Транслін

TSN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1J1J, 3PJA, 3QB5, 4WYV
Ідентифікатори
Символи	TSN, BCLF-1, C3PO, RCHF1, REHF-1, TBRBP, TRSLN, translin
Зовнішні ІД	OMIM: 600575 MGI: 109263 HomoloGene: 3397 GeneCards: TSN
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nuclease activity • endonuclease activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • hydrolase activity • RNA binding • single-stranded DNA binding • identical protein binding • endoribonuclease activity • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • DNA recombination • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA metabolic process • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7247	22099
Ensembl	ENSG00000211460	ENSMUSG00000026374
UniProt	Q15631	Q62348
RefSeq (мРНК)	NM_001261401 NM_004622	NM_011650
RefSeq (білок)	NP_001248330 NP_004613	NP_035780
Локус (UCSC)	Хр. 2: 121.74 – 121.77 Mb	Хр. 1: 118.22 – 118.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TSN (англ. Translin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 26 183.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVSEIFVEL		QGFLAAEQDI		REEIRKVVQS		LEQTAREILT		LLQGVHQGAG
FQDIPKRCLK		AREHFGTVKT		HLTSLKTKFP		AEQYYRFHEH		WRFVLQRLVF
LAAFVVYLET		ETLVTREAVT		EILGIEPDRE		KGFHLDVEDY		LSGVLILASE
LSRLSVNSVT		AGDYSRPLHI		STFINELDSG		FRLLNLKNDS		LRKRYDGLKY
DVKKVEEVVY		DLSIRGFNKE		TAAACVEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aoki K., Inazawa J., Takahashi T., Nakahara K., Kasai M. (1997). Genomic structure and chromosomal localization of the gene encoding translin, a recombination hotspot binding protein. Genomics. 43: 237—241. PMID 9244443 DOI:10.1006/geno.1997.4796
• Aoki K., Suzuki K., Ishida R., Kasai M. (1999). The DNA binding activity of Translin is mediated by a basic region in the ring-shaped structure conserved in evolution. FEBS Lett. 443: 363—366. PMID 10025964 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00010-1
• Erdemir T., Bilican B., Oncel D., Goding C.R., Yavuzer U. (2002). DNA damage-dependent interaction of the nuclear matrix protein C1D with Translin-associated factor X (TRAX). J. Cell Sci. 115: 207—216. PMID 11801738

Див. також

• Хромосома 2