WASHC2C

WASHC2C
Ідентифікатори
Символи	WASHC2C, FAM21A, VPEF, FAM21C, family with sequence similarity 21 member C, WASH complex subunit 2C
Зовнішні ІД	OMIM: 613631 MGI: 106463 HomoloGene: 41686 GeneCards: WASHC2C
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-4-phosphate binding • phosphatidylinositol-5-phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • lipid binding • retromer complex binding Клітинна компонента • early endosome membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • клітинна мембрана • retromer complex • early endosome • ядерце • ендосома • WASH complex • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of barbed-end actin filament capping • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • protein localization to endosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	253725	28006
Ensembl	ENSG00000172661	ENSMUSG00000024104
UniProt	Q9Y4E1	Q6PGL7
RefSeq (мРНК)	NM_001169106 NM_001169107 NM_015262 NM_001330074	NM_026585
RefSeq (білок)	NP_001162577 NP_001162578 NP_001317003 NP_056077 NP_001354322 NP_001354323 NP_001354324 NP_001354325 NP_001354326 NP_001354327 NP_001354328 NP_001354329 NP_001354330 NP_001354331 NP_001354332 NP_001354333 NP_001354334 NP_001354335 NP_001354336 NP_001354337 NP_001354338 NP_001354339 NP_001354340 NP_001354341 NP_001354342 NP_001354343 NP_001354344 NP_001354345	NP_080861
Локус (UCSC)	Хр. 10: 45.73 – 45.79 Mb	Хр. 6: 116.18 – 116.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WASHC2C (англ. WASH complex subunit 2C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 318 амінокислот, а молекулярна маса — 144 668.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMNRTTPDQE		LVPASEPVWE		RPWSVEEIRR		SSQSWSLAAD		AGLLQFLQEF
SQQTISRTHE		IKKQVDGLIR		ETKATDCRLH		NVFNDFLMLS		NTQFIENRVY
DEEVEEPVLK		AEAEKTEQEK		TREQKEVDLI		PKVQEAVNYG		LQVLDSAFEQ
LDIKAGNSDS		EEDDANGRVE		LILEPKDLYI		DRPLPYLIGS		KLFMEQEDVG
LGELSSEEGS		VGSDRGSIVD		TEEEKEEEES		DEDFAHHSDN		EQNQHTTQMS
DEEEDDDGCD		LFADSEKEEE		DIEDIEENTR		PKRSRPTSFA		DELAARIKGD
AMGRVDEEPT		TLPSGEAKPR		KTLKEKKERR		TPSDDEEDNL		FAPPKLTDED
FSPFGSGGGL		FSGGKGLFDD		EDEESDLFTE		ASQDRQAGAS		VKEESSSSKP
GKKIPAGAVS		VFLGDTDVFG		AASVPSLKEP		QKPEQPTPRK		SPYGPPPTGL
FDDDDGDDDD		DFFSAPHSKP		SKTRKVQSTA		DIFGDEEGDL		FKEKAVASPE
ATVSQTDENK		ARAEKKVTLS		YSKNLKPSSE		TKTQKGLFSD		EEDSEDLFSS
QSASNLKGAS		LLPGKLPTSV		SLFDDEDEED		NLFGGTAAKK		QTLSLQAQRE
EKAKASELSK		KKASALLFSS		DEEWNIPASQ		THLASDSRSK		GEPRDSGTLQ
SQEAKAVKKT		SLFEEDKEDD		LFAIAKDSQK		KTQRVSLLFE		DDVDSGGSLF
GSPPTSVPPA		TKKKETVSEA		PPLLFSDEEE		KEAQLGVKSV		DKKVESAKES
LKFGRTDVAE		SEKEGLLTRS		AQETVKHSDL		FSSSSPWDKG		TKPRTKTVLS
LFDEEEDKME		DQNIIQAPQK		EVGKGCDPDA		HPKSTGVFQD		EELLFSHKLQ
KDNDPDVDLF		AGTKKTKLLE		PSVGSLFGDD		EDDDLFSSAK		SQPLVQEKKR
VVKKDHSVNS		FKNQKHPESI		QGSKEKGIWK		PETPQANLAI		NPAALLPTAA
SQISEVKPVL		PELAFPSSEH		RRSHGLESVP		VLPGSGEAGV		SFDLPAQADT
LHSANKSRVK		MRGKRRPQTR		AARRLAAQES		SEAEDMSVPR		GPIAQWADGA
ISPNGHRPQL		RAASGEDSTE		EALAAAAAPW		EGGPVPGVDT		SPFAKSLGHS
RGEADLFDSG		DIFSTGTGSQ		SVERTKPKAK		IAENPANPPV		GGKAKSPMFP
ALGEASSDDD		LFQSAKPKPA		KKTNPFPLLE		DEDDLFTDQK		VKKNETKSSS
QQDVILTTQD		IFEDDIFATE		AIKPSQKTRE		KEKTLESNLF		DDNIDIFADL
TVKPKEKSKK		KVEAKSIFDD		DMDDIFSTGI		QAKTTKPKSR		SAQAAPEPRF
EHKVSNIFDD		PLNAFGGQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gomez T.S., Billadeau D.D. (2009). A FAM21-containing WASH complex regulates retromer-dependent sorting. Dev. Cell. 17: 699—711. PMID 19922874 DOI:10.1016/j.devcel.2009.09.009
• Harbour M.E., Breusegem S.Y., Seaman M.N. (2012). Recruitment of the endosomal WASH complex is mediated by the extended 'tail' of Fam21 binding to the retromer protein Vps35. Biochem. J. 442: 209—220. PMID 22070227 DOI:10.1042/BJ20111761
• Jia D., Gomez T.S., Billadeau D.D., Rosen M.K. (2012). Multiple repeat elements within the FAM21 tail link the WASH actin regulatory complex to the retromer. Mol. Biol. Cell. 23: 2352—2361. PMID 22513087 DOI:10.1091/mbc.E11-12-1059

Див. також

• Хромосома 10