ARHGAP6

ARHGAP6
Ідентифікатори
Символи	ARHGAP6, RHOGAP6, RHOGAPX-1, Rho GTPase activating protein 6
Зовнішні ІД	OMIM: 300118 MGI: 1196332 HomoloGene: 7630 GeneCards: ARHGAP6
Онтологія гена Молекулярна функція • phospholipase binding • SH3 domain binding • phospholipase activator activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мікрофіламент • actin cytoskeleton Біологічний процес • actin filament organization • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • activation of phospholipase C activity • positive regulation of phospholipase activity • focal adhesion assembly • actin filament polymerization • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • Rho protein signal transduction • negative regulation of stress fiber assembly • regulation of small GTPase mediated signal transduction • negative regulation of focal adhesion assembly • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	395	11856
Ensembl	ENSG00000047648	ENSMUSG00000031355
UniProt	O43182	O54834
RefSeq (мРНК)	NM_001174 NM_001287242 NM_006125 NM_013422 NM_013423 NM_013427	NM_001287530 NM_009707 NM_178754
RefSeq (білок)	NP_001274171 NP_006116 NP_038267 NP_038286	NP_001274459 NP_033837 NP_848869
Локус (UCSC)	Хр. X: 11.12 – 11.67 Mb	Хр. X: 167.58 – 168.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGAP6 (англ. Rho GTPase activating protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 974 амінокислот, а молекулярна маса — 105 947.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAQSLLHSV		FSCSSPASSS		AASAKGFSKR		KLRQTRSLDP		ALIGGCGSDE
AGAEGSARGA		TAGRLYSPSL		PAESLGPRLA		SSSRGPPPRA		TRLPPPGPLC
SSFSTPSTPQ		EKSPSGSFHF		DYEVPLGRGG		LKKSMAWDLP		SVLAGPASSR
SASSILCSSG		GGPNGIFASP		RRWLQQRKFQ		SPPDSRGHPY		VVWKSEGDFT
WNSMSGRSVR		LRSVPIQSLS		ELERARLQEV		AFYQLQQDCD		LSCQITIPKD
GQKRKKSLRK		KLDSLGKEKN		KDKEFIPQAF		GMPLSQVIAN		DRAYKLKQDL
QRDEQKDASD		FVASLLPFGN		KRQNKELSSS		NSSLSSTSET		PNESTSPNTP
EPAPRARRRG		AMSVDSITDL		DDNQSRLLEA		LQLSLPAEAQ		SKKEKARDKK
LSLNPIYRQV		PRLVDSCCQH		LEKHGLQTVG		IFRVGSSKKR		VRQLREEFDR
GIDVSLEEEH		SVHDVAALLK		EFLRDMPDPL		LTRELYTAFI		NTLLLEPEEQ
LGTLQLLIYL		LPPCNCDTLH		RLLQFLSIVA		RHADDNISKD		GQEVTGNKMT
SLNLATIFGP		NLLHKQKSSD		KEFSVQSSAR		AEESTAIIAV		VQKMIENYEA
LFMVPPDLQN		EVLISLLETD		PDVVDYLLRR		KASQSSSPDM		LQSEVSFSVG
GRHSSTDSNK		ASSGDISPYD		NNSPVLSERS		LLAMQEDAAP		GGSEKLYRVP
GQFMLVGHLS		SSKSRESSPG		PRLGKDLSEE		PFDIWGTWHS		TLKSGSKDPG
MTGSSGDIFE		SSSLRAGPCS		LSQGNLSPNW		PRWQGSPAEL		DSDTQGARRT
QAAAPATEGR		AHPAVSRACS		TPHVQVAGKA		ERPTARSEQY		LTLSGAHDLS
ESELDVAGLQ		SRATPQCQRP		HGSGRDDKRP		PPPYPGPGKP		AAAAAWIQGP
PEGVETPTDQ		GGQAAEREQQ		VTQKKLSSAN		SLPAGEQDSP		RLGDAGWLDW
QRERWQIWEL		LSTDNPDALP		ETLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Schaefer L., Prakash S.K., Zoghbi H.Y. (1997). Cloning and characterization of a novel rho-type GTPase-activating protein gene (ARHGAP6) from the critical region for microphthalmia with linear skin defects. Genomics. 46: 268—277. PMID 9417914 DOI:10.1006/geno.1997.5040
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома X