AKAP13

AKAP13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DRN, 2LG1, 4D0N, 4D0O
Ідентифікатори
Символи	AKAP13, A kinase (PRKA) anchor protein 13, AKAP-13, AKAP-Lbc, ARHGEF13, BRX, HA-3, Ht31, LBC, PRKA13, PROTO-LB, PROTO-LBC, c-lbc, p47, A-kinase anchoring protein 13, A-kinase anchor protein 13
Зовнішні ІД	OMIM: 604686 MGI: 2676556 HomoloGene: 4903 GeneCards: AKAP13
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • MAP-kinase scaffold activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0032947 molecular adaptor activity • protein kinase A binding • signal transducer activity • cAMP-dependent protein kinase activity Клітинна компонента • мембрана • гіалоплазма • actin cytoskeleton • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • cell cortex • Мікрофіламенти • cortical actin cytoskeleton • цитоплазма • внутрішньоклітинний Біологічний процес • regulation of cardiac muscle hypertrophy • bone development • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of glucocorticoid mediated signaling pathway • positive regulation of Rho protein signal transduction • regulation of sarcomere organization • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • adrenergic receptor signaling pathway • regulation of small GTPase mediated signal transduction • adenylate cyclase-activating adrenergic receptor signaling pathway involved in heart process • heart development • positive regulation of apoptotic process • cardiac muscle cell differentiation • regulation of Rho protein signal transduction • protein phosphorylation • regulation of protein kinase activity • nuclear export • G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of MAP kinase activity • cell growth involved in cardiac muscle cell development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11214	75547
Ensembl	ENSG00000170776	ENSMUSG00000066406
UniProt	Q12802	E9Q394
RefSeq (мРНК)	NM_144767 NM_001270546 NM_006738 NM_007200 NM_032162	NM_029332
RefSeq (білок)	NP_001257475 NP_006729 NP_009131	NP_083608
Локус (UCSC)	Хр. 15: 85.38 – 85.75 Mb	Хр. 7: 75.46 – 75.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AKAP13 (англ. A-kinase anchoring protein 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 813 амінокислот, а молекулярна маса — 307 550.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLNPQQAPL		YGDCVVTVLL		AEEDKAEDDV		VFYLVFLGST		LRHCTSTRKV
SSDTLETIAP		GHDCCETVKV		QLCASKEGLP		VFVVAEEDFH		FVQDEAYDAA
QFLATSAGNQ		QALNFTRFLD		QSGPPSGDVN		SLDKKLVLAF		RHLKLPTEWN
VLGTDQSLHD		AGPRETLMHF		AVRLGLLRLT		WFLLQKPGGR		GALSIHNQEG
ATPVSLALER		GYHKLHQLLT		EENAGEPDSW		SSLSYEIPYG		DCSVRHHREL
DIYTLTSESD		SHHEHPFPGD		GCTGPIFKLM		NIQQQLMKTN		LKQMDSLMPL
MMTAQDPSSA		PETDGQFLPC		APEPTDPQRL		SSSEETESTQ		CCPGSPVAQT
ESPCDLSSIV		EEENTDRSCR		KKNKGVERKG		EEVEPAPIVD		SGTVSDQDSC
LQSLPDCGVK		GTEGLSSCGN		RNEETGTKSS		GMPTDQESLS		SGDAVLQRDL
VMEPGTAQYS		SGGELGGIST		TNVSTPDTAG		EMEHGLMNPD		ATVWKNVLQG
GESTKERFEN		SNIGTAGASD		VHVTSKPVDK		ISVPNCAPAA		SSLDGNKPAE
SSLAFSNEET		STEKTAETET		SRSREESADA		PVDQNSVVIP		AAAKDKISDG
LEPYTLLAAG		IGEAMSPSDL		ALLGLEEDVM		PHQNSETNSS		HAQSQKGKSS
PICSTTGDDK		LCADSACQQN		TVTSSGDLVA		KLCDNIVSES		ESTTARQPSS
QDPPDASHCE		DPQAHTVTSD		PVRDTQERAD		FCPFKVVDNK		GQRKDVKLDK
PLTNMLEVVS		HPHPVVPKME		KELVPDQAVI		SDSTFSLANS		PGSESVTKDD
ALSFVPSQKE		KGTATPELHT		ATDYRDGPDG		NSNEPDTRPL		EDRAVGLSTS
STAAELQHGM		GNTSLTGLGG		EHEGPAPPAI		PEALNIKGNT		DSSLQSVGKA
TLALDSVLTE		EGKLLVVSES		SAAQEQDKDK		AVTCSSIKEN		ALSSGTLQEE
QRTPPPGQDT		QQFHEKSISA		DCAKDKALQL		SNSPGASSAF		LKAETEHNKE
VAPQVSLLTQ		GGAAQSLVPP		GASLATESRQ		EALGAEHNSS		ALLPCLLPDG
SDGSDALNCS		QPSPLDVGVK		NTQSQGKTSA		CEVSGDVTVD		VTGVNALQGM
AEPRRENISH		NTQDILIPNV		LLSQEKNAVL		GLPVALQDKA		VTDPQGVGTP
EMIPLDWEKG		KLEGADHSCT		MGDAEEAQID		DEAHPVLLQP		VAKELPTDME
LSAHDDGAPA		GVREVMRAPP		SGRERSTPSL		PCMVSAQDAP		LPKGADLIEE
AASRIVDAVI		EQVKAAGALL		TEGEACHMSL		SSPELGPLTK		GLESAFTEKV
STFPPGESLP		MGSTPEEATG		SLAGCFAGRE		EPEKIILPVQ		GPEPAAEMPD
VKAEDEVDFR		ASSISEEVAV		GSIAATLKMK		QGPMTQAINR		ENWCTIEPCP
DAASLLASKQ		SPECENFLDV		GLGRECTSKQ		GVLKRESGSD		SDLFHSPSDD
MDSIIFPKPE		EEHLACDITG		SSSSTDDTAS		LDRHSSHGSD		VSLSQILKPN
RSRDRQSLDG		FYSHGMGAEG		RESESEPADP		GDVEEEEMDS		ITEVPANCSV
LRSSMRSLSP		FRRHSWGPGK		NAASDAEMNH		RSSMRVLGDV		VRRPPIHRRS
FSLEGLTGGA		GVGNKPSSSL		EVSSANAEEL		RHPFSGEERV		DSLVSLSEED
LESDQREHRM		FDQQICHRSK		QQGFNYCTSA		ISSPLTKSIS		LMTISHPGLD
NSRPFHSTFH		NTSANLTESI		TEENYNFLPH		SPSKKDSEWK		SGTKVSRTFS
YIKNKMSSSK		KSKEKEKEKD		KIKEKEKDSK		DKEKDKKTVN		GHTFSSIPVV
GPISCSQCMK		PFTNKDAYTC		ANCSAFVHKG		CRESLASCAK		VKMKQPKGSL
QAHDTSSLPT		VIMRNKPSQP		KERPRSAVLL		VDETATTPIF		ANRRSQQSVS
LSKSVSIQNI		TGVGNDENMS		NTWKFLSHST		DSLNKISKVN		ESTESLTDEG
VGTDMNEGQL		LGDFEIESKQ		LEAESWSRII		DSKFLKQQKK		DVVKRQEVIY
ELMQTEFHHV		RTLKIMSGVY		SQGMMADLLF		EQQMVEKLFP		CLDELISIHS
QFFQRILERK		KESLVDKSEK		NFLIKRIGDV		LVNQFSGENA		ERLKKTYGKF
CGQHNQSVNY		FKDLYAKDKR		FQAFVKKKMS		SSVVRRLGIP		ECILLVTQRI
TKYPVLFQRI		LQCTKDNEVE		QEDLAQSLSL		VKDVIGAVDS		KVASYEKKVR
LNEIYTKTDS		KSIMRMKSGQ		MFAKEDLKRK		KLVRDGSVFL		KNAAGRLKEV
QAVLLTDILV		FLQEKDQKYI		FASLDQKSTV		ISLKKLIVRE		VAHEEKGLFL
ISMGMTDPEM		VEVHASSKEE		RNSWIQIIQD		TINTLNRDED		EGIPSENEEE
KKMLDTRARE		LKEQLHQKDQ		KILLLLEEKE		MIFRDMAECS		TPLPEDCSPT
HSPRVLFRSN		TEEALKGGPL		MKSAINEVEI		LQGLVSGNLG		GTLGPTVSSP
IEQDVVGPVS		LPRRAETFGG		FDSHQMNASK		GGEKEEGDDG		QDLRRTESDS
GLKKGGNANL		VFMLKRNSEQ		VVQSVVHLYE		LLSALQGVVL		QQDSYIEDQK
LVLSERALTR		SLSRPSSLIE		QEKQRSLEKQ		RQDLANLQKQ		QAQYLEEKRR
REREWEARER		ELREREALLA		QREEEVQQGQ		QDLEKEREEL		QQKKGTYQYD
LERLRAAQKQ		LEREQEQLRR		EAERLSQRQT		ERDLCQVSHP		HTKLMRIPSF
FPSPEEPPSP		SAPSIAKSGS		LDSELSVSPK		RNSISRTHKD		KGPFHILSST
SQTNKGPEGQ		SQAPASTSAS		TRLFGLTKPK		EKKEKKKKNK		TSRSQPGDGP
ASEVSAEGEE		IFC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• Diviani D., Soderling J., Scott J.D. (2001). AKAP-Lbc anchors protein kinase A and nucleates Galpha 12-selective Rho-mediated stress fiber formation. J. Biol. Chem. 276: 44247—44257. PMID 11546812 DOI:10.1074/jbc.M106629200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Driggers P.H., Segars J.H., Rubino D.M. (2001). The proto-oncoprotein Brx activates estrogen receptor beta by a p38 mitogen-activated protein kinase pathway. J. Biol. Chem. 276: 46792—46797. PMID 11579095 DOI:10.1074/jbc.M106927200
• Iwashita S., Fujii M., Mukai H., Ono Y., Miyamoto M. (2004). Lbc proto-oncogene product binds to and could be negatively regulated by metastasis suppressor nm23-H2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 320: 1063—1068. PMID 15249197 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.06.067
• Diviani D., Abuin L., Cotecchia S., Pansier L. (2004). Anchoring of both PKA and 14-3-3 inhibits the Rho-GEF activity of the AKAP-Lbc signaling complex. EMBO J. 23: 2811—2820. PMID 15229649 DOI:10.1038/sj.emboj.7600287
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 15