VANGL2

VANGL2
Ідентифікатори
Символи	VANGL2, LPP1, LTAP, STB1, STBM, STBM1, VANGL planar cell polarity protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600533 MGI: 2135272 HomoloGene: 62161 GeneCards: VANGL2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • lateral plasma membrane • мембрана • cell-cell junction • клітинна мембрана • cell pole • stress fiber • basolateral plasma membrane • apical plasma membrane • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle • cell periphery Біологічний процес • hair follicle development • dopaminergic neuron axon guidance • cochlea development • planar dichotomous subdivision of terminal units involved in lung branching morphogenesis • non-canonical Wnt signaling pathway • regulation of establishment of planar polarity • lateral sprouting involved in lung morphogenesis • inner ear receptor cell stereocilium organization • regulation of actin cytoskeleton organization • somatic stem cell population maintenance • convergent extension involved in axis elongation • orthogonal dichotomous subdivision of terminal units involved in lung branching morphogenesis • positive regulation of JUN kinase activity • muscular septum morphogenesis • serotonergic neuron axon guidance • establishment of planar polarity • membranous septum morphogenesis • somatic stem cell division • planar cell polarity pathway involved in heart morphogenesis • heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process • Загоєння ран • glomerulus development • establishment of body hair planar orientation • planar cell polarity pathway involved in axis elongation • establishment of planar polarity involved in neural tube closure • planar cell polarity pathway involved in neural tube closure • multicellular organism development • heart looping • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • regulation of Wnt signaling pathway • neural tube closure • inner ear receptor cell development • cochlea morphogenesis • apical protein localization • Rho protein signal transduction • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • kidney morphogenesis • cell migration involved in kidney development • post-anal tail morphogenesis • convergent extension involved in neural plate elongation • convergent extension involved in organogenesis • anterior/posterior pattern specification • digestive tract morphogenesis • planar cell polarity pathway involved in axon guidance • non-motile cilium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57216	93840
Ensembl	ENSG00000162738	ENSMUSG00000026556
UniProt	Q9ULK5	Q91ZD4
RefSeq (мРНК)	NM_020335	NM_033509
RefSeq (білок)	NP_065068	NP_277044
Локус (UCSC)	Хр. 1: 160.4 – 160.43 Mb	Хр. 1: 171.83 – 171.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VANGL2 (англ. VANGL planar cell polarity protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 521 амінокислот, а молекулярна маса — 59 714.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDTESQYSGY		SYKSGHSRSS		RKHRDRRDRH		RSKSRDGGRG		DKSVTIQAPG
EPLLDNESTR		GDERDDNWGE		TTTVVTGTSE		HSISHDDLTR		IAKDMEDSVP
LDCSRHLGVA		AGATLALLSF		LTPLAFLLLP		PLLWREELEP		CGTACEGLFI
SVAFKLLILL		LGSWALFFRR		PKASLPRVFV		LRALLMVLVF		LLVVSYWLFY
GVRILDARER		SYQGVVQFAV		SLVDALLFVH		YLAVVLLELR		QLQPQFTLKV
VRSTDGASRF		YNVGHLSIQR		VAVWILEKYY		HDFPVYNPAL		LNLPKSVLAK
KVSGFKVYSL		GEENSTNNST		GQSRAVIAAA		ARRRDNSHNE		YYYEEAEHER
RVRKRRARLV		VAVEEAFTHI		KRLQEEEQKN		PREVMDPREA		AQAIFASMAR
AMQKYLRTTK		QQPYHTMESI		LQHLEFCITH		DMTPKAFLER		YLAAGPTIQY
HKERWLAKQW		TLVSEEPVTN		GLKDGIVFLL		KRQDFSLVVS		TKKVPFFKLS
EEFVDPKSHK		FVMRLQSETS		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1