JAZF1

JAZF1
Ідентифікатори
Символи	JAZF1, TIP27, ZNF802, JAZF zinc finger 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606246 MGI: 2141450 HomoloGene: 18291 GeneCards: JAZF1
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу, ревматоїдний артрит, рак простати
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • transcription repressor complex • fibrillar center • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • lipid metabolism • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221895	231986
Ensembl	ENSG00000153814	ENSMUSG00000063568
UniProt	Q86VZ6	Q80ZQ5
RefSeq (мРНК)	NM_175061	NM_001168277 NM_173406
RefSeq (білок)	NP_778231	NP_001161749 NP_775582
Локус (UCSC)	Хр. 7: 27.83 – 28.18 Mb	Хр. 6: 52.75 – 53.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

JAZF1 (англ. JAZF zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 27 079.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTGIAAASFF		SNTCRFGGCG		LHFPTLADLI		EHIEDNHIDT		DPRVLEKQEL
QQPTYVALSY		INRFMTDAAR		REQESLKKKI		QPKLSLTLSS		SVSRGNVSTP
PRHSSGSLTP		PVTPPITPSS		SFRSSTPTGS		EYDEEEVDYE		ESDSDESWTT
ESAISSEAIL		SSMCMNGGEE		KPFACPVPGC		KKRYKNVNGI		KYHAKNGHRT
QIRVRKPFKC		RCGKSYKTAQ		GLRHHTINFH		PPVSAEIIRK		MQQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Nakajima T., Fujino S., Nakanishi G., Kim Y.S., Jetten A.M. (2004). TIP27: a novel repressor of the nuclear orphan receptor TAK1/TR4. Nucleic Acids Res. 32: 4194—4204. PMID 15302918 DOI:10.1093/nar/gkh741
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Micci F., Panagopoulos I., Bjerkehagen B., Heim S. (2006). Consistent rearrangement of chromosomal band 6p21 with generation of fusion genes JAZF1/PHF1 and EPC1/PHF1 in endometrial stromal sarcoma. Cancer Res. 66: 107—112. PMID 16397222 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-05-2485
• Li H., Wang J., Mor G., Sklar J. (2008). A neoplastic gene fusion mimics trans-splicing of RNAs in normal human cells. Science. 321: 1357—1361. PMID 18772439 DOI:10.1126/science.1156725

Див. також

• Хромосома 7