BRAT1

BRAT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4IFI
Ідентифікатори
Символи	BRAT1, BAAT1, C7orf27, RMFSL, BRCA1 associated ATM activator 1, NEDCAS
Зовнішні ІД	OMIM: 614506 MGI: 1891679 HomoloGene: 16776 GeneCards: BRAT1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, lethal neonatal spasticity-epileptic encephalopathy syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mitochondrion localization • response to ionizing radiation • cell growth • positive regulation of protein phosphorylation • проліферація • cell migration • glucose metabolic process • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of cell growth Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221927	231841
Ensembl	ENSG00000106009	ENSMUSG00000000148
UniProt	Q6PJG6	Q8C3R1
RefSeq (мРНК)	NM_152743 NM_001350626 NM_001350627	NM_001276287 NM_172724 NM_181066
RefSeq (білок)	NP_689956 NP_001337555 NP_001337556	NP_001263216 NP_851411
Локус (UCSC)	Хр. 7: 2.54 – 2.56 Mb	Хр. 5: 140.69 – 140.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BRAT1 (англ. BRCA1 associated ATM activator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 821 амінокислот, а молекулярна маса — 88 119.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPECAQLLP		ALCAVLVDPR		QPVADDTCLE		KLLDWFKTVT		EGESSVVLLQ
EHPCLVELLS		HVLKVQDLSS		GVLSFSLRLA		GTFAAQENCF		QYLQQGELLP
GLFGEPGPLG		RATWAVPTVR		SGWIQGLRSL		AQHPSALRFL		ADHGAVDTIF
SLQGDSSLFV		ASAASQLLVH		VLALSMRGGA		EGQPCLPGGD		WPACAQKIMD
HVEESLCSAA		TPKVTQALNV		LTTTFGRCQS		PWTEALWVRL		SPRVACLLER
DPIPAAHSFV		DLLLCVARSP		VFSSSDGSLW		ETVARALSCL		GPTHMGPLAL
GILKLEHCPQ		ALRTQAFQVL		LQPLACVLKA		TVQAPGPPGL		LDGTADDATT
VDTLLASKSS		CAGLLCRTLA		HLEELQPLPQ		RPSPWPQASL		LGATVTVLRL
CDGSAAPASS		VGGHLCGTLA		GCVRVQRAAL		DFLGTLSQGT		GPQELVTQAL
AVLLECLESP		GSSPTVLKKA		FQATLRWLLS		SPKTPGCSDL		GPLIPQFLRE
LFPVLQKRLC		HPCWEVRDSA		LEFLTQLSRH		WGGQADFRCA		LLASEVPQLA
LQLLQDPESY		VRASAVTAMG		QLSSQGLHAP		TSPEHAEARQ		SLFLELLHIL
SVDSEGFPRR		AVMQVFTEWL		RDGHADAAQD		TEQFVATVLQ		AASRDLDWEV
RAQGLELALV		FLGQTLGPPR		THCPYAVALP		EVAPAQPLTE		ALRALCHVGL
FDFAFCALFD		CDRPVAQKSC		DLLLFLRDKI		ASYSSLREAR		GSPNTASAEA
TLPRWRAGEQ		AQPPGDQEPE		AVLAMLRSLD		LEGLRSTLAE		SSDHVEKSPQ
SLLQDMLATG		GFLQGDEADC		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aglipay J.A., Martin S.A., Tawara H., Lee S.W., Ouchi T. (2006). ATM activation by ionizing radiation requires BRCA1-associated BAAT1. J. Biol. Chem. 281: 9710—9718. PMID 16452482 DOI:10.1074/jbc.M510332200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• So E.Y., Ouchi T. (2011). Functional interaction of BRCA1/ATM-associated BAAT1 with the DNA-PK catalytic subunit. Exp. Ther. Med. 2: 443—447. PMID 22977523 DOI:10.3892/etm.2011.232
• So E.Y., Ouchi T. (2014). BRAT1 deficiency causes increased glucose metabolism and mitochondrial malfunction. BMC Cancer. 14: 548—548. PMID 25070371 DOI:10.1186/1471-2407-14-548
• So E.Y., Ouchi T. (2013). The potential role of BRCA1-associated ATM activator-1 (BRAT1) in regulation of mTOR. J. Cancer. Biol. Res. 1: —. PMID 25657994

Див. також

• Хромосома 7