Рибосомний білок S13

Рибосомний білок S13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS13, S13, ribosomal protein S13
Зовнішні ІД	OMIM: 180476 MGI: 1915302 HomoloGene: 128182 GeneCards: RPS13
Онтологія гена Молекулярна функція • small ribosomal subunit rRNA binding • structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • 5.8S rRNA binding • RNA binding • mRNA 5'-UTR binding Клітинна компонента • гіалоплазма • рибосома • мембрана • focal adhesion • внутрішньоклітинний • cytosolic small ribosomal subunit • ядерце • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення Біологічний процес • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • negative regulation of RNA splicing • Біосинтез білків • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6207	68052
Ensembl	ENSG00000110700	ENSMUSG00000090862
UniProt	P62277	P62301
RefSeq (мРНК)	NM_001017	NM_026533
RefSeq (білок)	NP_001008	NP_080809
Локус (UCSC)	Хр. 11: 17.07 – 17.08 Mb	Хр. 7: 115.93 – 115.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок S13 (англ. Ribosomal protein S13) – білок, який кодується геном RPS13, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 151 амінокислот, а молекулярна маса — 17 222.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRMHAPGKG		LSQSALPYRR		SVPTWLKLTS		DDVKEQIYKL		AKKGLTPSQI
GVILRDSHGV		AQVRFVTGNK		ILRILKSKGL		APDLPEDLYH		LIKKAVAVRK
HLERNRKDKD		AKFRLILIES		RIHRLARYYK		TKRVLPPNWK		YESSTASALV
A

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків.

Література

• Chadeneau C., Lemoullac B., Denis M.G. (1993). Cloning and analysis of the human S13 ribosomal protein cDNA. Nucleic Acids Res. 21: 2945—2945. PMID 8332508 DOI:10.1093/nar/21.12.2945
• Kenmochi N., Higa S., Yoshihama M., Tanaka T. (1996). U14 snoRNAs are encoded in introns of human ribosomal protein S13 gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 228: 371—374. PMID 8920921 DOI:10.1006/bbrc.1996.1668
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11