ZBED5

ZBED5
Ідентифікатори
Символи	ZBED5, Buster1, zinc finger BED-type containing 5
Зовнішні ІД	OMIM: 615251 MGI: 1919220 HomoloGene: 84838 GeneCards: ZBED5
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • нуклеоплазма • цитоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	58486	71970
Ensembl	ENSG00000236287	ENSMUSG00000034173
UniProt	Q49AG3	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_021211 NM_001143667	NM_183088 NM_001359408
RefSeq (білок)	NP_001137139 NP_067034	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 11: 10.81 – 10.86 Mb	Хр. 5: 129.92 – 129.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZBED5 (англ. Zinc finger BED-type containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 693 амінокислот, а молекулярна маса — 78 911.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIAPLLCILS		YNFNTFAILN		VYSKLTMFCT		TNSLPMDLLL		KQGSLKQEVE
SFCYQIVSES		NDQKVGILQS		EDKQLQPSVS		KKSEGELSRV		KFISNSNKIT
FSKKPKRRKY		DESYLSFGFT		YFGNRDAPHA		QCVLCKKILS		NSSLAPSKLR
RHLETKHAAY		KDKDISFFKQ		HLDSPENNKP		PTPKIVNTDN		ESATEASYNV
SYHIALSGEA		HTIGELLIKP		CAKDVVMRMF		DEQYSKKIDA		VQLSNSTVAR
RIKDLAADIE		EELVCRLKIC		DGFSLQLDES		ADVSGLAVLL		VFVRYRFNKS
IEEDLLLCES		LQSNATGEEI		FNCINSFMQK		HEIEWEKCVD		VCSDASRAVD
GKIAEAVTLI		KYVAPESTSS		HCLLYRHALA		VKIMPTSLKN		VLDQAVQIIN
YIKARPHQSR		LLKILCEEMG		AQHTALLLNT		EVRWLSRGKV		LVRLFELRRE
LLVFMDSAFR		LSDCLTNSSW		LLRLAYLADI		FTKLNEVNLS		MQGKNVTVFT
VFDKMSSLLR		KLEFWASSVE		EENFDCFPTL		SDFLTEINST		VDKDICSAIV
QHLRGLRATL		LKYFPVTNDN		NAWVRNPFTV		TVKPASLVAR		DYESLIDLTS
DSQVKQNFSE		LSLNDFWSSL		IQEYPSIARR		AVRVLLPFAT		MHLCETGFSY
YAATKTKYRK		RLDAAPHMRI		RLSNITPNIK		RICDKKTQKH		CSH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Smit A.F.A. (1999). Interspersed repeats and other mementos of transposable elements in mammalian genomes. Curr. Opin. Genet. Dev. 9: 657—663. PMID 10607616 DOI:10.1016/S0959-437X(99)00031-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11