WDR35

WDR35
Ідентифікатори
Символи	WDR35, CED2, IFT121, IFTA1, SRTD7, WD repeat domain 35, FAP118
Зовнішні ІД	OMIM: 613602 MGI: 1921932 HomoloGene: 10814 GeneCards: WDR35
Пов'язані генетичні захворювання
Sensenbrenner syndrome, short-rib thoracic dysplasia 7 with or without polydactyly, Verma-Naumoff syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • ciliary basal body • GO:0035085 Аксонема • центросома • ciliary tip • cell projection • цитоскелет • intraciliary transport particle A • центр організації мікротрубочок • війка Біологічний процес • intraciliary retrograde transport • cell projection organization • protein localization to cilium • response to toxic substance • negative regulation of gene expression • response to lipopolysaccharide • intraciliary transport involved in cilium assembly • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • negative regulation of nitric oxide biosynthetic process • cilium assembly • cellular response to glucose stimulus • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria • liver regeneration • cellular response to leukemia inhibitory factor • intraciliary transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57539	74682
Ensembl	ENSG00000118965	ENSMUSG00000066643
UniProt	Q9P2L0	Q8BND3
RefSeq (мРНК)	NM_001006657 NM_020779	NM_001159527 NM_172470
RefSeq (білок)	NP_001006658 NP_065830	NP_001152999 NP_766058
Локус (UCSC)	Хр. 2: 19.91 – 19.99 Mb	Хр. 12: 9.02 – 9.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WDR35 (англ. WD repeat domain 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 181 амінокислот, а молекулярна маса — 133 547.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFFYLSKKIS		IPNNVKLQCV		SWNKEQGFIA		CGGEDGLLKV		LKLETQTDDA
KLRGLAAPSN		LSMNQTLEGH		SGSVQVVTWN		EQYQKLTTSD		ENGLIIVWML
YKGSWIEEMI		NNRNKSVVRS		MSWNADGQKI		CIVYEDGAVI		VGSVDGNRIW
GKDLKGIQLS		HVTWSADSKV		LLFGMANGEI		HIYDNQGNFM		IKMKLSCLVN
VTGAISIAGI		HWYHGTEGYV		EPDCPCLAVC		FDNGRCQIMR		HENDQNPVLI
DTGMYVVGIQ		WNHMGSVLAV		AGFQKAAMQD		KDVNIVQFYT		PFGEHLGTLK
VPGKEISALS		WEGGGLKIAL		AVDSFIYFAN		IRPNYKWGYC		SNTVVYAYTR
PDRPEYCVVF		WDTKNNEKYV		KYVKGLISIT		TCGDFCILAT		KADENHPQEE
NEMETFGATF		VLVLCNSIGT		PLDPKYIDIV		PLFVAMTKTH		VIAASKEAFY
TWQYRVAKKL		TALEINQITR		SRKEGRERIY		HVDDTPSGSM		DGVLDYSKTI
QGTRDPICAI		TASDKILIVG		RESGTIQRYS		LPNVGLIQKY		SLNCRAYQLS
LNCNSSRLAI		IDISGVLTFF		DLDARVTDST		GQQVVGELLK		LERRDVWDMK
WAKDNPDLFA		MMEKTRMYVF		RNLDPEEPIQ		TSGYICNFED		LEIKSVLLDE
ILKDPEHPNK		DYLINFEIRS		LRDSRALIEK		VGIKDASQFI		EDNPHPRLWR
LLAEAALQKL		DLYTAEQAFV		RCKDYQGIKF		VKRLGKLLSE		SMKQAEVVGY
FGRFEEAERT		YLEMDRRDLA		IGLRLKLGDW		FRVLQLLKTG		SGDADDSLLE
QANNAIGDYF		ADRQKWLNAV		QYYVQGRNQE		RLAECYYMLE		DYEGLENLAI
SLPENHKLLP		EIAQMFVRVG		MCEQAVTAFL		KCSQPKAAVD		TCVHLNQWNK
AVELAKNHSM		KEIGSLLARY		ASHLLEKNKT		LDAIELYRKA		NYFFDAAKLM
FKIADEEAKK		GSKPLRVKKL		YVLSALLIEQ		YHEQMKNAQR		GKVKGKSSEA
TSALAGLLEE		EVLSTTDRFT		DNAWRGAEAY		HFFILAQRQL		YEGCVDTALK
TALHLKDYED		IIPPVEIYSL		LALCACASRA		FGTCSKAFIK		LKSLETLSSE
QKQQYEDLAL		EIFTKHTSKD		NRKPELDSLM		EGGEGKLPTC		VATGSPITEY
QFWMCSVCKH		GVLAQEISHY		SFCPLCHSPV		G

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cole D.G., Snell W.J. (2009). SnapShot: Intraflagellar transport. Cell. 137: 784—784. PMID 19450523 DOI:10.1016/j.cell.2009.04.053

Див. також

• Хромосома 2