AMIGO2

AMIGO2
Ідентифікатори
Символи	AMIGO2, ALI1, AMIGO-2, DEGA, adhesion molecule with Ig-like domain 2, adhesion molecule with Ig like domain 2
Зовнішні ІД	OMIM: 615690 MGI: 2145995 HomoloGene: 18649 GeneCards: AMIGO2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро Біологічний процес • negative regulation of programmed cell death • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адгезія клітин • negative regulation of apoptotic process • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • positive regulation of synapse assembly • brain development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	347902	105827
Ensembl	ENSG00000139211	ENSMUSG00000048218
UniProt	Q86SJ2	Q80ZD9
RefSeq (мРНК)	NM_001143668 NM_181847 NM_001370299	NM_001164563 NM_001164602 NM_178114
RefSeq (білок)	NP_001137140 NP_862830 NP_001357228 NP_001137140.1 NP_862830.1	NP_001158035 NP_001158074 NP_835215
Локус (UCSC)	Хр. 12: 47.08 – 47.08 Mb	Хр. 15: 97.14 – 97.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AMIGO2 (англ. Adhesion molecule with Ig like domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 57 934.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLRVHTLPT		LLGAVVRPGC		RELLCLLMIT		VTVGPGASGV		CPTACICATD
IVSCTNKNLS		KVPGNLFRLI		KRLDLSYNRI		GLLDSEWIPV		SFAKLNTLIL
RHNNITSIST		GSFSTTPNLK		CLDLSSNKLK		TVKNAVFQEL		KVLEVLLLYN
NHISYLDPSA		FGGLSQLQKL		YLSGNFLTQF		PMDLYVGRFK		LAELMFLDVS
YNRIPSMPMH		HINLVPGKQL		RGIYLHGNPF		VCDCSLYSLL		VFWYRRHFSS
VMDFKNDYTC		RLWSDSRHSR		QVLLLQDSFM		NCSDSIINGS		FRALGFIHEA
QVGERLMVHC		DSKTGNANTD		FIWVGPDNRL		LEPDKEMENF		YVFHNGSLVI
ESPRFEDAGV		YSCIAMNKQR		LLNETVDVTI		NVSNFTVSRS		HAHEAFNTAF
TTLAACVASI		VLVLLYLYLT		PCPCKCKTKR		QKNMLHQSNA		HSSILSPGPA
SDASADERKA		GAGKRVVFLE		PLKDTAAGQN		GKVRLFPSEA		VIAEGILKST
RGKSDSDSVN		SVFSDTPFVA		ST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані.

Література

• Kuja-Panula J., Kiiltomaeki M., Yamashiro T., Rouhiainen A., Rauvala H. (2003). AMIGO, a transmembrane protein implicated in axon tract development, defines a novel protein family with leucine-rich repeats. J. Cell Biol. 160: 963—973. PMID 12629050 DOI:10.1083/jcb.200209074
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ono T., Sekino-Suzuki N., Kikkawa Y., Yonekawa H., Kawashima S. (2003). Alivin 1, a novel neuronal activity-dependent gene, inhibits apoptosis and promotes survival of cerebellar granule neurons. J. Neurosci. 23: 5887—5896. PMID 12843293

Див. також

• Хромосома 12