SMC2

SMC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4U4P
Ідентифікатори
Символи	SMC2, CAP-E, CAPE, SMC-2, SMC2L1, structural maintenance of chromosomes 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605576 MGI: 106067 HomoloGene: 4705 GeneCards: SMC2
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • ATP binding • single-stranded DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • хромосома • нуклеоплазма • Конденсин • nuclear chromosome • ядерце • екзосома • condensed chromosome • клітинне ядро Біологічний процес • kinetochore organization • meiotic chromosome condensation • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • meiotic chromosome segregation • поділ клітини • chromosome condensation • клітинний цикл • mitotic chromosome condensation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10592	14211
Ensembl	ENSG00000136824	ENSMUSG00000028312
UniProt	O95347 Q05D74	Q8CG48
RefSeq (мРНК)	NM_001042550 NM_001042551 NM_001265602 NM_006444	NM_001301412 NM_008017
RefSeq (білок)	NP_001036015 NP_001036016 NP_001252531 NP_006435 NP_006435.2	NP_001288341 NP_032043
Локус (UCSC)	Хр. 9: 104.09 – 104.14 Mb	Хр. 4: 52.44 – 52.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMC2 (англ. Structural maintenance of chromosomes 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 197 амінокислот, а молекулярна маса — 135 656.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHIKSIILEG		FKSYAQRTEV		NGFDPLFNAI		TGLNGSGKSN		ILDSICFLLG
ISNLSQVRAS		NLQDLVYKNG		QAGITKASVS		ITFDNSDKKQ		SPLGFEVHDE
ITVTRQVVIG		GRNKYLINGV		NANNTRVQDL		FCSVGLNVNN		PHFLIMQGRI
TKVLNMKPPE		ILSMIEEAAG		TRMYEYKKIA		AQKTIEKKEA		KLKEIKTILE
EEITPTIQKL		KEERSSYLEY		QKVMREIEHL		SRLYIAYQFL		LAEDTKVRSA
EELKEMQDKV		IKLQEELSEN		DKKIKALNHE		IEELEKRKDK		ETGGILRSLE
DALAEAQRVN		TKSQSAFDLK		KKNLACEESK		RKELEKNMVE		DSKTLAAKEK
EVKKITDGLH		ALQEASNKDA		EALAAAQQHF		NAVSAGLSSN		EDGAEATLAG
QMMACKNDIS		KAQTEAKQAQ		MKLKHAQQEL		KNKQAEVKKM		DSGYRKDQEA
LEAVKRLKEK		LEAEMKKLNY		EENKEESLLE		KRRQLSRDIG		RLKETYEALL
ARFPNLRFAY		KDPEKNWNRN		CVKGLVASLI		SVKDTSATTA		LELVAGERLY
NVVVDTEVTG		KKLLERGELK		RRYTIIPLNK		ISARCIAPET		LRVAQNLVGP
DNVHVALSLV		EYKPELQKAM		EFVFGTTFVC		DNMDNAKKVA		FDKRIMTRTV
TLGGDVFDPH		GTLSGGARSQ		AASILTKFQE		LKDVQDELRI		KENELRALEE
ELAGLKNTAE		KYRQLKQQWE		MKTEEADLLQ		TKLQQSSYHK		QQEELDALKK
TIEESEETLK		NTKEIQRKAE		EKYEVLENKM		KNAEAERERE		LKDAQKKLDC
AKTKADASSK		KMKEKQQEVE		AITLELEELK		REHTSYKQQL		EAVNEAIKSY
ESQIEVMAAE		VAKNKESVNK		AQEEVTKQKE		VITAQDTVIK		AKYAEVAKHK
EQNNDSQLKI		KELDHNISKH		KREAEDGAAK		VSKMLKDYDW		INAERHLFGQ
PNSAYDFKTN		NPKEAGQRLQ		KLQEMKEKLG		RNVNMRAMNV		LTEAEERYND
LMKKKRIVEN		DKSKILTTIE		DLDQKKNQAL		NIAWQKVNKD		FGSIFSTLLP
GANAMLAPPE		GQTVLDGLEF		KVALGNTWKE		NLTELSGGQR		SLVALSLILS
MLLFKPAPIY		ILDEVDAALD		LSHTQNIGQM		LRTHFTHSQF		IVVSLKEGMF
NNANVLFKTK		FVDGVSTVAR		FTQCQNGKIS		KEAKSKAKPP		KGAHVEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, конденсація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cobbe N., Heck M.M.S. (2004). The evolution of SMC proteins: phylogenetic analysis and structural implications. Mol. Biol. Evol. 21: 332—347. PMID 14660695 DOI:10.1093/molbev/msh023
• Schmiesing J.A., Gregson H.C., Zhou S., Yokomori K. (2000). A human condensin complex containing hCAP-C-hCAP-E and CNAP1, a homolog of Xenopus XCAP-D2, colocalizes with phosphorylated histone H3 during the early stage of mitotic chromosome condensation. Mol. Cell. Biol. 20: 6996—7006. PMID 10958694 DOI:10.1128/MCB.20.18.6996-7006.2000
• Kimura K., Cuvier O., Hirano T. (2001). Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts. J. Biol. Chem. 276: 5417—5420. PMID 11136719 DOI:10.1074/jbc.C000873200

Див. також

• Хромосома 9