EIF3D

EIF3D
Ідентифікатори
Символи	EIF3D, EIF3S7, eIF3-p66, eIF3-zeta, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D
Зовнішні ІД	OMIM: 603915 MGI: 1933181 HomoloGene: 2782 GeneCards: EIF3D
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • translation initiation factor activity • RNA binding • mRNA cap binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m • мембрана • eukaryotic translation initiation factor 3 complex • eukaryotic 43S preinitiation complex • eukaryotic 48S preinitiation complex Біологічний процес • formation of cytoplasmic translation initiation complex • viral translational termination-reinitiation • translational initiation • Біосинтез білків • IRES-dependent viral translational initiation • cap-dependent translational initiation • positive regulation of translation • positive regulation of mRNA binding • cytoplasmic translational initiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8664	55944
Ensembl	ENSG00000100353	ENSMUSG00000016554
UniProt	O15371	O70194
RefSeq (мРНК)	NM_003753	NM_018749
RefSeq (білок)	NP_003744	NP_061219
Локус (UCSC)	Хр. 22: 36.51 – 36.53 Mb	Хр. 15: 77.84 – 77.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EIF3D (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот, а молекулярна маса — 63 973.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKFMTPVIQ		DNPSGWGPCA		VPEQFRDMPY		QPFSKGDRLG		KVADWTGATY
QDKRYTNKYS		SQFGGGSQYA		YFHEEDESSF		QLVDTARTQK		TAYQRNRMRF
AQRNLRRDKD		RRNMLQFNLQ		ILPKSAKQKE		RERIRLQKKF		QKQFGVRQKW
DQKSQKPRDS		SVEVRSDWEV		KEEMDFPQLM		KMRYLEVSEP		QDIECCGALE
YYDKAFDRIT		TRSEKPLRSI		KRIFHTVTTT		DDPVIRKLAK		TQGNVFATDA
ILATLMSCTR		SVYSWDIVVQ		RVGSKLFFDK		RDNSDFDLLT		VSETANEPPQ
DEGNSFNSPR		NLAMEATYIN		HNFSQQCLRM		GKERYNFPNP		NPFVEDDMDK
NEIASVAYRY		RRWKLGDDID		LIVRCEHDGV		MTGANGEVSF		INIKTLNEWD
SRHCNGVDWR		QKLDSQRGAV		IATELKNNSY		KLARWTCCAL		LAGSEYLKLG
YVSRYHVKDS		SRHVILGTQQ		FKPNEFASQI		NLSVENAWGI		LRCVIDICMK
LEEGKYLILK		DPNKQVIRVY		SLPDGTFSSD		EDEEEEEEEE		EEEEEEET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Daughenbaugh K.F., Fraser C.S., Hershey J.W., Hardy M.E. (2003). The genome-linked protein VPg of the Norwalk virus binds eIF3, suggesting its role in translation initiation complex recruitment. EMBO J. 22: 2852—2859. PMID 12773399 DOI:10.1093/emboj/cdg251
• Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 DOI:10.1261/rna.7215305
• Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 DOI:10.1038/sj.emboj.7601765
• Poyry T.A., Kaminski A., Connell E.J., Fraser C.S., Jackson R.J. (2007). The mechanism of an exceptional case of reinitiation after translation of a long ORF reveals why such events do not generally occur in mammalian mRNA translation. Genes Dev. 21: 3149—3162. PMID 18056426 DOI:10.1101/gad.439507
• Yu X., Zheng B., Chai R. (2014). Lentivirus-mediated knockdown of eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D inhibits proliferation of HCT116 colon cancer cells. Biosci. Rep. 34: E00161—E00161. PMID 25370813 DOI:10.1042/BSR20140078

Див. також

• Хромосома 22