ZFYVE27

ZFYVE27
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1X4U
Ідентифікатори
Символи	ZFYVE27, PROTRUDIN, SPG33, zinc finger FYVE-type containing 27
Зовнішні ІД	OMIM: 610243 MGI: 1919602 HomoloGene: 16939 GeneCards: ZFYVE27
Пов'язані генетичні захворювання
	hereditary spastic paraplegia 33
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • protein self-association;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • аксон; • ендосома; • recycling endosome membrane; • growth cone membrane; • дендрит (нейробіологія); • клітинна мембрана; • cell projection; • endoplasmic reticulum membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • мембрана; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • endoplasmic reticulum tubular network; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• protein localization to plasma membrane; • neuron projection development; • neurotrophin TRK receptor signaling pathway; • vesicle-mediated transport; • positive regulation of axon extension; • endoplasmic reticulum tubular network formation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	118813
	319740
	ENSG00000155256
	ENSMUSG00000018820
	Q5T4F4
	Q3TXX3
NM_001002261; NM_001002262; NM_001174119; NM_001174120; NM_001174121;
	NM_001174122; NM_144588
	NM_001164531; NM_177319
NP_001002261; NP_001002262; NP_001167590; NP_001167591; NP_001167592;
	NP_001167593; NP_653189
	NP_001158003; NP_796293
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZFYVE27 (англ. Zinc finger FYVE-type containing 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 45 843^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQTSEREGSG	PELSPSVMPE	APLESPPFPT	KSPAFDLFNL	VLSYKRLEIY
LEPLKDAGDG	VRYLLRWQMP	LCSLLTCLGL	NVLFLTLNEG	AWYSVGALMI
SVPALLGYLQ	EVCRARLPDS	ELMRRKYHSV	RQEDLQRGRL	SRPEAVAEVK
SFLIQLEAFL	SRLCCTCEAA	YRVLHWENPV	VSSQFYGALL	GTVCMLYLLP
LCWVLTLLNS	TLFLGNVEFF	RVVSEYRASL	QQRMNPKQEE	HAFESPPPPD
VGGKDGLMDS	TPALTPTEDL	TPGSVEEAEE	AEPDEEFKDA	IEETHLVVLE
DDEGAPCPAE	DELALQDNGF	LSKNEVLRSK	VSRLTERLRK	RYPTNNFGNC
TGCSATFSVL	KKRRSCSNCG	NSFCSRCCSF	KVPKSSMGAT	APEAQRETVF
VCASCNQTLS	K

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shirane M., Nakayama K.I. (2006). Protrudin induces neurite formation by directional membrane trafficking. Science. 314: 818—821. PMID 17082457 DOI:10.1126/science.1134027
Shirane M., Ogawa M., Motoyama J., Nakayama K.I. (2008). Regulation of apoptosis and neurite extension by FKBP38 is required for neural tube formation in the mouse. Genes Cells. 13: 635—651. PMID 18459960 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01194.x
Saita S., Shirane M., Natume T., Iemura S., Nakayama K.I. (2009). Promotion of neurite extension by protrudin requires its interaction with vesicle-associated membrane protein-associated protein. J. Biol. Chem. 284: 13766—13777. PMID 19289470 DOI:10.1074/jbc.M807938200
Matsuzaki F., Shirane M., Matsumoto M., Nakayama K.I. (2011). Protrudin serves as an adaptor molecule that connects KIF5 and its cargoes in vesicular transport during process formation. Mol. Biol. Cell. 22: 4602—4620. PMID 21976701 DOI:10.1091/mbc.E11-01-0068
Martignoni M., Riano E., Rugarli E.I. (2008). The role of ZFYVE27/protrudin in hereditary spastic paraplegia. Am. J. Hum. Genet. 83: 127—130. PMID 18606302 DOI:10.1016/j.ajhg.2008.05.014

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZFYVE27 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26559 (англ.) . Архів оригіналу за 27 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5T4F4 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ZFYVE27 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26559 (англ.) . Архів оригіналу за 27 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q5T4F4 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

ZFYVE27

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук