ITGB6

ITGB6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UM8, 4UM9
Ідентифікатори
Символи	ITGB6, AI1H, Integrin, beta 6, integrin subunit beta 6
Зовнішні ІД	OMIM: 147558 MGI: 96615 HomoloGene: 685 GeneCards: ITGB6
Пов'язані генетичні захворювання
amelogenesis imperfecta type 1H
Онтологія гена Молекулярна функція • integrin binding • virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integrin complex • receptor complex • клітинна мембрана • мембрана • external side of plasma membrane • focal adhesion • integrin alphav-beta6 complex • нуклеоплазма • центросома • міжклітинні контакти • cell surface Біологічний процес • integrin-mediated signaling pathway • viral entry into host cell • cell-matrix adhesion • inflammatory response • адгезія клітин • extracellular matrix organization • GO:0022415 viral process • cell adhesion mediated by integrin • cell migration • regulation of transforming growth factor beta activation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3694	16420
Ensembl	ENSG00000115221	ENSMUSG00000026971
UniProt	P18564	Q9Z0T9
RefSeq (мРНК)	NM_000888 NM_001282353 NM_001282354 NM_001282355 NM_001282388 NM_001282389 NM_001282390	NM_001159564 NM_021359
RefSeq (білок)	NP_000879 NP_001269282 NP_001269283 NP_001269284 NP_001269317 NP_001269318 NP_001269319	NP_001153036 NP_067334
Локус (UCSC)	Хр. 2: 160.1 – 160.2 Mb	Хр. 2: 60.43 – 60.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ITGB6 (англ. Integrin subunit beta 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 788 амінокислот, а молекулярна маса — 85 936.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGIELLCLFF		LFLGRNDHVQ		GGCALGGAET		CEDCLLIGPQ		CAWCAQENFT
HPSGVGERCD		TPANLLAKGC		QLNFIENPVS		QVEILKNKPL		SVGRQKNSSD
IVQIAPQSLI		LKLRPGGAQT		LQVHVRQTED		YPVDLYYLMD		LSASMDDDLN
TIKELGSRLS		KEMSKLTSNF		RLGFGSFVEK		PVSPFVKTTP		EEIANPCSSI
PYFCLPTFGF		KHILPLTNDA		ERFNEIVKNQ		KISANIDTPE		GGFDAIMQAA
VCKEKIGWRN		DSLHLLVFVS		DADSHFGMDS		KLAGIVIPND		GLCHLDSKNE
YSMSTVLEYP		TIGQLIDKLV		QNNVLLIFAV		TQEQVHLYEN		YAKLIPGATV
GLLQKDSGNI		LQLIISAYEE		LRSEVELEVL		GDTEGLNLSF		TAICNNGTLF
QHQKKCSHMK		VGDTASFSVT		VNIPHCERRS		RHIIIKPVGL		GDALELLVSP
ECNCDCQKEV		EVNSSKCHHG		NGSFQCGVCA		CHPGHMGPRC		ECGEDMLSTD
SCKEAPDHPS		CSGRGDCYCG		QCICHLSPYG		NIYGPYCQCD		NFSCVRHKGL
LCGGNGDCDC		GECVCRSGWT		GEYCNCTTST		DSCVSEDGVL		CSGRGDCVCG
KCVCTNPGAS		GPTCERCPTC		GDPCNSKRSC		IECHLSAAGQ		AREECVDKCK
LAGATISEEE		DFSKDGSVSC		SLQGENECLI		TFLITTDNEG		KTIIHSINEK
DCPKPPNIPM		IMLGVSLAIL		LIGVVLLCIW		KLLVSFHDRK		EVAKFEAERS
KAKWQTGTNP		LYRGSTSTFK		NVTYKHREKQ		KVDLSTDC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gianni T., Salvioli S., Chesnokova L.S., Hutt-Fletcher L.M., Campadelli-Fiume G. (2013). alphavbeta6- and alphavbeta8-integrins serve as interchangeable receptors for HSV gH/gL to promote endocytosis and activation of membrane fusion. PLoS Pathog. 9: E1003806—E1003806. PMID 24367260 DOI:10.1371/journal.ppat.1003806

Див. також

• Хромосома 2