VPS26A

VPS26A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FAU
Ідентифікатори
Символи	VPS26A, HB58, Hbeta58, PEP8A, VPS26, VPS26 retromer complex component A, VPS26, retromer complex component A
Зовнішні ІД	OMIM: 605506 MGI: 1353654 HomoloGene: 68420 GeneCards: VPS26A
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • tubular endosome • retromer complex • везикула • ендосома • early endosome • мембрана • лізосома • endosome membrane • retromer, cargo-selective complex • гіалоплазма Біологічний процес • protein transport • retrograde transport, endosome to Golgi • regulation of macroautophagy • intracellular protein transport • Wnt signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9559	30930
Ensembl	ENSG00000122958	ENSMUSG00000020078
UniProt	O75436	P40336
RefSeq (мРНК)	NM_001035260 NM_004896 NM_001318944 NM_001318945 NM_001318946	NM_001113355 NM_133672 NM_001358543
RefSeq (білок)	NP_001030337 NP_001305873 NP_001305874 NP_001305875 NP_004887	NP_001106826 NP_598433 NP_001345472
Локус (UCSC)	Хр. 10: 69.12 – 69.17 Mb	Хр. 10: 62.29 – 62.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS26A (англ. VPS26, retromer complex component A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 327 амінокислот, а молекулярна маса — 38 170.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFLGGFFGP		ICEIDIVLND		GETRKMAEMK		TEDGKVEKHY		LFYDGESVSG
KVNLAFKQPG		KRLEHQGIRI		EFVGQIELFN		DKSNTHEFVN		LVKELALPGE
LTQSRSYDFE		FMQVEKPYES		YIGANVRLRY		FLKVTIVRRL		TDLVKEYDLI
VHQLATYPDV		NNSIKMEVGI		EDCLHIEFEY		NKSKYHLKDV		IVGKIYFLLV
RIKIQHMELQ		LIKKEITGIG		PSTTTETETI		AKYEIMDGAP		VKGESIPIRL
FLAGYDPTPT		MRDVNKKFSV		RYFLNLVLVD		EEDRRYFKQQ		EIILWRKAPE
KLRKQRTNFH		QRFESPESQA		SAEQPEM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Seaman M.N.J. (2004). Cargo-selective endosomal sorting for retrieval to the Golgi requires retromer. J. Cell Biol. 165: 111—122. PMID 15078902 DOI:10.1083/jcb.200312034
• Arighi C.N., Hartnell L.M., Aguilar R.C., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2004). Role of the mammalian retromer in sorting of the cation-independent mannose 6-phosphate receptor. J. Cell Biol. 165: 123—133. PMID 15078903 DOI:10.1083/jcb.200312055
• Gullapalli A., Wolfe B.L., Griffin C.T., Magnuson T., Trejo J. (2006). An essential role for SNX1 in lysosomal sorting of protease-activated receptor-1: evidence for retromer-, Hrs-, and Tsg101-independent functions of sorting nexins. Mol. Biol. Cell. 17: 1228—1238. PMID 16407403 DOI:10.1091/mbc.E05-09-0899
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Gokool S., Tattersall D., Seaman M.N. (2007). EHD1 interacts with retromer to stabilize SNX1 tubules and facilitate endosome-to-Golgi retrieval. Traffic. 8: 1873—1886. PMID 17868075 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00652.x

Див. також

• Хромосома 10