VPS52

VPS52
Ідентифікатори
Символи	VPS52, ARE1, SAC2, SACM2L, dJ1033B10.5, GARP complex subunit, VPS52 subunit of GARP complex
Зовнішні ІД	OMIM: 603443 MGI: 1330304 HomoloGene: 5756 GeneCards: VPS52
Онтологія гена Молекулярна функція • syntaxin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • recycling endosome • EARP complex • ендосома • комплекс Ґольджі • endosome membrane • мембрана • trans-Golgi network membrane • GARP complex • гіалоплазма Біологічний процес • protein transport • ectodermal cell differentiation • embryonic ectodermal digestive tract development • endocytic recycling • lysosomal transport • Golgi to vacuole transport • retrograde transport, endosome to Golgi Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6293	224705
Ensembl	ENSG00000236014 ENSG00000206286 ENSG00000223501 ENSG00000224455 ENSG00000225590 ENSG00000223618 ENSG00000228425	ENSMUSG00000024319
UniProt	Q8N1B4	Q8C754
RefSeq (мРНК)	NM_001289174 NM_001289175 NM_001289176 NM_022553	NM_172620 NM_001357329 NM_001357330 NM_001379410 NM_001379411
RefSeq (білок)	NP_001276103 NP_001276104 NP_001276105 NP_072047	NP_766208 NP_001344258 NP_001344259 NP_001366339 NP_001366340
Локус (UCSC)	Хр. 6: 33.25 – 33.27 Mb	Хр. 17: 34.17 – 34.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS52 (англ. VPS52, GARP complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 723 амінокислот, а молекулярна маса — 82 221.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAATMAAA		ARELVLRAGT		SDMEEEEGPL		AGGPGLQEPL		QLGELDITSD
EFILDEVDVH		IQANLEDELV		KEALKTGVDL		RHYSKQVELE		LQQIEQKSIR
DYIQESENIA		SLHNQITACD		AVLERMEQML		GAFQSDLSSI		SSEIRTLQEQ
SGAMNIRLRN		RQAVRGKLGE		LVDGLVVPSA		LVTAILEAPV		TEPRFLEQLQ
ELDAKAAAVR		EQEARGTAAC		ADVRGVLDRL		RVKAVTKIRE		FILQKIYSFR
KPMTNYQIPQ		TALLKYRFFY		QFLLGNERAT		AKEIRDEYVE		TLSKIYLSYY
RSYLGRLMKV		QYEEVAEKDD		LMGVEDTAKK		GFFSKPSLRS		RNTIFTLGTR
GSVISPTELE		APILVPHTAQ		RGEQRYPFEA		LFRSQHYALL		DNSCREYLFI
CEFFVVSGPA		AHDLFHAVMG		RTLSMTLKHL		DSYLADCYDA		IAVFLCIHIV
LRFRNIAAKR		DVPALDRYWE		QVLALLWPRF		ELILEMNVQS		VRSTDPQRLG
GLDTRPHYIT		RRYAEFSSAL		VSINQTIPNE		RTMQLLGQLQ		VEVENFVLRV
AAEFSSRKEQ		LVFLINNYDM		MLGVLMERAA		DDSKEVESFQ		QLLNARTQEF
IEELLSPPFG		GLVAFVKEAE		ALIERGQAER		LRGEEARVTQ		LIRGFGSSWK
SSVESLSQDV		MRSFTNFRNG		TSIIQGALTQ		LIQLYHRFHR		VLSQPQLRAL
PARAELINIH		HLMVELKKHK		PNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Perez-Victoria F.J., Mardones G.A., Bonifacino J.S. (2008). Requirement of the human GARP complex for mannose 6-phosphate-receptor-dependent sorting of cathepsin D to lysosomes. Mol. Biol. Cell. 19: 2350—2362. PMID 18367545 DOI:10.1091/mbc.E07-11-1189
• Schindler C., Chen Y., Pu J., Guo X., Bonifacino J.S. (2015). EARP is a multisubunit tethering complex involved in endocytic recycling. Nat. Cell Biol. 17: 639—650. PMID 25799061 DOI:10.1038/ncb3129

Див. також

• Хромосома 6