APOBEC3B
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
APOBEC3B (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 382 амінокислот, а молекулярна маса — 45 924[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNPQIRNPME | RMYRDTFYDN | FENEPILYGR | SYTWLCYEVK | IKRGRSNLLW | ||||
DTGVFRGQVY | FKPQYHAEMC | FLSWFCGNQL | PAYKCFQITW | FVSWTPCPDC | ||||
VAKLAEFLSE | HPNVTLTISA | ARLYYYWERD | YRRALCRLSQ | AGARVTIMDY | ||||
EEFAYCWENF | VYNEGQQFMP | WYKFDENYAF | LHRTLKEILR | YLMDPDTFTF | ||||
NFNNDPLVLR | RRQTYLCYEV | ERLDNGTWVL | MDQHMGFLCN | EAKNLLCGFY | ||||
GRHAELRFLD | LVPSLQLDPA | QIYRVTWFIS | WSPCFSWGCA | GEVRAFLQEN | ||||
THVRLRIFAA | RIYDYDPLYK | EALQMLRDAG | AQVSIMTYDE | FEYCWDTFVY | ||||
RQGCPFQPWD | GLEEHSQALS | GRLRAILQNQ | GN |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.
- Rose K.M., Marin M., Kozak S.L., Kabat D. (2005). Regulated production and anti-HIV type 1 activities of cytidine deaminases APOBEC3B, 3F, and 3G. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 21: 611—619. PMID 16060832 DOI:10.1089/aid.2005.21.611
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business. Trends Genet. 19: 207—216. PMID 12683974 DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
- Hakata Y., Landau N.R. (2006). Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains. J. Biol. Chem. 281: 36624—36631. PMID 17020885 DOI:10.1074/jbc.M604980200
- Wichroski M.J., Robb G.B., Rana T.M. (2006). Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies. PLoS Pathog. 2: E41—E41. PMID 16699599 DOI:10.1371/journal.ppat.0020041
- Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements. Annu. Rev. Immunol. 26: 317—353. PMID 18304004 DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17352 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UH17 (англ.) . Архів оригіналу за 17 лютого 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |