VMP1

VMP1
Ідентифікатори
Символи	VMP1, EPG3, TANGO5, TMEM49, vacuole membrane protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611753 MGI: 1923159 HomoloGene: 23686 GeneCards: VMP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • vacuolar membrane • integral component of membrane • вакуоля • клітинна мембрана • autophagosome membrane • ядерце • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • phagophore assembly site • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane Біологічний процес • автофагія • адгезія клітин • Golgi organization • embryo implantation • endoplasmic reticulum organization • екзоцитоз • cell junction assembly • cell-cell adhesion • autophagosome assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81671	75909
Ensembl	ENSG00000062716	ENSMUSG00000018171
UniProt	Q96GC9	Q99KU0
RefSeq (мРНК)	NM_001329394 NM_001329395 NM_001329396 NM_001329397 NM_001329398 NM_001329399 NM_001329400 NM_001329401 NM_001329402 NM_030938	NM_029478 NM_001356531 NM_001379040 NM_001379041
RefSeq (білок)	NP_001316323 NP_001316324 NP_001316325 NP_001316326 NP_001316327 NP_001316328 NP_001316329 NP_001316330 NP_001316331 NP_112200	NP_083754 NP_001343460 NP_001365969 NP_001365970
Локус (UCSC)	Хр. 17: 59.71 – 59.84 Mb	Хр. 11: 86.47 – 86.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VMP1 (англ. Vacuole membrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 46 238.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAENGKNCDQ		RRVAMNKEHH		NGNFTDPSSV		NEKKRREREE		RQNIVLWRQP
LITLQYFSLE		ILVILKEWTS		KLWHRQSIVV		SFLLLLAVLI		ATYYVEGVHQ
QYVQRIEKQF		LLYAYWIGLG		ILSSVGLGTG		LHTFLLYLGP		HIASVTLAAY
ECNSVNFPEP		PYPDQIICPD		EEGTEGTISL		WSIISKVRIE		ACMWGIGTAI
GELPPYFMAR		AARLSGAEPD		DEEYQEFEEM		LEHAESAQDF		ASRAKLAVQK
LVQKVGFFGI		LACASIPNPL		FDLAGITCGH		FLVPFWTFFG		ATLIGKAIIK
MHIQKIFVII		TFSKHIVEQM		VAFIGAVPGI		GPSLQKPFQE		YLEAQRQKLH
HKSEMGTPQG		ENWLSWMFEK		LVVVMVCYFI		LSIINSMAQS		YAKRIQQRLN
SEEKTK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17