ARHGEF5

ARHGEF5
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF5, GEF5, P60, TIM, TIM1, Rho guanine nucleotide exchange factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 600888 MGI: 1858952 HomoloGene: 66300 GeneCards: ARHGEF5
Онтологія гена Молекулярна функція • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • cell projection • клітинна мембрана • нуклеоплазма • міжклітинні контакти • podosome • клітинне ядро • cell periphery • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of actin cytoskeleton organization • positive regulation of JUN kinase activity • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of podosome assembly • myeloid dendritic cell chemotaxis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of protein import • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of cytoskeleton organization • actin cytoskeleton organization • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of apoptotic process • regulation of small GTPase mediated signal transduction • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7984	54324
Ensembl	ENSG00000050327	ENSMUSG00000033542
UniProt	Q12774	E9Q7D5
RefSeq (мРНК)	NM_001002861 NM_005435	NM_133674
RefSeq (білок)	NP_005426	NP_598435
Локус (UCSC)	Хр. 7: 144.36 – 144.38 Mb	Хр. 6: 43.24 – 43.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGEF5 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 597 амінокислот, а молекулярна маса — 176 799.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAEEAQRGA		SPPISAIEEF		SIIPEAPMRS		SQVSALGLEA		QEDEDPSYKW
REEHRLSATQ		QSELRDVCDY		AIETMPSFPK		EGSADVEPNQ		ESLVAEACDT
PEHWEAVPQS		LAGRQARTLA		PPELWACPIQ		SEHLDMAPFS		SDLGSEEEEV
EFWPGLTSLT		LGSGQAEEEE		ETSSDNSGQT		RYYSPCEEHP		AETNQNEGSE
SGTIRQGEEL		PPEELQESQG		LLHPQEVQVL		EEQGQQEAGF		RGEGTLREDV
CADGLLGEEQ		MIEQVNDEKG		EQKQKQEQVQ		DVMLGRQGER		MGLTGEPEGL
NDGEWEQEDM		ERKAQGQGGP		EQGEERKREL		QVPEENRADS		QDEKSQTFLG
KSEEVTGKQE		DHGIKEKGVP		VSGQEAKEPE		SWDGGRLGAV		GRARSREEEN
EHHGPSMPAL		IAPEDSPHCD		LFPGASYLMT		QIPGTQTESR		AEELSPAALS
PSLEPIRCSH		QPISLLGSFL		TEESPDKEID		QNSQQEESRL		RKGTVSSQGT
EVVFASASVT		PPRTPDSAPP		SPAEAYPITP		ASVSARPPVA		FPRRETSCAA
RAPETASAPL		SMDDPSPCGT		SEMCPAALYG		FPSTGTSPPR		PPANSTGTVQ
HLRSDSFPGS		HRTEQTPDLV		GMLLSYSHSE		LPQRPPKPAI		YSSVTPRRDR
RSGRDYSTVS		ASPTALSTLK		QDSQESISNL		ERPSSPPSIQ		PWVSPHNPAF
ATESPAYGSS		PSFVSMEDVR		IHEPLPPPPP		QRRDTHPSVV		ETDGHARVVV
PTLKQHSHPP		PLALGSGLHA		PHKGPLPQAS		DPAVARQHRP		LPSTPDSSHH
AQATPRWRYN		KPLPPTPDLP		QPHLPPISAP		GSSRIYRPLP		PLPIIDPPTE
PPPLPPKSRG		RSRSTRGGHM		NSGGHAKTRP		ACQDWTVPLP		ASAGRTSWPP
ATARSTESFT		STSRSKSEVS		PGMAFSNMTN		FLCPSSPTTP		WTPELQGPTS
KDEAGVSEHP		EAPAREPLRR		TTPQQGASGP		GRSPVGQARQ		PEKPSHLHLE
KASSWPHRRD		SGRPPGDSSG		QAVAPSEGAN		KHKGWSRQGL		RRPSILPEGS
SDSRGPAVEK		HPGPSDTVVF		REKKPKEVMG		GFSRRCSKLI		NSSQLLYQEY
SDVVLNKEIQ		SQQRLESLSE		TPGPSSPRQP		RKALVSSESY		LQRLSMASSG
SLWQEIPVVR		NSTVLLSMTH		EDQKLQEVKF		ELIVSEASYL		RSLNIAVDHF
QLSTSLRATL		SNQEHQWLFS		RLQDVRDVSA		TFLSDLEENF		ENNIFSFQVC
DVVLNHAPDF		RRVYLPYVTN		QTYQERTFQS		LMNSNSNFRE		VLEKLESDPV
CQRLSLKSFL		ILPFQRITRL		KLLLQNILKR		TQPGSSEEAE		ATKAHHALEQ
LIRDCNNNVQ		SMRRTEELIY		LSQKIEFECK		IFPLISQSRW		LVKSGELTAL
EFSASPGLRR		KLNTRPVHLH		LFNDCLLLSR		PREGSRFLVF		DHAPFSSIRG
EKCEMKLHGP		HKNLFRLFLR		QNTQGAQAEF		LFRTETQSEK		LRWISALAMP
REELDLLECY		NSPQVQCLRA		YKPRENDELA		LEKADVVMVT		QQSSDGWLEG
VRLSDGERGW		FPVQQVEFIS		NPEVRAQNLK		EAHRVKTAKL		QLVEQQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Xie X., Chang S.W., Tatsumoto T., Chan A.M., Miki T. (2005). TIM, a Dbl-related protein, regulates cell shape and cytoskeletal organization in a Rho-dependent manner. Cell. Signal. 17: 461—471. PMID 15601624 DOI:10.1016/j.cellsig.2004.09.012
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Chan A.M.-L., McGovern E.S., Catalano G., Fleming T.P., Miki T. (1994). Expression cDNA cloning of a novel oncogene with sequence similarity to regulators of small GTP-binding proteins. Oncogene. 9: 1057—1063. PMID 8134109

Див. також

• Хромосома 7