ZFYVE16

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
ZFYVE16
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ZFYVE16, PPP1R69, zinc finger FYVE-type containing 16
Зовнішні ІД OMIM: 608880 MGI: 2145181 HomoloGene: 8826 GeneCards: ZFYVE16
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001105251
NM_001284236
NM_001284237
NM_014733
NM_001349434
NM_173392
RefSeq (білок)
NP_001098721
NP_001271165
NP_001271166
NP_055548
NP_001336363
NP_775568
Локус (UCSC) Хр. 5: 80.41 – 80.48 Mb Хр. 13: 92.62 – 92.67 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ZFYVE16 (англ. Zinc finger FYVE-type containing 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 539 амінокислот, а молекулярна маса — 168 903[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDSYFKAAVSDLDKLLDDFEQNPDEQDYLQDVQNAYDSNHCSVSSELASS
QRTSLLPKDQECVNSCASSETSYGTNESSLNEKTLKGLTSIQNEKNVTGL
DLLSSVDGGTSDEIQPLYMGRCSKPICDLISDMGNLVHATNSEEDIKKLL
PDDFKSNADSLIGLDLSSVSDTPCVSSTDHDSDTVREQQNDISSELQNRE
IGGIKELGIKVDTTLSDSYNYSGTENLKDKKIFNQLESIVDFNMSSALTR
QSSKMFHAKDKLQHKSQPCGLLKDVGLVKEEVDVAVITAAECLKEEGKTS
ALTCSLPKNEDLCLNDSNSRDENFKLPDFSFQEDKTVIKQSAQEDSKSLD
LKDNDVIQDSSSALHVSSKDVPSSLSCLPASGSMCGSLIESKARGDFLPQ
HEHKDNIQDAVTIHEEIQNSVVLGGEPFKENDLLKQEKCKSILLQSLIEG
MEDRKIDPDQTVIRAESLDGGDTSSTVVESQEGLSGTHVPESSDCCEGFI
NTFSSNDMDGQDLDYFNIDEGAKSGPLISDAELDAFLTEQYLQTTNIKSF
EENVNDSKSQMNQIDMKGLDDGNINNIYFNAEAGAIGESHGINIICEIVD
KQNTIENGLSLGEKSTIPVQQGLPTSKSEITNQLSVSDINSQSVGGARPK
QLFSLPSRTRSSKDLNKPDVPDTIESEPSTADTVVPITCAIDSTADPQVS
FNSNYIDIESNSEGGSSFVTANEDSVPENTCKEGLVLGQKQPTWVPDSEA
PNCMNCQVKFTFTKRRHHCRACGKVFCGVCCNRKCKLQYLEKEARVCVVC
YETISKAQAFERMMSPTGSNLKSNHSDECTTVQPPQENQTSSIPSPATLP
VSALKQPGVEGLCSKEQKRVWFADGILPNGEVADTTKLSSGSKRCSEDFS
PLSPDVPMTVNTVDHSHSTTVEKPNNETGDITRNEIIQSPISQVPSVEKL
SMNTGNEGLPTSGSFTLDDDVFAETEEPSSPTGVLVNSNLPIASISDYRL
LCDINKYVCNKISLLPNDEDSLPPLLVASGEKGSVPVVEEHPSHEQIILL
LEGESFHPVTFVLNANLLVNVKFIFYSSDKYWYFSTNGLHGLGQAEIIIL
LLCLPNEDTIPKDIFRLFITIYKDALKGKYIENLDNITFTESFLSSKDHG
GFLFITPTFQKLDDLSLPSNPFLCGILIQKLEIPWAKVFPMRLMLRLGAE
YKAYPAPLTSIRGRKPLFGEIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHME
MGKSCIKIPRKKYSDVMKVLNSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCIQNDGI
YETQANSATGHPRKVTGASFVVFNGALKTSSGFLAKSSIVEDGLMVQITP
ETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLREYVDICWVDAEEKGNKGVISS
VDGISLQGFPSEKIKLEADFETDEKIVKCTEVFYFLKDQDLSILSTSYQF
AKEIAMACSAALCPHLKTLKSNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGQLLP
QHYLNDLDSALIPVIHGGTSNSSLPLEIELVFFIIEHLF

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література[ред. | ред. код]

  • Seet L.-F., Hong W. (2001). Endofin, an endosomal FYVE domain protein. J. Biol. Chem. 276: 42445—42454. PMID 11546807 DOI:10.1074/jbc.M105917200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Seet L.-F., Liu N., Hanson B.J., Hong W. (2004). Endofin recruits TOM1 to endosomes. J. Biol. Chem. 279: 4670—4679. PMID 14613930 DOI:10.1074/jbc.M311228200
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20756 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
  4. UniProt, Q7Z3T8 (англ.) . Архів оригіналу за 28 квітня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]