ZC3H3

ZC3H3
Ідентифікатори
Символи	ZC3H3, ZC3HDC3, zinc finger CCCH-type containing 3, SMICL
Зовнішні ІД	MGI: 2663721 HomoloGene: 9029 GeneCards: ZC3H3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • R-SMAD binding • SMAD binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding • endoribonuclease activity • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex Біологічний процес • poly(A)+ mRNA export from nucleus • mRNA polyadenylation • mRNA transport • positive regulation of activin receptor signaling pathway • mRNA 3'-end processing • regulation of mRNA export from nucleus • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23144	223642
Ensembl	ENSG00000014164	ENSMUSG00000075600
UniProt	Q8IXZ2	Q8CHP0
RefSeq (мРНК)	NM_015117	NM_172121
RefSeq (білок)	NP_055932	NP_742119
Локус (UCSC)	Хр. 8: 143.44 – 143.54 Mb	Хр. 15: 75.63 – 75.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZC3H3 (англ. Zinc finger CCCH-type containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 948 амінокислот, а молекулярна маса — 101 941.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEKEILRRQ		IRLLQGLIDD		YKTLHGNAPA		PGTPAASGWQ		PPTYHSGRAF
SARYPRPSRR		GYSSHHGPSW		RKKYSLVNRP		PGPSDPPADH		AVRPLHGARG
GQPPVPQQHV		LERQVQLSQG		QNVVIKVKPP		SKSGSASASG		AQRGSLEEFE
ETPWSDQRPR		EGEGEPPRGQ		LQPSRPTRAR		GTCSVEDPLL		VCQKEPGKPR
MVKSVGSVGD		SPREPRRTVS		ESVIAVKASF		PSSALPPRTG		VALGRKLGSH
SVASCAPQLL		GDRRVDAGHT		DQPVPSGSVG		GPARPASGPR		QAREASLVVT
CRTNKFRKNN		YKWVAASSKS		PRVARRALSP		RVAAENVCKA		SAGMANKVEK
PQLIADPEPK		PRKPATSSKP		GSAPSKYKWK		ASSPSASSSS		SFRWQSEASS
KDHASQLSPV		LSRSPSGDRP		AVGHSGLKPL		SGETPLSAYK		VKSRTKIIRR
RSSTSLPGDK		KSGTSPAATA		KSHLSLRRRQ		ALRGKSSPVL		KKTPNKGLVQ
VTTHRLCRLP		PSRAHLPTKE		ASSLHAVRTA		PTSKVIKTRY		RIVKKTPASP
LSAPPFPLSL		PSWRARRLSL		SRSLVLNRLR		PVASGGGKAQ		PGSPWWRSKG
YRCIGGVLYK		VSANKLSKTS		GQPSDAGSRP		LLRTGRLDPA		GSCSRSLASR
AVQRSLAIIR		QARQRREKRK		EYCMYYNRFG		RCNRGERCPY		IHDPEKVAVC
TRFVRGTCKK		TDGTCPFSHH		VSKEKMPVCS		YFLKGICSNS		NCPYSHVYVS
RKAEVCSDFL		KGYCPLGAKC		KKKHTLLCPD		FARRGACPRG		AQCQLLHRTQ
KRHSRRAATS		PAPGPSDATA		RSRVSASHGP		RKPSASQRPT		RQTPSSAALT
AAAVAAPPHC		PGGSASPSSS		KASSSSSSSS		SPPASLDHEA		PSLQEAALAA
ACSNRLCKLP		SFISLQSSPS		PGAQPRVRAP		RAPLTKDSGK		PLHIKPRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167

Див. також

• Хромосома 8