VPS29

VPS29
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1W24, 2R17
Ідентифікатори
Символи	VPS29, DC15, PEP11, DC7, VPS29 retromer complex component, retromer complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 606932 MGI: 1928344 HomoloGene: 9433 GeneCards: VPS29
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding Клітинна компонента • late endosome • early endosome • endosome membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • цитоплазма • гіалоплазма • retromer complex • retromer, cargo-selective complex • ендосома Біологічний процес • protein transport • Wnt signaling pathway • regulation of autophagy • intracellular protein transport • retrograde transport, endosome to Golgi • GO:0022415 viral process • endocytic recycling Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51699	56433
Ensembl	ENSG00000111237	ENSMUSG00000029462
UniProt	Q9UBQ0 Q05DG7	Q9QZ88
RefSeq (мРНК)	NM_001282150 NM_001282151 NM_016226 NM_057180	NM_019780 NM_001347453 NM_001359226
RefSeq (білок)	NP_001269079 NP_001269080 NP_057310 NP_476528	NP_001334382 NP_062754 NP_001346155
Локус (UCSC)	Хр. 12: 110.49 – 110.5 Mb	Хр. 5: 122.49 – 122.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS29 (англ. VPS29, retromer complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 182 амінокислот, а молекулярна маса — 20 506.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLVLVLGDLH		IPHRCNSLPA		KFKKLLVPGK		IQHILCTGNL		CTKESYDYLK
TLAGDVHIVR		GDFDENLNYP		EQKVVTVGQF		KIGLIHGHQV		IPWGDMASLA
LLQRQFDVDI		LISGHTHKFE		AFEHENKFYI		NPGSATGAYN		ALETNIIPSF
VLMDIQASTV		VTYVYQLIGD		DVKVERIEYK		KP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• Edgar A.J., Polak J.M. (2000). Human homologues of yeast vacuolar protein sorting 29 and 35. Biochem. Biophys. Res. Commun. 277: 622—630. PMID 11062004 DOI:10.1006/bbrc.2000.3727
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Damen E., Krieger E., Nielsen J.E., Eygensteyn J., van Leeuwen J.E.M. (2006). The human Vps29 retromer component is a metallo-phosphoesterase for a cation-independent mannose 6-phosphate receptor substrate peptide. Biochem. J. 398: 399—409. PMID 16737443 DOI:10.1042/BJ20060033

Див. також

• Хромосома 12