TERF2IP

TERF2IP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FEX, 3K6G, 4RQI
Ідентифікатори
Символи	TERF2IP, DRIP5, RAP1, TERF2 interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 605061 MGI: 1929871 HomoloGene: 10357 GeneCards: TERF2IP
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • telomeric DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G-rich strand telomeric DNA binding • phosphatase binding Клітинна компонента • nuclear telomere cap complex • nuclear envelope • хромосома • shelterin complex • теломера • nuclear chromosome • Mre11 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця • цитоплазма Біологічний процес • negative regulation of DNA recombination at telomere • telomere maintenance via telomerase • protection from non-homologous end joining at telomere • regulation of double-strand break repair via homologous recombination • transcription, DNA-templated • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • protein localization to chromosome, telomeric region • positive regulation of protein acetylation • telomere maintenance via telomere lengthening • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • telomere maintenance • telomere capping • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of telomere maintenance • negative regulation of telomere maintenance • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54386	57321
Ensembl	ENSG00000166848	ENSMUSG00000033430
UniProt	Q9NYB0	Q91VL8
RefSeq (мРНК)	NM_018975	NM_020584
RefSeq (білок)	NP_061848	NP_065609
Локус (UCSC)	Хр. 16: 75.65 – 75.76 Mb	Хр. 8: 112.74 – 112.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TERF2IP (англ. TERF2 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 44 260.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEAMDLGKD		PNGPTHSSTL		FVRDDGSSMS		FYVRPSPAKR		RLSTLILHGG
GTVCRVQEPG		AVLLAQPGEA		LAEASGDFIS		TQYILDCVER		NERLELEAYR
LGPASAADTG		SEAKPGALAE		GAAEPEPQRH		AGRIAFTDAD		DVAILTYVKE
NARSPSSVTG		NALWKAMEKS		SLTQHSWQSL		KDRYLKHLRG		QEHKYLLGDA
PVSPSSQKLK		RKAEEDPEAA		DSGEPQNKRT		PDLPEEEYVK		EEIQENEEAV
KKMLVEATRE		FEEVVVDESP		PDFEIHITMC		DDDPPTPEED		SETQPDEEEE
EEEEKVSQPE		VGAAIKIIRQ		LMEKFNLDLS		TVTQAFLKNS		GELEATSAFL
ASGQRADGYP		IWSRQDDIDL		QKDDEDTREA		LVKKFGAQNV		ARRIEFRKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• Li B., Oestreich S., de Lange T. (2000). Identification of human RAP1: implications for telomere evolution. Cell. 101: 471—483. PMID 10850490 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80858-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tan M., Wei C., Price C.M. (2003). The telomeric protein Rap1 is conserved in vertebrates and is expressed from a bidirectional promoter positioned between the Rap1 and KARS genes. Gene. 323: 1—10. PMID 14659874 DOI:10.1016/j.gene.2003.08.026
• Liu D., O'Connor M.S., Qin J., Songyang Z. (2004). Telosome, a mammalian telomere-associated complex formed by multiple telomeric proteins. J. Biol. Chem. 279: 51338—51342. PMID 15383534 DOI:10.1074/jbc.M409293200
• de Lange T. (2005). Shelterin: the protein complex that shapes and safeguards human telomeres. Genes Dev. 19: 2100—2110. PMID 16166375 DOI:10.1101/gad.1346005
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 16