LRPPRC

LRPPRC
Ідентифікатори
Символи	LRPPRC, CLONE-23970, GP130, LRP130, LSFC, leucine rich pentatricopeptide repeat containing, MC4DN5
Зовнішні ІД	OMIM: 607544 MGI: 1919666 HomoloGene: 32695 GeneCards: LRPPRC
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded DNA binding • microtubule binding • ubiquitin protein ligase binding • beta-tubulin binding • actin filament binding • DNA binding • endonuclease activity • RNA binding Клітинна компонента • condensed nuclear chromosome • nuclear inner membrane • mitochondrial nucleoid • perinuclear region of cytoplasm • цитоплазма • цитоскелет • нуклеоплазма • мікротрубочка • nuclear outer membrane • мембрана • мітохондрія • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • mRNA transport • mitochondrion transport along microtubule • transcription, DNA-templated • negative regulation of mitochondrial RNA catabolic process • regulation of mitochondrial translation • GO:0016547 Редагування РНК • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10128	72416
Ensembl	ENSG00000138095	ENSMUSG00000024120
UniProt	P42704	Q6PB66
RefSeq (мРНК)	NM_133259	NM_028233
RefSeq (білок)	NP_573566	NP_082509
Локус (UCSC)	Хр. 2: 43.89 – 44 Mb	Хр. 17: 85.01 – 85.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRPPRC (англ. Leucine rich pentatricopeptide repeat containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 394 амінокислот, а молекулярна маса — 157 905.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAALLRSARW		LLRAGAAPRL		PLSLRLLPGG		PGRLHAASYL		PAARAGPVAG
GLLSPARLYA		IAAKEKDIQE		ESTFSSRKIS		NQFDWALMRL		DLSVRRTGRI
PKKLLQKVFN		DTCRSGGLGG		SHALLLLRSC		GSLLPELKLE		ERTEFAHRIW
DTLQKLGAVY		DVSHYNALLK		VYLQNEYKFS		PTDFLAKMEE		ANIQPNRVTY
QRLIASYCNV		GDIEGASKIL		GFMKTKDLPV		TEAVFSALVT		GHARAGDMEN
AENILTVMRD		AGIEPGPDTY		LALLNAYAEK		GDIDHVKQTL		EKVEKSELHL
MDRDLLQIIF		SFSKAGYPQY		VSEILEKVTC		ERRYIPDAMN		LILLLVTEKL
EDVALQILLA		CPVSKEDGPS		VFGSFFLQHC		VTMNTPVEKL		TDYCKKLKEV
QMHSFPLQFT		LHCALLANKT		DLAKALMKAV		KEEGFPIRPH		YFWPLLVGRR
KEKNVQGIIE		ILKGMQELGV		HPDQETYTDY		VIPCFDSVNS		ARAILQENGC
LSDSDMFSQA		GLRSEAANGN		LDFVLSFLKS		NTLPISLQSI		RSSLLLGFRR
SMNINLWSEI		TELLYKDGRY		CQEPRGPTEA		VGYFLYNLID		SMSDSEVQAK
EEHLRQYFHQ		LEKMNVKIPE		NIYRGIRNLL		ESYHVPELIK		DAHLLVESKN
LDFQKTVQLT		SSELESTLET		LKAENQPIRD		VLKQLILVLC		SEENMQKALE
LKAKYESDMV		TGGYAALINL		CCRHDKVEDA		LNLKEEFDRL		DSSAVLDTGK
YVGLVRVLAK		HGKLQDAINI		LKEMKEKDVL		IKDTTALSFF		HMLNGAALRG
EIETVKQLHE		AIVTLGLAEP		STNISFPLVT		VHLEKGDLST		ALEVAIDCYE
KYKVLPRIHD		VLCKLVEKGE		TDLIQKAMDF		VSQEQGEMVM		LYDLFFAFLQ
TGNYKEAKKI		IETPGIRARS		ARLQWFCDRC		VANNQVETLE		KLVELTQKLF
ECDRDQMYYN		LLKLYKINGD		WQRADAVWNK		IQEENVIPRE		KTLRLLAEIL
REGNQEVPFD		VPELWYEDEK		HSLNSSSAST		TEPDFQKDIL		IACRLNQKKG
AYDIFLNAKE		QNIVFNAETY		SNLIKLLMSE		DYFTQAMEVK		AFAETHIKGF
TLNDAANSRL		IITQVRRDYL		KEAVTTLKTV		LDQQQTPSRL		AVTRVIQALA
MKGDVENIEV		VQKMLNGLED		SIGLSKMVFI		NNIALAQIKN		NNIDAAIENI
ENMLTSENKV		IEPQYFGLAY		LFRKVIEEQL		EPAVEKISIM		AERLANQFAI
YKPVTDFFLQ		LVDAGKVDDA		RALLQRCGAI		AEQTPILLLF		LLRNSRKQGK
ASTVKSVLEL		IPELNEKEEA		YNSLMKSYVS		EKDVTSAKAL		YEHLTAKNTK
LDDLFLKRYA		SLLKYAGEPV		PFIEPPESFE		FYAQQLRKLR		ENSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі, мембрані, мітохондрії.

Література

• Xu F., Morin C., Mitchell G., Ackerley C., Robinson B.H. (2004). The role of the LRPPRC (leucine-rich pentatricopeptide repeat cassette) gene in cytochrome oxidase assembly: mutation causes lowered levels of COX (cytochrome c oxidase) I and COX III mRNA. Biochem. J. 382: 331—336. PMID 15139850 DOI:10.1042/BJ20040469
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hou J., Wang F., McKeehan W.L. (1994). Molecular cloning and expression of the gene for a major leucine-rich protein from human hepatoblastoma cells (HepG2). In Vitro Cell. Dev. Biol. Anim. 30A: 111—114. PMID 8012652 DOI:10.1007/BF02631402
• Mili S., Shu H.J., Zhao Y., Pinol-Roma S. (2001). Distinct RNP complexes of shuttling hnRNP proteins with pre-mRNA and mRNA: candidate intermediates in formation and export of mRNA. Mol. Cell. Biol. 21: 7307—7319. PMID 11585913 DOI:10.1128/MCB.21.21.7307-7319.2001
• Liu L., McKeehan W.L. (2002). Sequence analysis of LRPPRC and its SEC1 domain interaction partners suggests roles in cytoskeletal organization, vesicular trafficking, nucleocytosolic shuttling, and chromosome activity. Genomics. 79: 124—136. PMID 11827465 DOI:10.1006/geno.2001.6679
• Mili S., Pinol-Roma S. (2003). LRP130, a pentatricopeptide motif protein with a noncanonical RNA-binding domain, is bound in vivo to mitochondrial and nuclear RNAs. Mol. Cell. Biol. 23: 4972—4982. PMID 12832482 DOI:10.1128/MCB.23.14.4972-4982.2003

Див. також

• Хромосома 2