VPS39

VPS39
Ідентифікатори
Символи	VPS39, TLP, VAM6, hVam6p, HOPS complex subunit, VPS39 subunit of HOPS complex
Зовнішні ІД	OMIM: 612188 MGI: 2443189 HomoloGene: 41025 GeneCards: VPS39
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23339	269338
Ensembl	ENSG00000166887	ENSMUSG00000027291
UniProt	Q96JC1	Q8R5L3
RefSeq (мРНК)	NM_001301138 NM_015289	NM_147153 NM_178851 NM_001363053 NM_001363054
RefSeq (білок)	NP_001288067 NP_056104	NP_671495 NP_849182 NP_001349982 NP_001349983
Локус (UCSC)	Хр. 15: 42.16 – 42.21 Mb	Хр. 2: 120.15 – 120.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS39 (англ. VPS39, HOPS complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 886 амінокислот, а молекулярна маса — 101 809.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHDAFEPVPI		LEKLPLQIDC		LAAWEEWLLV		GTKQGHLLLY		RIRKDVVPAD
VASPESGSCN		RFEVTLEKSN		KNFSKKIQQI		HVVSQFKILV		SLLENNIYVH
DLLTFQQITT		VSKAKGASLF		TCDLQHTETG		EEVLRMCVAV		KKKLQLYFWK
DREFHELQGD		FSVPDVPKSM		AWCENSICVG		FKRDYYLIRV		DGKGSIKELF
PTGKQLEPLV		APLADGKVAV		GQDDLTVVLN		EEGICTQKCA		LNWTDIPVAM
EHQPPYIIAV		LPRYVEIRTF		EPRLLVQSIE		LQRPRFITSG		GSNIIYVASN
HFVWRLIPVP		MATQIQQLLQ		DKQFELALQL		AEMKDDSDSE		KQQQIHHIKN
LYAFNLFCQK		RFDESMQVFA		KLGTDPTHVM		GLYPDLLPTD		YRKQLQYPNP
LPVLSGAELE		KAHLALIDYL		TQKRSQLVKK		LNDSDHQSST		SPLMEGTPTI
KSKKKLLQII		DTTLLKCYLH		TNVALVAPLL		RLENNHCHIE		ESEHVLKKAH
KYSELIILYE		KKGLHEKALQ		VLVDQSKKAN		SPLKGHERTV		QYLQHLGTEN
LHLIFSYSVW		VLRDFPEDGL		KIFTEDLPEV		ESLPRDRVLG		FLIENFKGLA
IPYLEHIIHV		WEETGSRFHN		CLIQLYCEKV		QGLMKEYLLS		FPAGKTPVPA
GEEEGELGEY		RQKLLMFLEI		SSYYDPGRLI		CDFPFDGLLE		ERALLLGRMG
KHEQALFIYV		HILKDTRMAE		EYCHKHYDRN		KDGNKDVYLS		LLRMYLSPPS
IHCLGPIKLE		LLEPKANLQA		ALQVLELHHS		KLDTTKALNL		LPANTQINDI
RIFLEKVLEE		NAQKKRFNQV		LKNLLHAEFL		RVQEERILHQ		QVKCIITEEK
VCMVCKKKIG		NSAFARYPNG		VVVHYFCSKE		VNPADT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• Caplan S., Hartnell L.M., Aguilar R.C., Naslavsky N., Bonifacino J.S. (2001). Human Vam6p promotes lysosome clustering and fusion in vivo. J. Cell Biol. 154: 109—122. PMID 11448994 DOI:10.1083/jcb.200102142
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Solinger J.A., Spang A. (2013). Tethering complexes in the endocytic pathway: CORVET and HOPS. FEBS J. 280: 2743—2757. PMID 23351085 DOI:10.1111/febs.12151
• Pols M.S., ten Brink C., Gosavi P., Oorschot V., Klumperman J. (2013). The HOPS proteins hVps41 and hVps39 are required for homotypic and heterotypic late endosome fusion. Traffic. 14: 219—232. PMID 23167963 DOI:10.1111/tra.12027
• Wartosch L., Guenesdogan U., Graham S.C., Luzio J.P. (2015). Recruitment of VPS33A to HOPS by VPS16 Is Required for Lysosome Fusion with Endosomes and Autophagosomes. Traffic. 16: 727—742. PMID 25783203 DOI:10.1111/tra.12283

Див. також

• Хромосома 15