MICA

MICA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1B3J, 1HYR
Ідентифікатори
Символи	MICA, MIC-A, PERB11.1, MHC class I polypeptide-related sequence A, MHC class I chain–related protein A, MHC class I polypeptide–related protein A
Зовнішні ІД	OMIM: 600169 MGI: 2179989 GeneCards: MICA
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-2-microglobulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • natural killer cell lectin-like receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • міжклітинний простір • external side of plasma membrane Біологічний процес • Цитоліз • адаптивна імунна відповідь • negative regulation of natural killer cell activation • процес імунної системи • gamma-delta T cell activation • response to heat • immune response to tumor cell • cellular response to DNA damage stimulus • defense response to bacterium • defense response to virus • regulation of immune response • negative regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity • GO:0022415 viral process • T cell mediated cytotoxicity • natural killer cell mediated cytotoxicity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • natural killer cell activation • susceptibility to natural killer cell mediated cytotoxicity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	100507436	243864
Ensembl	ENSG00000231225 ENSG00000235233 ENSG00000204520 ENSG00000183214 ENSG00000233051 н/д	ENSMUSG00000040987
UniProt	Q29983	Q8HWE5
RefSeq (мРНК)	NM_001289154 NM_000247 NM_001177519 NM_001289152 NM_001289153	NM_153760 NM_153761
RefSeq (білок)	NP_000238 NP_001170990 NP_001276081 NP_001276082 NP_001276083	NP_715641 NP_715642
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.4 – 31.42 Mb	Хр. 7: 18.57 – 18.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MICA (англ. MHC class I polypeptide-related sequence A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 383 амінокислот, а молекулярна маса — 42 915.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLGPVFLLL		AGIFPFAPPG		AAAEPHSLRY		NLTVLSWDGS		VQSGFLTEVH
LDGQPFLRCD		RQKCRAKPQG		QWAEDVLGNK		TWDRETRDLT		GNGKDLRMTL
AHIKDQKEGL		HSLQEIRVCE		IHEDNSTRSS		QHFYYDGELF		LSQNLETKEW
TMPQSSRAQT		LAMNVRNFLK		EDAMKTKTHY		HAMHADCLQE		LRRYLKSGVV
LRRTVPPMVN		VTRSEASEGN		ITVTCRASGF		YPWNITLSWR		QDGVSLSHDT
QQWGDVLPDG		NGTYQTWVAT		RICQGEEQRF		TCYMEHSGNH		STHPVPSGKV
LVLQSHWQTF		HVSAVAAAAI		FVIIIFYVRC		CKKKTSAAEG		PELVSLQVLD
QHPVGTSDHR		DATQLGFQPL		MSDLGSTGST		EGA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, цитоліз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Bahram S., Bresnahan M., Geraghty D.E., Spies T. (1994). A second lineage of mammalian major histocompatibility complex class I genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6259—6263. PMID 8022771 DOI:10.1073/pnas.91.14.6259
• Bahram S., Mizuki N., Inoko H., Spies T. (1996). Nucleotide sequence of the human MHC class I MICA gene. Immunogenetics. 44: 80—81. PMID 8613147 DOI:10.1007/BF02602661
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Leelayuwat C., Townend D.C., Degli-Esposti M.A., Abraham L.J., Dawkins R.L. (1994). A new polymorphic and multicopy MHC gene family related to nonmammalian class I. Immunogenetics. 40: 339—351. PMID 7927538 DOI:10.1007/BF01246675
• Perez-Rodriguez M., Raimondi E., Marsh S.G.E., Madrigal J.A. (2002). Identification of a new MICA allele, MICA*047. Tissue Antigens. 59: 216—218. PMID 12074712 DOI:10.1034/j.1399-0039.2002.590306.x
• Petersdorf E.W., Shuler K.B., Longton G.M., Spies T., Hansen J.A. (1999). Population study of allelic diversity in the human MHC class I-related MIC-A gene. Immunogenetics. 49: 605—612. PMID 10369917 DOI:10.1007/s002510050655

Див. також

• Хромосома 6