VAT1

VAT1
Ідентифікатори
Символи	VAT1, VATI, vesicle amine transport 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604631 MGI: 1349450 HomoloGene: 36200 GeneCards: VAT1
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • zinc ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мітохондріальна зовнішня мембрана • екзосома • мембрана • мітохондрія • extracellular region • azurophil granule lumen Біологічний процес • negative regulation of mitochondrial fusion • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10493	26949
Ensembl	ENSG00000108828	ENSMUSG00000034993
UniProt	Q99536	Q62465
RefSeq (мРНК)	NM_006373	NM_012037
RefSeq (білок)	NP_006364 NP_006364.2	NP_036167
Локус (UCSC)	Хр. 17: 43.01 – 43.03 Mb	Хр. 11: 101.35 – 101.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VAT1 (англ. Vesicle amine transport 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 41 920.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDEREVAEA		ATGEDASSPP		PKTEAASDPQ		HPAASEGAAA		AAASPPLLRC
LVLTGFGGYD		KVKLQSRPAA		PPAPGPGQLT		LRLRACGLNF		ADLMARQGLY
DRLPPLPVTP		GMEGAGVVIA		VGEGVSDRKA		GDRVMVLNRS		GMWQEEVTVP
SVQTFLIPEA		MTFEEAAALL		VNYITAYMVL		FDFGNLQPGH		SVLVHMAAGG
VGMAAVQLCR		TVENVTVFGT		ASASKHEALK		ENGVTHPIDY		HTTDYVDEIK
KISPKGVDIV		MDPLGGSDTA		KGYNLLKPMG		KVVTYGMANL		LTGPKRNLMA
LARTWWNQFS		VTALQLLQAN		RAVCGFHLGY		LDGEVELVSG		VVARLLALYN
QGHIKPHIDS		VWPFEKVADA		MKQMQEKKNV		GKVLLVPGPE		KEN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Eura Y., Ishihara N., Oka T., Mihara K. (2006). Identification of a novel protein that regulates mitochondrial fusion by modulating mitofusin (Mfn) protein function. J. Cell Sci. 119: 4913—4925. PMID 17105775 DOI:10.1242/jcs.03253
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Mertsch S., Becker M., Lichota A., Paulus W., Senner V. (2009). Vesicle amine transport protein-1 (VAT-1) is upregulated in glioblastomas and promotes migration. Neuropathol. Appl. Neurobiol. 35: 342—352. PMID 19508442 DOI:10.1111/j.1365-2990.2009.00993.x

Див. також

• Хромосома 17