AHCTF1

AHCTF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4I0O
Ідентифікатори
Символи	AHCTF1, ELYS, MST108, TMBS62, MSTP108, AT-hook containing transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610853 MGI: 1915033 HomoloGene: 9142 GeneCards: AHCTF1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • Ядерна мембрана • nuclear periphery • nuclear matrix • Ядерна пора • нуклеоплазма • хромосома • nuclear pore outer ring • Хроматин • екзосома • центромера • клітинне ядро • кінетохор • nuclear envelope Біологічний процес • mRNA transport • nuclear pore complex assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Цитокінез • поділ клітини • protein transport • клітинний цикл • sister chromatid cohesion • GO:0015915 транспорт • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cytokinesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25909	226747
Ensembl	ENSG00000153207	ENSMUSG00000026491
UniProt	Q8WYP5	Q8CJF7
RefSeq (мРНК)	NM_015446 NM_001323342 NM_001323343 NM_175865	NM_026375
RefSeq (білок)	NP_001310271 NP_001310272 NP_056261	NP_080651
Локус (UCSC)	Хр. 1: 246.84 – 246.93 Mb	Хр. 1: 179.57 – 179.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AHCTF1 (англ. AT-hook containing transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 266 амінокислот, а молекулярна маса — 252 498.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRDLRAQVTS		GLLPFPEVTL		QALGEDEITL		ESVLRGKFAA		GKNGLACLAC
GPQLEVVNSI		TGERLSAYRF		SGVNEQPPVV		LAVKEFSWQK		RTGLLIGLEE
TEGSVLCLYD		LGISKVVKAV		VLPGRVTAIE		PIINHGGASA		STQHLHPSLR
WLFGVAAVVT		DVGQILLVDL		CLDDLSCNQN		EVEASDLEVL		TGIPAEVPHI
RESVMRQGRH		LCFQLVSPTG		TAVSTLSYIS		RTNQLAVGFS		DGYLALWNMK
SMKREYYIQL		ESGQVPVYAV		TFQEPENDPR		NCCYLWAVQS		TQDSEGDVLS
LHLLQLAFGN		RKCLASGQIL		YEGLEYCEER		YTLDLTGGMF		PLRGQTSNTK
LLGCQSIEKF		RSHGDREEGV		NEALSPDTSV		SVFTWQVNIY		GQGKPSVYLG
LFDINRWYHA		QMPDSLRSGE		YLHNCSYFAL		WSLESVVSRT		SPHGILDILV
HERSLNRGVP		PSYPPPEQFF		NPSTYNFDAT		CLLNSGVVHL		TCTGFQKETL
TFLKKSGPSL		NELIPDGYNR		CLVAGLLSPR		FVDVQPSSLS		QEEQLEAILS
AAIQTSSLGL		LTGYIRRWIT		EEQPNSATNL		RFVLEWTWNK		VVLTKEEFDR
LCVPLFDGSC		HFMDPQTIQS		IQQCYLLLSN		LNIVLSCFAS		EAREITERGL
IDLSNKFVVS		HLICQYAQVV		LWFSHSGLLP		EGIDDSVQLS		RLCYNYPVIQ
NYYTSRRQKF		ERLSRGKWNP		DCLMIDGLVS		QLGERIEKLW		KRDEGGTGKY
PPASLHAVLD		MYLLDGVTEA		AKHSITIYLL		LDIMYSFPNK		TDTPIESFPT
VFAISWGQVK		LIQGFWLIDH		NDYESGLDLL		FHPATAKPLS		WQHSKIIQAF
MSQGEHRQAL		RYIQTMKPTV		SSGNDVILHL		TVLLFNRCMV		EAWNFLRQHC
NRLNIEELLK		HMYEVCQEMG		LMEDLLKLPF		TDTEQECLVK		FLQSSASVQN
HEFLLVHHLQ		RANYVPALKL		NQTLKINVMN		DRDPRLRERS		LARNSILDQY
GKILPRVHRK		LAIERAKPYH		LSTSSVFRLV		SRPKPLSAVP		KQVVTGTVLT
RSVFINNVLS		KIGEVWASKE		PINSTTPFNS		SKIEEPSPIV		YSLPAPELPE
AFFGTPISKA		SQKISRLLDL		VVQPVPRPSQ		CSEFIQQSSM		KSPLYLVSRS
LPSSSQLKGS		PQAISRASEL		HLLETPLVVK		KAKSLAMSVT		TSGFSEFTPQ
SILRSTLRST		PLASPSPSPG		RSPQRLKETR		ISFVEEDVHP		KWIPGAADDS
KLEVFTTPKK		CAVPVETEWL		KSKDRTTSFF		LNSPEKEHQE		MDEGSQSLEK
LDVSKGNSSV		SITSDETTLE		YQDAPSPEDL		EETVFTASKP		KSSSTALTTN
VTEQTEKDGD		KDVFASEVTP		SDLQKQMGNL		EDAETKDLLV		AAEAFSELNH
LSPVQGTEAS		LCAPSVYEGK		IFTQKSKVPV		LDEGLTSVET		YTPAIRANDN
KSMADVLGDG		GNSSLTISEG		PIVSERRLNQ		EVALNLKEDH		EVEVGVLKES
VDLPEEKLPI		SDSPPDTQEI		HVIEQEKLEA		QDSGEEARNL		SFNELYPSGT
LKLQYNFDTI		DQQFCDLADN		KDTAECDIAE		VDGELFVAQS		NFTLILEGEE
GEVEPGDFAS		SDVLPKAANT		ATEEKLVCSG		ENDNHGQIAN		LPSAVTSDQK
SQKVDTLPYV		PEPIKVAIAE		NLLDVIKDTR		SKEITSDTME		QSIHETIPLV
SQNIMCPTKL		VKSAFKTAQE		TSTMTMNVSQ		VDDVVSSKTR		TRGQRIQNVN
VKSAQQEASA		DVATPKMPGQ		SVRKKTRKAK		EISEASENIY		SDVRGLSQNQ
QIPQNSVTPR		RGRRKKEVNQ		DILENTSSVE		QELQITTGRE		SKRLKSSQLL
EPAVEETTKK		EVKVSSVTKR		TPRRIKRSVE		NQESVEIIND		LKVSTVTSPS
RMIRKLRSTN		LDASENTGNK		QDDKSSDKQL		RIKHVRRVRG		REVSPSDVRE
DSNLESSQLT		VQAEFDMSAI		PRKRGRPRKI		NPSEDVGSKA		VKEERSPKKK
EAPSIRRRST		RNTPAKSENV		DVGKPALGKS		ILVPNEELSM		VMSSKKKLTK
KTESQSQKRS		LHSVSEERTD		EMTHKETNEQ		EERLLATASF		TKSSRSSRTR
SSKAILLPDL		SEPNNEPLFS		PASEVPRKAK		AKKIEVPAQL		KELVSDLSSQ
FVISPPALRS		RQKNTSNKNK		LEDELKDDAQ		SVETLGKPKA		KRIRTSKTKQ
ASKNTEKESA		WSPPPIEIRL		ISPLASPADG		VKSKPRKTTE		VTGTGLGRNR
KKLSSYPKQI		LRRKML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, транспорт мРНК, транслокація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Rasala B.A., Orjalo A.V., Shen Z., Briggs S., Forbes D.J. (2006). ELYS is a dual nucleoporin/kinetochore protein required for nuclear pore assembly and proper cell division. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 17801—17806. PMID 17098863 DOI:10.1073/pnas.0608484103

Див. також

• Хромосома 1