AGAP3

AGAP3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3IHW
Ідентифікатори
Символи	AGAP3, AGAP-3, CENTG3, CRAG, MRIP-1, cnt-g3, ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3
Зовнішні ІД	OMIM: 616813 MGI: 2183446 HomoloGene: 23742 GeneCards: AGAP3
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0006184 GTPase activity • polyubiquitin modification-dependent protein binding Клітинна компонента • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • cell periphery Біологічний процес • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	116988	213990
Ensembl	ENSG00000133612	ENSMUSG00000023353
UniProt	Q96P47 Q86ST5	Q8VHH5
RefSeq (мРНК)	NM_001042535 NM_001281300 NM_001308304 NM_001308305 NM_031946 NM_001350102 NM_001350103 NM_001350104	NM_001256431 NM_139153 NM_001359881
RefSeq (білок)	NP_001036000 NP_001268229 NP_001295233 NP_001295234 NP_114152 NP_001337031 NP_001337032 NP_001337033 NP_001036000.1 NP_001295233.1 NP_001295234.1	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 151.09 – 151.14 Mb	Хр. 5: 24.66 – 24.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AGAP3 (англ. ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 875 амінокислот, а молекулярна маса — 95 044.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNFQAGGGQS		PQQQQQLAGG		PPQQFALSNS		AAIRAEIQRF		ESVHPNIYAI
YDLIERIEDL		ALQNQIREHV		ISIEDSFVNS		QEWTLSRSVP		ELKVGIVGNL
SSGKSALVHR		YLTGTYVQEE		SPEGGRFKKE		IVVDGQSYLL		LIRDEGGPPE
LQFAAWVDAV		VFVFSLEDEI		SFQTVYNYFL		RLCSFRNASE		VPMVLVGTQD
AISAANPRVI		DDSRARKLST		DLKRCTYYET		CATYGLNVER		VFQDVAQKVV
ALRKKQQLAI		GPCKSLPNSP		SHSAVSAASI		PAVHINQATN		GGGSAFSDYS
SSVPSTPSIS		QRELRIETIA		ASSTPTPIRK		QSKRRSNIFT		SRKGADLDRE
KKAAECKVDS		IGSGRAIPIK		QGILLKRSGK		SLNKEWKKKY		VTLCDNGLLT
YHPSLHDYMQ		NIHGKEIDLL		RTTVKVPGKR		LPRATPATAP		GTSPRANGLS
VERSNTQLGG		GTGAPHSASS		ASLHSERPLS		SSAWAGPRPE		GLHQRSCSVS
SADQWSEATT		SLPPGMQHPA		SGPAEVLSSS		PKLDPPPSPH		SNRKKHRRKK
STGTPRPDGP		SSATEEAEES		FEFVVVSLTG		QTWHFEASTA		EERELWVQSV
QAQILASLQG		CRSAKDKTRL		GNQNAALAVQ		AVRTVRGNSF		CIDCDAPNPD
WASLNLGALM		CIECSGIHRH		LGAHLSRVRS		LDLDDWPPEL		LAVMTAMGNA
LANSVWEGAL		GGYSKPGPDA		CREEKERWIR		AKYEQKLFLA		PLPSSDVPLG
QQLLRAVVED		DLRLLVMLLA		HGSKEEVNET		YGDGDGRTAL		HLSSAMANVV
FTQLLIWYGV		DVRSRDARGL		TPLAYARRAG		SQECADILIQ		HGCPGEGCGL
APTPNREPAN		GTNPSAELHR		SPSLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Meurer S., Pioch S., Wagner K., Mueller-Esterl W., Gross S. (2004). AGAP1, a novel binding partner of nitric oxide-sensitive guanylyl cyclase. J. Biol. Chem. 279: 49346—49354. PMID 15381706 DOI:10.1074/jbc.M410565200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 7