XIRP2

XIRP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4F14
Ідентифікатори
Символи	XIRP2, CMYA3, xin actin binding repeat containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 609778 MGI: 2685198 HomoloGene: 19388 GeneCards: XIRP2
Онтологія гена Молекулярна функція • alpha-actinin binding • actin binding • actin filament binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • Z disc • stress fiber • focal adhesion • filamentous actin Біологічний процес • heart development • cell-cell junction organization • cardiac muscle tissue morphogenesis • ventricular septum development • actin cytoskeleton organization • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	129446	241431
Ensembl	ENSG00000163092	ENSMUSG00000027022
UniProt	A4UGR9	Q4U4S6
RefSeq (мРНК)	NM_152381 NM_001079810 NM_001199143 NM_001199144 NM_001199145	NM_001024618 NM_001083919
RefSeq (білок)	NP_001073278 NP_001186072 NP_001186073 NP_001186074 NP_689594	NP_001019789 NP_001077388
Локус (UCSC)	Хр. 2: 166.89 – 167.26 Mb	Хр. 2: 67 – 67.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

XIRP2 (англ. Xin actin binding repeat containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 374 амінокислот, а молекулярна маса — 382 300.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSPESGHSRI		FEATAGPNKP		ESGFAEDSAA		RGEGVSDLHE		VVSLKERMAR
YQAAVSRGDC		RSFSANMMEE		SEMCAVPGGL		AKVKKQFEDE		ITSSRNTFAQ
YQYQHQNRSE		QEAIHSSQVG		TSRSSQEMAR		NEQEGSKVQK		IDVHGTEMVS
HLEKHTEEVN		QASQFHQYVQ		ETVIDTPEDE		EIPKVSTKLL		KEQFEKSAQE
KILYSDKEMT		TPAKQIKTES		EYEETFKPSS		VVSTSSTSCV		STSQRKETST
TRYSDHSVTS		STLAQINATS		SGMTEEFPPP		PPDVLQTSVD		VTAFSQSPEL
PSPPRRLPVP		KDVYSKQRNL		YELNRLYKHI		HPELRKNLEK		DYISEVSEIV
SSQMNSGSSV		SADVQQARYV		FENTNDSSQK		DLNSEREYLE		WDEILKGEVQ
SIRWIFENQP		LDSINNGSPD		EGDISRGIAD		QEIIAGGDVK		YTTWMFETQP
IDTLGAYSSD		TVENAEKIPE		LARGDVCTAR		WMFETRPLDS		MNKMHQSQEE
SAVTISKDIT		GGDVKTVRYM		FETQHLDQLG		QLHSVDEVHL		LQLRSELKEI
KGNVKRSIKC		FETQPLYVIR		DGSGQMLEIK		TVHREDVEKG		DVRTARWMFE
TQPLDTINKD		ITEIKVVRGI		SMEENVKGGV		SKAKWLFETQ		PLEKIKESEE
VIIEKEKIIG		TDVSRKCWMF		ETQPLDILKE		VPDADSLQRE		EIIGGDVQTT
KHLFETLPIE		ALKDSPDIGK		LQKITASEEE		KGDVRHQKWI		FETQPLEDIR
KDKKEYTRTV		KLEEVDRGDV		KNYTHIFESN		NLIKFDASHK		IEVEGVTRGA
VELNKSLFET		TPLYAIQDPL		GKYHQVKTVQ		QEEIVRGDVR		SCRWLFETRP
IDQFDESIHK		FQIIRGISAQ		EIQTGNVKSA		KWLFETQPLD		SIKYFSDVEE
TESKTEQTRD		IVKGDVKTCK		WLFETQPMES		LYEKVSLMTS		SEEIHKGDVK
TCTWLFETQP		LDTIKDDSET		AVKLQTVKQE		EIQGGDVRTA		CFLFETENLD
SIQGEEVKEI		KPVEMDIQAG		DVSSMRYKFE		NQSLDSISSS		SEEVLKKIKT
LKTEDIQKGN		VLNCRWLFEN		QPIDKIKESQ		EGDECVKTVT		DIQGGDVRKG
CFIFETFSLD		EIKEESDYIS		TKKTITEEVI		QGDVKSYRML		FETQPLYAIQ
DREGSYHEVT		TVKKEEVIHG		DVRGTRWLFE		TKPLDSINKS		ETVYVIKSVT
QEDIQKGDVS		SVRYRFETQP		LDQISEESHN		IMPSIDHIQG		GNVKTSRQFF
ESENFDKNNY		IRTVSVNEIQ		KGNVKTSTWL		FETHTMDELR		GEGLEYENIK
TVTQEDVQKG		DVKQAVWLFE		NRTFDSIMEA		HKGITKMTKE		EIPPSDVKTT
TWLFETTPLH		EFNETRVEKI		EIIGKSIKET		LEDLYSQKVI		QAPGIIIEAD
EIGDVRMAKY		KLMNQASPEI		QKEEIIRADL		RNIMVNLLSK		RDCTEREILI
SEEEKGNVNL		TKTQLLNRST		EFHAEKEEIV		KGDVQQAIKN		LFSEERSVKK
GILIQEDEKG		DINMTIYCLL		HENDGDTIER		EEVIGGDVKR		TIHNLLSSTS
NNKISERAKI		DASERGNVQF		FTTCIEAGAL		DYLKQLHTES		NETLTAKKQE
GEKEIIGGDV		EGTKLLLKKR		QSLVERTVSE		TDIIPGDVHN		TVKVFMTEPQ
STFGKIPKEE		IIKGDLTSTL		NSLSQAVNQK		TVTKTEEIIK		GNMLATLKSL
KESSHRWKES		KQPDAIPGDI		EKAIECLEKA		TNTKTEILKK		ELLKDDLETS
LRSLKEAQRS		FKEVHKEGVI		KKDAKAVMAG		SSGEQKTDIH		QVAVQRNKNS
LLQPKPGPFE		PAAKWQGGAD		TLSQTMGKSC		HGNLVEERTE		VNLPKAPKGT
VKIVIDREQN		NDALEKSLRR		LSNSHHKSNV		LESGDKTGVW		TDTTGEQHLR
DEYMSRQLTS		TVSVKNNLTT		KESDRAVREL		KKDDVFNSIQ		SAGKTVGKQQ
TYELRNDHQK		MEGFHIKSPK		KTKNIKILTD		TQSSKPSPTQ		HPVSMPVGGT
YDLSGDFQKQ		TLLKQETKYS		NKDIKKKNIN		LQPMWQLLPV		EQDTSNVTEM
KVSEKSHNTF		KATNKKRETD		VHLKSQDFLM		KTNTSTGLKM		AMERSLNPIN
FNPENNVKES		ECPLPPPSPP		PPPPSNASSE		IEFPLPPPPP		LMMFPEKNGF
LPSLSTEKIK		AEFESFPGLP		LPPPPVDEKS		ERESSSMFLP		PPPPPTPSQK
PAHLLSSSAP		EKHSGDFMQQ		YSQKEASNSQ		NSQAKIITGK		TGVLPPPTLP
KPKLPKHIKD		NKNDFSPKVE		LATSLSDMEC		KITTSKDQKK		VMVMTSSEHT
ETKQNVISKS		LDERKQLSID		SANCLSHTVP		GTSAPRKKQI		APLIKSHSFP
ESSGQQNPKP		YMRKFKTPLM		IAEEKYRQQK		EEIEKQKQES		SYYNIVKTQS
QNQHITEVEK		EMPLQKTNEE		VSLSGIDSEC		TVVQPSPGSQ		SNARILGVCS
DNQLSTTSPE		TVAAKRLHHV		LAASEDKDKM		KKEVLQSSRD		IMQSKSACEI
KQSHQECSTQ		QTQQKKYLEQ		LHLPQSKPIS		PNFKVKTIKL		PTLDHTLNET
DHSYESHKQQ		SEIDVQTFTK		KQYLKTKKTE		ASTECSHKQS		LAERHYQLPK
KEKRVTVQLP		TESIQKNQED		KLKMVPRKQR		EFSGSDRGKL		PGSEEKNQGP
SMIGRKEERL		ITERKHEHLK		NKSAPKVVKQ		KVIDAHLDSQ		TQNFQQTQIQ
TAESKAEHKK		LPQPYNSLQE		EKCLEVKGIQ		EKQVFSNTKD		SKQEITQNKS
FFSSVKESQR		DDGKGALNIV		EFLRKREELQ		QILSRVKQFE		AEPNKSGLKT
FQTLLNTIPG		WLISEDKREY		AVHIAMENNL		EKVKEEITHI		KTQAEDMLVS
YENIIQTAMM		SSKTGKPGNK		PTSLDETSSK		VSNVHVSNNK		NSEQKENKIA
KEKTVQHQVA		AHHEATVRSH		VKTHQEIKLD		DSNIPPPSLK		TRPPSPTFIT
IESTARRTEN		PTKNELSQSP		KKDSYVEPPP		RRPMSQKSEI		HRANTSPSPP
RSRSEQLVRL		KDTTAKLSKG		AIPCPAATPV		PIVEKRSEII		MSPATLRRQI
KIETRGRDSP		PTITIPVNIN		HAASGSFRES		VDAQEEIRKV		EKRATYVHKD
GLNSTDHMVP		DTESYDAVEI		IRKVAVPPRL		SEHTQRYEAA		NRTVQMAENF
VNDPENEINR		WFREFEHGPV		SEAKSNRRVY		AKGETNHNIQ		QESRTFCKEE
FGLTSLGNTS		FTDFSCKHPR		ELREKIPVKQ		PRICSETRSL		SEHFSGMDAF
ESQIVESKMK		TSSSHSSEAG		KSGCDFKHAP		PTYEDVIAGH		ILDISDSPKE
VRKNFQKTWQ		ESGRVFKGLG		YATADASATE		MRTTFQEESA		FISEAAAPRQ
GNMYTLSKDS		LSNGVPSGRQ		AEFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2