FANCM
FANCM (англ. Fanconi anemia complementation group M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 048 амінокислот, а молекулярна маса — 232 191[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSGRQRTLFQ | TWGSSISRSS | GTPGCSSGTE | RPQSPGSSKA | PLPAAAEAQL | ||||
ESDDDVLLVA | AYEAERQLCL | ENGGFCTSAG | ALWIYPTNCP | VRDYQLHISR | ||||
AALFCNTLVC | LPTGLGKTFI | AAVVMYNFYR | WFPSGKVVFM | APTKPLVTQQ | ||||
IEACYQVMGI | PQSHMAEMTG | STQASTRKEI | WCSKRVLFLT | PQVMVNDLSR | ||||
GACPAAEIKC | LVIDEAHKAL | GNYAYCQVVR | ELVKYTNHFR | ILALSATPGS | ||||
DIKAVQQVIT | NLLIGQIELR | SEDSPDILTY | SHERKVEKLI | VPLGEELAAI | ||||
QKTYIQILES | FARSLIQRNV | LMRRDIPNLT | KYQIILARDQ | FRKNPSPNIV | ||||
GIQQGIIEGE | FAICISLYHG | YELLQQMGMR | SLYFFLCGIM | DGTKGMTRSK | ||||
NELGRNEDFM | KLYNHLECMF | ARTRSTSANG | ISAIQQGDKN | KKFVYSHPKL | ||||
KKLEEVVIEH | FKSWNAENTT | EKKRDETRVM | IFSSFRDSVQ | EIAEMLSQHQ | ||||
PIIRVMTFVG | HASGKSTKGF | TQKEQLEVVK | QFRDGGYNTL | VSTCVGEEGL | ||||
DIGEVDLIIC | FDSQKSPIRL | VQRMGRTGRK | RQGRIVIILS | EGREERIYNQ | ||||
SQSNKRSIYK | AISSNRQVLH | FYQRSPRMVP | DGINPKLHKM | FITHGVYEPE | ||||
KPSRNLQRKS | SIFSYRDGMR | QSSLKKDWFL | SEEEFKLWNR | LYRLRDSDEI | ||||
KEITLPQVQF | SSLQNEENKP | AQESTTGIHQ | LSLSEWRLWQ | DHPLPTHQVD | ||||
HSDRCRHFIG | LMQMIEGMRH | EEGECSYELE | VESYLQMEDV | TSTFIAPRNE | ||||
SNNLASDTFI | THKKSSFIKN | INQGSSSSVI | ESDEECAEIV | KQTHIKPTKI | ||||
VSLKKKVSKE | IKKDQLKKEN | NHGIIDSVDN | DRNSTVENIF | QEDLPNDKRT | ||||
SDTDEIAATC | TINENVIKEP | CVLLTECQFT | NKSTSSLAGN | VLDSGYNSFN | ||||
DEKSVSSNLF | LPFEEELYIV | RTDDQFYNCH | SLTKEVLANV | ERFLSYSPPP | ||||
LSGLSDLEYE | IAKGTALENL | LFLPCAEHLR | SDKCTCLLSH | SAVNSQQNLE | ||||
LNSLKCINYP | SEKSCLYDIP | NDNISDEPSL | CDCDVHKHNQ | NENLVPNNRV | ||||
QIHRSPAQNL | VGENNHDVDN | SDLPVLSTDQ | DESLLLFEDV | NTEFDDVSLS | ||||
PLNSKSESLP | VSDKTAISET | PLVSQFLISD | ELLLDNNSEL | QDQITRDANS | ||||
FKSRDQRGVQ | EEKVKNHEDI | FDCSRDLFSV | TFDLGFCSPD | SDDEILEHTS | ||||
DSNRPLDDLY | GRYLEIKEIS | DANYVSNQAL | IPRDHSKNFT | SGTVIIPSNE | ||||
DMQNPNYVHL | PLSAAKNEEL | LSPGYSQFSL | PVQKKVMSTP | LSKSNTLNSF | ||||
SKIRKEILKT | PDSSKEKVNL | QRFKEALNST | FDYSEFSLEK | SKSSGPMYLH | ||||
KSCHSVEDGQ | LLTSNESEDD | EIFRRKVKRA | KGNVLNSPED | QKNSEVDSPL | ||||
HAVKKRRFPI | NRSELSSSDE | SENFPKPCSQ | LEDFKVCNGN | ARRGIKVPKR | ||||
QSHLKHVARK | FLDDEAELSE | EDAEYVSSDE | NDESENEQDS | SLLDFLNDET | ||||
QLSQAINDSE | MRAIYMKSLR | SPMMNNKYKM | IHKTHKNINI | FSQIPEQDET | ||||
YLEDSFCVDE | EESCKGQSSE | EEVCVDFNLI | TDDCFANSKK | YKTRRAVMLK | ||||
EMMEQNCAHS | KKKLSRIILP | DDSSEEENNV | NDKRESNIAV | NPSTVKKNKQ | ||||
QDHCLNSVPS | GSSAQSKVRS | TPRVNPLAKQ | SKQTSLNLKD | TISEVSDFKP | ||||
QNHNEVQSTT | PPFTTVDSQK | DCRKFPVPQK | DGSALEDSST | SGASCSKSRP | ||||
HLAGTHTSLR | LPQEGKGTCI | LVGGHEITSG | LEVISSLRAI | HGLQVEVCPL | ||||
NGCDYIVSNR | MVVERRSQSE | MLNSVNKNKF | IEQIQHLQSM | FERICVIVEK | ||||
DREKTGDTSR | MFRRTKSYDS | LLTTLIGAGI | RILFSSCQEE | TADLLKELSL | ||||
VEQRKNVGIH | VPTVVNSNKS | EALQFYLSIP | NISYITALNM | CHQFSSVKRM | ||||
ANSSLQEISM | YAQVTHQKAE | EIYRYIHYVF | DIQMLPNDLN | QDRLKSDI |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23168 (англ.) . Процитовано 20 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IYD8 (англ.) . Процитовано 20 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |