ZC3H11A

ZC3H11A
Ідентифікатори
Символи	ZC3H11A, ZC3HDC11A, zinc finger CCCH-type containing 11A
Зовнішні ІД	OMIM: 613513 MGI: 1917829 HomoloGene: 8888 GeneCards: ZC3H11A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • mRNA binding Клітинна компонента • transcription export complex • нуклеоплазма Біологічний процес • poly(A)+ mRNA export from nucleus • mRNA transport • RNA export from nucleus • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus • GO:0015915 транспорт • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9877	70579
Ensembl	ENSG00000058673	ENSMUSG00000102976 ENSMUSG00000116275
UniProt	O75152	Q6NZF1
RefSeq (мРНК)	NM_014827 NM_001319238 NM_001319239 NM_001350261 NM_001350262 NM_001350263 NM_001350264 NM_001350265 NM_001350266	NM_001276767 NM_144530 NM_001357228
RefSeq (білок)	NP_001306167 NP_001306168 NP_055642 NP_001337190 NP_001337191 NP_001337192 NP_001337193 NP_001337194 NP_001337195 NP_001363263 NP_001363264 NP_001363265 NP_001363266 NP_001363267 NP_001363268 NP_001363269 NP_001363270 NP_001363271 NP_001363272 NP_001363273 NP_001363274 NP_001363275 NP_001363276 NP_001363277 NP_001363278 NP_001363279 NP_001363280 NP_001363281 NP_001363282 NP_001363283 NP_001363284 NP_001363285 NP_001363286 NP_001363287 NP_001363288 NP_001363289 NP_001363290 NP_001363291 NP_001363292 NP_001363293 NP_001363294 NP_001363295 NP_001363296	NP_001263696 NP_653113 NP_001344157
Локус (UCSC)	Хр. 1: 203.8 – 203.85 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZC3H11A (англ. Zinc finger CCCH-type containing 11A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 810 амінокислот, а молекулярна маса — 89 131.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPNQGEDCYF		FFYSTCTKGD		SCPFRHCEAA		IGNETVCTLW		QEGRCFRQVC
RFRHMEIDKK		RSEIPCYWEN		QPTGCQKLNC		AFHHNRGRYV		DGLFLPPSKT
VLPTVPESPE		EEVKASQLSV		QQNKLSVQSN		PSPQLRSVMK		VESSENVPSP
THPPVVINAA		DDDEDDDDQF		SEEGDETKTP		TLQPTPEVHN		GLRVTSVRKP
AVNIKQGECL		NFGIKTLEEI		KSKKMKEKSK		KQGEGSSGVS		SLLLHPEPVP
GPEKENVRTV		VRTVTLSTKQ		GEEPLVRLSL		TERLGKRKFS		AGGDSDPPLK
RSLAQRLGKK		VEAPETNIDK		TPKKAQVSKS		LKERLGMSAD		PDNEDATDKV
NKVGEIHVKT		LEEILLERAS		QKRGELQTKL		KTEGPSKTDD		STSGARSSST
IRIKTFSEVL		AEKKHRQQEA		ERQKSKKDTT		CIKLKIDSEI		KKTVVLPPIV
ASRGQSEEPA		GKTKSMQEVH		IKTLEEIKLE		KALRVQQSSE		SSTSSPSQHE
ATPGARRLLR		ITKRTGMKEE		KNLQEGNEVD		SQSSIRTEAK		EASGETTGVD
ITKIQVKRCE		TMREKHMQKQ		QEREKSVLTP		LRGDVASCNT		QVAEKPVLTA
VPGITRHLTK		RLPTKSSQKV		EVETSGIGDS		LLNVKCAAQT		LEKRGKAKPK
VNVKPSVVKV		VSSPKLAPKR		KAVEMHAAVI		AAVKPLSSSS		VLQEPPAKKA
AVAVVPLVSE		DKSVTVPEAE		NPRDSLVLPP		TQSSSDSSPP		EVSGPSSSQM
SMKTRRLSSA		STGKPPLSVE		DDFEKLIWEI		SGGKLEAEID		LDPGKDEDDL
LLELSEMIDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт мРНК, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Folco E.G., Lee C.S., Dufu K., Yamazaki T., Reed R. (2012). The proteins PDIP3 and ZC11A associate with the human TREX complex in an ATP-dependent manner and function in mRNA export. PLoS ONE. 7: E43804—E43804. PMID 22928037 DOI:10.1371/journal.pone.0043804

Див. також

• Хромосома 1