGLRLNM		DEKYTGLKKQ
LRDLCGLNSE		QILLAEVHDS		NIKNFPQDNQ		KVQLSVSGFL		CAFEIPVPSS
PISASSPTQI		DFSSSPSTNG		MFTLTTNGDL		PKPIFIPNGM		PNTVVPCGTE
KNFTNGMVNG		HMPSLPDSPF		TGYIIAVHRK		MMRTELYFLS		PQENRPSLFG
MPLIVPCTVH		TRKKDLYDAV		WIQVSWLARP		LPPQEASIHA		QDRDNCMGYQ
YPFTLRVVQK		DGNSCAWCPQ		YRFCRGCKID		CGEDRAFIGN		AYIAVDWHPT
ALHLRYQTSQ		ERVVDKHESV		EQSRRAQAEP		INLDSCLRAF		TSEEELGESE
MYYCSKCKTH		CLATKKLDLW		RLPPFLIIHL		KRFQFVNDQW		IKSQKIVRFL
RESFDPSAFL		VPRDPALCQH		KPLTPQGDEL		SKPRILAREV		KKVDAQSSAG
KEDMLLSKSP		SSLSANISSS		PKGSPSSSRK		SGTSCPSSKN		SSPNSSPRTL
GRSKGRLRLP		QIGSKNKPSS		SKKNLDASKE		NGAGQICELA		DALSRGHMRG
GSQPELVTPQ		DHEVALANGF		LYEHEACGNG		CGDGYSNGQL		GNHSEEDSTD
DQREDTHIKP		IYNLYAISCH		SGILSGGHYI		TYAKNPNCKW		YCYNDSSCEE
LHPDEIDTDS		AYILFYEQQG		IDYAQFLPKI		DGKKMADTSS		TDEDSESDYE
KYSMLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• Paulding C.A., Ruvolo M., Haber D.A. (2003). The Tre2 (USP6) oncogene is a hominoid-specific gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 2507—2511. PMID 12604796 DOI:10.1073/pnas.0437015100
• Papa F.R., Hochstrasser M. (1993). The yeast DOA4 gene encodes a deubiquitinating enzyme related to a product of the human tre-2 oncogene. Nature. 366: 313—319. PMID 8247125 DOI:10.1038/366313a0
• Masuda-Robens J.M., Kutney S.N., Qi H., Chou M.M. (2003). The TRE17 oncogene encodes a component of a novel effector pathway for Rho GTPases Cdc42 and Rac1 and stimulates actin remodeling. Mol. Cell. Biol. 23: 2151—2161. PMID 12612085 DOI:10.1128/MCB.23.6.2151-2161.2003

Див. також

• Хромосома 17