RBBP8

RBBP8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L4Z, 4D2H
Ідентифікатори
Символи	RBBP8, COM1, CTIP, JWDS, RIM, SAE2, SCKL2, retinoblastoma binding protein 8, RB binding protein 8, endonuclease
Зовнішні ІД	OMIM: 604124 MGI: 2442995 HomoloGene: 28546 GeneCards: RBBP8
Пов'язані генетичні захворювання
Seckel syndrome 2, Jawad syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • hydrolase activity • endonuclease activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • damaged DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity • identical protein binding • Y-form DNA binding • double-strand/single-strand DNA junction binding • double-stranded DNA binding • single-stranded DNA binding • flap-structured DNA binding Клітинна компонента • transcription repressor complex • хромосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • site of double-strand break Біологічний процес • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleotide-excision repair • поділ клітини • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • response to estradiol • GO:0007126 мейоз • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to DNA damage stimulus • blastocyst hatching • DNA double-strand break processing • реплікація ДНК • DNA double-strand break processing involved in repair via single-strand annealing • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • double-strand break repair via homologous recombination • negative regulation of G0 to G1 transition • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • G1/S transition of mitotic cell cycle • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5932	225182
Ensembl	ENSG00000101773	ENSMUSG00000041238
UniProt	Q99708	Q80YR6
RefSeq (мРНК)	NM_002894 NM_203291 NM_203292	NM_001081223 NM_001252495 NM_175458
RefSeq (білок)	NP_002885 NP_976036 NP_976037 NP_002885.1 NP_976036.1	NP_001074692 NP_001239424
Локус (UCSC)	Хр. 18: 22.8 – 23.03 Mb	Хр. 18: 11.77 – 11.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBBP8 (англ. RB binding protein 8, endonuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 897 амінокислот, а молекулярна маса — 101 942.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNISGSSCGS		PNSADTSSDF		KDLWTKLKEC		HDREVQGLQV		KVTKLKQERI
LDAQRLEEFF		TKNQQLREQQ		KVLHETIKVL		EDRLRAGLCD		RCAVTEEHMR
KKQQEFENIR		QQNLKLITEL		MNERNTLQEE		NKKLSEQLQQ		KIENDQQHQA
AELECEEDVI		PDSPITAFSF		SGVNRLRRKE		NPHVRYIEQT		HTKLEHSVCA
NEMRKVSKSS		THPQHNPNEN		EILVADTYDQ		SQSPMAKAHG		TSSYTPDKSS
FNLATVVAET		LGLGVQEESE		TQGPMSPLGD		ELYHCLEGNH		KKQPFEESTR
NTEDSLRFSD		STSKTPPQEE		LPTRVSSPVF		GATSSIKSGL		DLNTSLSPSL
LQPGKKKHLK		TLPFSNTCIS		RLEKTRSKSE		DSALFTHHSL		GSEVNKIIIQ
SSNKQILINK		NISESLGEQN		RTEYGKDSNT		DKHLEPLKSL		GGRTSKRKKT
EEESEHEVSC		PQASFDKENA		FPFPMDNQFS		MNGDCVMDKP		LDLSDRFSAI
QRQEKSQGSE		TSKNKFRQVT		LYEALKTIPK		GFSSSRKASD		GNCTLPKDSP
GEPCSQECII		LQPLNKCSPD		NKPSLQIKEE		NAVFKIPLRP		RESLETENVL
DDIKSAGSHE		PIKIQTRSDH		GGCELASVLQ		LNPCRTGKIK		SLQNNQDVSF
ENIQWSIDPG		ADLSQYKMDV		TVIDTKDGSQ		SKLGGETVDM		DCTLVSETVL
LKMKKQEQKG		EKSSNEERKM		NDSLEDMFDR		TTHEEYESCL		ADSFSQAADE
EEELSTATKK		LHTHGDKQDK		VKQKAFVEPY		FKGDERETSL		QNFPHIEVVR
KKEERRKLLG		HTCKECEIYY		ADMPAEEREK		KLASCSRHRF		RYIPPNTPEN
FWEVGFPSTQ		TCMERGYIKE		DLDPCPRPKR		RQPYNAIFSP		KGKEQKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Fusco C., Reymond A., Zervos A.S. (1998). Molecular cloning and characterization of a novel retinoblastoma-binding protein. Genomics. 51: 351—358. PMID 9721205 DOI:10.1006/geno.1998.5368
• Schaeper U., Subramanian T., Lim L., Boyd J.M., Chinnadurai G. (1998). Interaction between a cellular protein that binds to the C-terminal region of adenovirus E1A (CtBP) and a novel cellular protein is disrupted by E1A through a conserved PLDLS motif. J. Biol. Chem. 273: 8549—8552. PMID 9535825 DOI:10.1074/jbc.273.15.8549
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yu X., Baer R. (2000). Nuclear localization and cell cycle-specific expression of CtIP, a protein that associates with the BRCA1 tumor suppressor. J. Biol. Chem. 275: 18541—18549. PMID 10764811 DOI:10.1074/jbc.M909494199
• Yu X., Chen J. (2004). DNA damage-induced cell cycle checkpoint control requires CtIP, a phosphorylation-dependent binding partner of BRCA1 C-terminal domains. Mol. Cell. Biol. 24: 9478—9486. PMID 15485915 DOI:10.1128/MCB.24.21.9478-9486.2004
• Yu X., Fu S., Lai M., Baer R., Chen J. (2006). BRCA1 ubiquitinates its phosphorylation-dependent binding partner CtIP. Genes Dev. 20: 1721—1726. PMID 16818604 DOI:10.1101/gad.1431006

Див. також

• Хромосома 18