C1D

C1D
Ідентифікатори
Символи	C1D, LRP1, SUN-CoR, SUNCOR, hRrp47, C1D nuclear receptor corepressor
Зовнішні ІД	OMIM: 606997 MGI: 1927354 HomoloGene: 4619 GeneCards: C1D
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear exosome (RNase complex) • transcription repressor complex • ядерце • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • maturation of 5.8S rRNA • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10438	57316
Ensembl	ENSG00000197223	ENSMUSG00000000581
UniProt	Q13901	O35473
RefSeq (мРНК)	NM_173177 NM_001190263 NM_001190265 NM_006333	NM_020558 NM_001330649
RefSeq (білок)	NP_001177192 NP_001177194 NP_006324 NP_775269	NP_001317578 NP_065583
Локус (UCSC)	Хр. 2: 68.04 – 68.11 Mb	Хр. 11: 17.21 – 17.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C1D (англ. C1D nuclear receptor corepressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 141 амінокислот, а молекулярна маса — 16 019.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGEEINEDY		PVEIHEYLSA		FENSIGAVDE		MLKTMMSVSR		NELLQKLDPL
EQAKVDLVSA		YTLNSMFWVY		LATQGVNPKE		HPVKQELERI		RVYMNRVKEI
TDKKKAGKLD		RGAASRFVKN		ALWEPKSKNA		SKVANKGKSK		S

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, процесинг рРНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yavuzer U., Smith G.C.M., Bliss T., Werner D., Jackson S.P. (1998). DNA end-independent activation of DNA-PK mediated via association with the DNA-binding protein C1D. Genes Dev. 12: 2188—2199. PMID 9679063 DOI:10.1101/gad.12.14.2188
• Schilders G., van Dijk E., Pruijn G.J.M. (2007). C1D and hMtr4p associate with the human exosome subunit PM/Scl-100 and are involved in pre-rRNA processing. Nucleic Acids Res. 35: 2564—2572. PMID 17412707 DOI:10.1093/nar/gkm082
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Haataja L., Groffen J., Heisterkamp N. (1998). Identification of a novel Rac3-interacting protein C1D. Int. J. Mol. Med. 1: 665—670. PMID 9852280
• Erdemir T., Bilican B., Oncel D., Goding C.R., Yavuzer U. (2002). DNA damage-dependent interaction of the nuclear matrix protein C1D with Translin-associated factor X (TRAX). J. Cell Sci. 115: 207—216. PMID 11801738

Див. також

• Хромосома 2