VIT

VIT
Ідентифікатори
Символи	VIT, vitrin, VIT1
Зовнішні ІД	OMIM: 617693 MGI: 1921449 HomoloGene: 24942 GeneCards: VIT
Онтологія гена Молекулярна функція • glycosaminoglycan binding Клітинна компонента • extracellular region • interstitial matrix • collagen-containing extracellular matrix • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір Біологічний процес • extracellular matrix organization • positive regulation of cell-substrate adhesion • spinal cord development • growth plate cartilage chondrocyte morphogenesis • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5212	74199
Ensembl	ENSG00000205221	ENSMUSG00000024076
UniProt	Q6UXI7	Q8VHI5
RefSeq (мРНК)	NM_001177969 NM_001177970 NM_001177971 NM_001177972 NM_053276 NM_001328661 NM_001391966 NM_001391967 NM_001391968 NM_001391969 NM_001391970	NM_001197028 NM_028813
RefSeq (білок)	NP_001171440 NP_001171441 NP_001171442 NP_001171443 NP_001315590 NP_444506	NP_001183957 NP_083089
Локус (UCSC)	Хр. 2: 36.7 – 36.81 Mb	Хр. 17: 78.82 – 78.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VIT (англ. Vitrin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 678 амінокислот, а молекулярна маса — 73 930.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTVVLTMKA		SVIEMFLVLL		VTGVHSNKET		AKKIKRPKFT		VPQINCDVKA
GKIIDPEFIV		KCPAGCQDPK		YHVYGTDVYA		SYSSVCGAAV		HSGVLDNSGG
KILVRKVAGQ		SGYKGSYSNG		VQSLSLPRWR		ESFIVLESKP		KKGVTYPSAL
TYSSSKSPAA		QAGETTKAYQ		RPPIPGTTAQ		PVTLMQLLAV		TVAVATPTTL
PRPSPSAAST		TSIPRPQSVG		HRSQEMDLWS		TATYTSSQNR		PRADPGIQRQ
DPSGAAFQKP		VGADVSLGLV		PKEELSTQSL		EPVSLGDPNC		KIDLSFLIDG
STSIGKRRFR		IQKQLLADVA		QALDIGPAGP		LMGVVQYGDN		PATHFNLKTH
TNSRDLKTAI		EKITQRGGLS		NVGRAISFVT		KNFFSKANGN		RSGAPNVVVV
MVDGWPTDKV		EEASRLARES		GINIFFITIE		GAAENEKQYV		VEPNFANKAV
CRTNGFYSLH		VQSWFGLHKT		LQPLVKRVCD		TDRLACSKTC		LNSADIGFVI
DGSSSVGTGN		FRTVLQFVTN		LTKEFEISDT		DTRIGAVQYT		YEQRLEFGFD
KYSSKPDILN		AIKRVGYWSG		GTSTGAAINF		ALEQLFKKSK		PNKRKLMILI
TDGRSYDDVR		IPAMAAHLKG		VITYAIGVAW		AAQEELEVIA		THPARDHSFF
VDEFDNLHQY		VPRIIQNICT		EFNSQPRN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2