WASF1

WASF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3P8C, 4N78
Ідентифікатори
Символи	WASF1, SCAR1, WAVE, WAVE1, WAS protein family member 1, WASP family member 1, NEDALVS
Зовнішні ІД	OMIM: 605035 MGI: 1890563 HomoloGene: 2920 GeneCards: WASF1
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase A binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондріальна зовнішня мембрана • міжклітинні контакти • синапс • цитоскелет • мітохондрія • SCAR complex • lamellipodium • focal adhesion • actin cytoskeleton • GO:0009327 protein-containing complex • dendrite cytoplasm • postsynapse Біологічний процес • actin filament polymerization • Rac protein signal transduction • positive regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation • lamellipodium morphogenesis • actin cytoskeleton organization • neuron projection development • positive regulation of neurotrophin TRK receptor signaling pathway • dendrite extension • рецептор-опосередкований ендоцитоз • cellular response to brain-derived neurotrophic factor stimulus • GO:0034622 protein-containing complex assembly • modification of postsynaptic actin cytoskeleton • dendritic transport of mitochondrion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8936	83767
Ensembl	ENSG00000112290	ENSMUSG00000019831
UniProt	Q92558	Q8R5H6
RefSeq (мРНК)	NM_001024934 NM_001024935 NM_001024936 NM_003931	NM_031877 NM_001379453 NM_001379454
RefSeq (білок)	NP_001020105 NP_001020106 NP_001020107 NP_003922	NP_114083 NP_001366382 NP_001366383
Локус (UCSC)	Хр. 6: 110.1 – 110.18 Mb	Хр. 10: 40.76 – 40.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WASF1 (англ. WAS protein family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 559 амінокислот, а молекулярна маса — 61 652.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPLVKRNIDP		RHLCHTALPR		GIKNELECVT		NISLANIIRQ		LSSLSKYAED
IFGELFNEAH		SFSFRVNSLQ		ERVDRLSVSV		TQLDPKEEEL		SLQDITMRKA
FRSSTIQDQQ		LFDRKTLPIP		LQETYDVCEQ		PPPLNILTPY		RDDGKEGLKF
YTNPSYFFDL		WKEKMLQDTE		DKRKEKRKQK		QKNLDRPHEP		EKVPRAPHDR
RREWQKLAQG		PELAEDDANL		LHKHIEVANG		PASHFETRPQ		TYVDHMDGSY
SLSALPFSQM		SELLTRAEER		VLVRPHEPPP		PPPMHGAGDA		KPIPTCISSA
TGLIENRPQS		PATGRTPVFV		SPTPPPPPPP		LPSALSTSSL		RASMTSTPPP
PVPPPPPPPA		TALQAPAVPP		PPAPLQIAPG		VLHPAPPPIA		PPLVQPSPPV
ARAAPVCETV		PVHPLPQGEV		QGLPPPPPPP		PLPPPGIRPS		SPVTVTALAH
PPSGLHPTPS		TAPGPHVPLM		PPSPPSQVIP		ASEPKRHPST		LPVISDARSV
LLEAIRKGIQ		LRKVEEQREQ		EAKHERIEND		VATILSRRIA		VEYSDSEDDS
EFDEVDWLE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Bear J.E., Rawls J.F., Saxe C.L. III (1998). SCAR, a WASP-related protein, isolated as a suppressor of receptor defects in late Dictyostelium development. J. Cell Biol. 142: 1325—1335. PMID 9732292 DOI:10.1083/jcb.142.5.1325
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Machesky L.M., Insall R.H. (1998). Scar1 and the related Wiskott-Aldrich syndrome protein, WASP, regulate the actin cytoskeleton through the Arp2/3 complex. Curr. Biol. 8: 1347—1356. PMID 9889097 DOI:10.1016/S0960-9822(98)00015-3
• Miki H., Yamaguchi H., Suetsugu S., Takenawa T. (2000). IRSp53 is an essential intermediate between Rac and WAVE in the regulation of membrane ruffling. Nature. 408: 732—735. PMID 11130076 DOI:10.1038/35047107

Див. також

• Хромосома 6