ARHGAP21

ARHGAP21
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DHJ, 2J59, 2YUY
Ідентифікатори
Символи	ARHGAP21, ARHGAP10, Rho GTPase activating protein 21
Зовнішні ІД	OMIM: 609870 MGI: 1918685 HomoloGene: 10822 GeneCards: ARHGAP21
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • Golgi membrane • cytoplasmic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • цитоплазма • цитоскелет • гіалоплазма • клітинна мембрана • actin cytoskeleton • міжклітинні контакти Біологічний процес • establishment of Golgi localization • Golgi organization • organelle transport along microtubule • maintenance of Golgi location • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of small GTPase mediated signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57584	71435
Ensembl	ENSG00000107863	ENSMUSG00000036591
UniProt	Q5T5U3	Q6DFV3
RefSeq (мРНК)	NM_020824	NM_001081364 NM_001128084
RefSeq (білок)	NP_065875 NP_001354376 NP_001354377 NP_001354378 NP_001354379 NP_001354380 NP_001354381 NP_001354382 NP_001354383 NP_001354384	NP_001074833 NP_001121556 NP_001395248 NP_001395249 NP_001395250 NP_001395251 NP_001395252 NP_001395253 NP_001395254
Локус (UCSC)	Хр. 10: 24.58 – 24.72 Mb	Хр. 2: 20.85 – 20.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGAP21 (англ. Rho GTPase activating protein 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 957 амінокислот, а молекулярна маса — 217 331.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATRRTGLSE		GDGDKLKACE		VSKNKDGKEQ		SETVSLSEDE		TFSWPGPKTV
TLKRTSQGFG		FTLRHFIVYP		PESAIQFSYK		DEENGNRGGK		QRNRLEPMDT
IFVKQVKEGG		PAFEAGLCTG		DRIIKVNGES		VIGKTYSQVI		ALIQNSDTTL
ELSVMPKDED		ILQVLQFTKD		VTALAYSQDA		YLKGNEAYSG		NARNIPEPPP
ICYPWLPSAP		SAMAQPVEIS		PPDSSLSKQQ		TSTPVLTQPG		RAYRMEIQVP
PSPTDVAKSN		TAVCVCNESV		RTVIVPSEKV		VDLLSNRNNH		TGPSHRTEEV
RYGVSEQTSL		KTVSRTTSPP		LSIPTTHLIH		QPAGSRSLEP		SGILLKSGNY
SGHSDGISSS		RSQAVEAPSV		SVNHYSPNSH		QHIDWKNYKT		YKEYIDNRRL
HIGCRTIQER		LDSLRAASQS		TTDYNQVVPN		RTTLQGRRRS		TSHDRVPQSV
QIRQRSVSQE		RLEDSVLMKY		CPRSASQGAL		TSPSVSFSNH		RTRSWDYIEG
QDETLENVNS		GTPIPDSNGE		KKQTYKWSGF		TEQDDRRGIC		ERPRQQEIHK
SFRGSNFTVA		PSVVNSDNRR		MSGRGVGSVS		QFKKIPPDLK		TLQSNRNFQT
TCGMSLPRGI		SQDRSPLVKV		RSNSLKAPST		HVTKPSFSQK		SFVSIKDQRP
VNHLHQNSLL		NQQTWVRTDS		APDQQVETGK		SPSLSGASAK		PAPQSSENAG
TSDLELPVSQ		RNQDLSLQEA		ETEQSDTLDN		KEAVILREKP		PSGRQTPQPL
RHQSYILAVN		DQETGSDTTC		WLPNDARREV		HIKRMEERKA		SSTSPPGDSL
ASIPFIDEPT		SPSIDHDIAH		IPASAVISAS		TSQVPSIATV		PPCLTTSAPL
IRRQLSHDHE		SVGPPSLDAQ		PNSKTERSKS		YDEGLDDYRE		DAKLSFKHVS
SLKGIKIADS		QKSSEDSGSR		KDSSSEVFSD		AAKEGWLHFR		PLVTDKGKRV
GGSIRPWKQM		YVVLRGHSLY		LYKDKREQTT		PSEEEQPISV		NACLIDISYS
ETKRKNVFRL		TTSDCECLFQ		AEDRDDMLAW		IKTIQESSNL		NEEDTGVTNR
DLISRRIKEY		NNLMSKAEQL		PKTPRQSLSI		RQTLLGAKSE		PKTQSPHSPK
EESERKLLSK		DDTSPPKDKG		TWRKGIPSIM		RKTFEKKPTA		TGTFGVRLDD
CPPAHTNRYI		PLIVDICCKL		VEERGLEYTG		IYRVPGNNAA		ISSMQEELNK
GMADIDIQDD		KWRDLNVISS		LLKSFFRKLP		EPLFTNDKYA		DFIEANRKED
PLDRLKTLKR		LIHDLPEHHY		ETLKFLSAHL		KTVAENSEKN		KMEPRNLAIV
FGPTLVRTSE		DNMTHMVTHM		PDQYKIVETL		IQHHDWFFTE		EGAEEPLTTV
QEESTVDSQP		VPNIDHLLTN		IGRTGVSPGD		VSDSATSDST		KSKGSWGSGK
DQYSRELLVS		SIFAAASRKR		KKPKEKAQPS		SSEDELDNVF		FKKENVEQCH
NDTKEESKKE		SETLGRKQKI		IIAKENSTRK		DPSTTKDEKI		SLGKESTPSE
EPSPPHNSKH		NKSPTLSCRF		AILKESPRSL		LAQKSSHLEE		TGSDSGTLLS
TSSQASLARF		SMKKSTSPET		KHSEFLANVS		TITSDYSTTS		SATYLTSLDS
SRLSPEVQSV		AESKGDEADD		ERSELISEGR		PVETDSESEF		PVFPTALTSE
RLFRGKLQEV		TKSSRRNSEG		SELSCTEGSL		TSSLDSRRQL		FSSHKLIECD
TLSRKKSARF		KSDSGSLGDA		KNEKEAPSLT		KVFDVMKKGK		STGSLLTPTR
GESEKQEPTW		KTKIADRLKL		RPRAPADDMF		GVGNHKVNAE		TAKRKSIRRR
HTLGGHRDAT		EISVLNFWKV		HEQSGERESE		LSAVNRLKPK		CSAQDLSISD
WLARERLRTS		TSDLSRGEIG		DPQTENPSTR		EIATTDTPLS		LHCNTGSSSS
TLASTNRPLL		SIPPQSPDQI		NGESFQNVSK		NASSAANAQP		HKLSETPGSK
AEFHPCL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• Basseres D.S., Tizzei E.V., Duarte A.A.S., Costa F.F., Saad S.T.O. (2002). ARHGAP10, a novel human gene coding for a potentially cytoskeletal Rho-GTPase activating protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 294: 579—585. PMID 12056806 DOI:10.1016/S0006-291X(02)00514-4
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Klein S., Franco M., Chardin P., Luton F. (2006). Role of the Arf6 GDP/GTP cycle and Arf6 GTPase-activating proteins in actin remodeling and intracellular transport. J. Biol. Chem. 281: 12352—12361. PMID 16527809 DOI:10.1074/jbc.M601021200
• Katoh M., Katoh M. (2004). Characterization of human ARHGAP10 gene in silico. Int. J. Oncol. 25: 1201—1206. PMID 15375573

Див. також

• Хромосома 10