VPS28

VPS28
Ідентифікатори
Символи	VPS28, ESCRT-I subunit, VPS28 subunit of ESCRT-I
Зовнішні ІД	OMIM: 611952 MGI: 1914164 HomoloGene: 69205 GeneCards: VPS28
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0032403 protein-containing complex binding • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • мембрана • late endosome membrane • клітинна мембрана • early endosome • endosome membrane • екзосома • ESCRT I complex • host cell Біологічний процес • GO:0046795 intracellular transport of virus • positive regulation of ubiquitin-dependent endocytosis • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • viral budding via host ESCRT complex • GO:0019067 viral life cycle • multivesicular body assembly • endosomal transport • negative regulation of protein ubiquitination • protein transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • macroautophagy • GO:0015915 транспорт • endosome transport via multivesicular body sorting pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51160	66914
Ensembl	ENSG00000160948 ENSG00000285339	ENSMUSG00000115987
UniProt	Q9UK41 Q548N1	Q9D1C8
RefSeq (мРНК)	NM_016208 NM_183057	NM_025842 NM_001305668
RefSeq (білок)	NP_057292 NP_898880 NP_057292.1	NP_001292597 NP_080118
Локус (UCSC)	Хр. 8: 144.42 – 144.43 Mb	Хр. 15: 76.51 – 76.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS28 (англ. VPS28, ESCRT-I subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 25 425.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFHGIPATPG		IGAPGNKPEL		YEEVKLYKNA		REREKYDNMA		ELFAVVKTMQ
ALEKAYIKDC		VSPSEYTAAC		SRLLVQYKAA		FRQVQGSEIS		SIDEFCRKFR
LDCPLAMERI		KEDRPITIKD		DKGNLNRCIA		DVVSLFITVM		DKLRLEIRAM
DEIQPDLREL		METMHRMSHL		PPDFEGRQTV		SQWLQTLSGM		SASDELDDSQ
VRQMLFDLES		AYNAFNRFLH		A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bishop N., Horman A., Woodman P. (2002). Mammalian class E vps proteins recognize ubiquitin and act in the removal of endosomal protein-ubiquitin conjugates. J. Cell Biol. 157: 91—101. PMID 11916981 DOI:10.1083/jcb.200112080
• Im Y.J., Hurley J.H. (2008). Integrated structural model and membrane targeting mechanism of the human ESCRT-II complex. Dev. Cell. 14: 902—913. PMID 18539118 DOI:10.1016/j.devcel.2008.04.004

Див. також

• Хромосома 8