BHLHE40

BHLHE40
Ідентифікатори
Символи	BHLHE40, BHLHB2, DEC1, HLHB2, SHARP-2, STRA13, Stra14, basic helix-loop-helix family member e40, Clast5, SHARP2
Зовнішні ІД	OMIM: 604256 MGI: 1097714 HomoloGene: 2722 GeneCards: BHLHE40
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • MRF binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • bHLH transcription factor binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • sequence-specific DNA binding • sequence-specific double-stranded DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • Ядерні тільця Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to light stimulus • ритмічний процес • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • entrainment of circadian clock by photoperiod • циркадний ритм • somitogenesis • Сигнальний шлях Notch • диференціація клітин • regulation of neurogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8553	20893
Ensembl	ENSG00000134107	ENSMUSG00000030103
UniProt	O14503	O35185
RefSeq (мРНК)	NM_003670	NM_011498
RefSeq (білок)	NP_003661	NP_035628
Локус (UCSC)	Хр. 3: 4.98 – 4.99 Mb	Хр. 6: 108.64 – 108.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BHLHE40 (англ. Basic helix-loop-helix family member e40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 45 510.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERIPSAQPP		PACLPKAPGL		EHGDLPGMYP		AHMYQVYKSR		RGIKRSEDSK
ETYKLPHRLI		EKKRRDRINE		CIAQLKDLLP		EHLKLTTLGH		LEKAVVLELT
LKHVKALTNL		IDQQQQKIIA		LQSGLQAGEL		SGRNVETGQE		MFCSGFQTCA
REVLQYLAKH		ENTRDLKSSQ		LVTHLHRVVS		ELLQGGTSRK		PSDPAPKVMD
FKEKPSSPAK		GSEGPGKNCV		PVIQRTFAHS		SGEQSGSDTD		TDSGYGGESE
KGDLRSEQPC		FKSDHGRRFT		MGERIGAIKQ		ESEEPPTKKN		RMQLSDDEGH
FTSSDLISSP		FLGPHPHQPP		FCLPFYLIPP		SATAYLPMLE		KCWYPTSVPV
LYPGLNASAA		ALSSFMNPDK		ISAPLLMPQR		LPSPLPAHPS		VDSSVLLQAL
KPIPPLNLET		KD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ivanova A.V., Ivanov S.V., Danilkovitch-Miagkova A., Lerman M.I. (2001). Regulation of STRA13 by the von Hippel-Lindau tumor suppressor protein, hypoxia, and the UBC9/ubiquitin proteasome degradation pathway. J. Biol. Chem. 276: 15306—15315. PMID 11278694 DOI:10.1074/jbc.M010516200
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 3