CABIN1

CABIN1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1N6J
Ідентифікатори
Символи	CABIN1, CAIN, PPP3IN, KB-318B8.7, calcineurin binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604251 MGI: 1298375 HomoloGene: 49307 GeneCards: CABIN1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein phosphatase inhibitor activity • nucleosome binding Клітинна компонента • aggresome • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • cell surface receptor signaling pathway • negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23523	104248
Ensembl	ENSG00000099991 ENSG00000281670	ENSMUSG00000020196
UniProt	Q9Y6J0	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001199281 NM_001201429 NM_012295	NM_172549
RefSeq (білок)	NP_001186210 NP_001188358 NP_036427	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 22: 24.01 – 24.18 Mb	Хр. 10: 75.48 – 75.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CABIN1 (англ. Calcineurin binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 220 амінокислот, а молекулярна маса — 246 352.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIRIAALNAS		STIEDDHEGS		FKSHKTQTKE		AQEAEAFALY		HKALDLQKHD
RFEESAKAYH		ELLEASLLRE		AVSSGDEKEG		LKHPGLILKY		STYKNLAQLA
AQREDLETAM		EFYLEAVMLD		STDVNLWYKI		GHVALRLIRI		PLARHAFEEG
LRCNPDHWPC		LDNLITVLYT		LSDYTTCLYF		ICKALEKDCR		YSKGLVLKEK
IFEEQPCLRK		DSLRMFLKCD		MSIHDVSVSA		AETQAIVDEA		LGLRKKRQAL
IVREKEPDLK		LVQPIPFFTW		KCLGESLLAM		YNHLTTCEPP		RPSLGKRIDL
SDYQDPSQPL		ESSMVVTPVN		VIQPSTVSTN		PAVAVAEPVV		SYTSVATTSF
PLHSPGLLET		GAPVGDISGG		DKSKKGVKRK		KISEESGETA		KRRSARVRNT
KCKKEEKVDF		QELLMKFLPS		RLRKLDPEEE		DDSFNNYEVQ		SEAKLESFPS
IGPQRLSFDS		ATFMESEKQD		VHEFLLENLT		NGGILELMMR		YLKAMGHKFL
VRWPPGLAEV		VLSVYHSWRR		HSTSLPNPLL		RDCSNKHIKD		MMLMSLSCME
LQLDQWLLTK		GRSSAVSPRN		CPAGMVNGRF		GPDFPGTHCL		GDLLQLSFAS
SQRDLFEDGW		LEFVVRVYWL		KARFLALQGD		MEQALENYDI		CTEMLQSSTA
IQVEAGAERR		DIVIRLPNLH		NDSVVSLEEI		DKNLKSLERC		QSLEEIQRLY
EAGDYKAVVH		LLRPTLCTSG		FDRAKHLEFM		TSIPERPAQL		LLLQDSLLRL
KDYRQCFECS		DVALNEAVQQ		MVNSGEAAAK		EEWVATVTQL		LMGIEQALSA
DSSGSILKVS		SSTTGLVRLT		NNLIQVIDCS		MAVQEEAKEP		HVSSVLPWII
LHRIIWQEED		TFHSLCHQQQ		LQNPAEEGMS		ETPMLPSSLM		LLNTAHEYLG
RRSWCCNSDG		ALLRFYVRVL		QKELAASTSE		DTHPYKEELE		TALEQCFYCL
YSFPSKKSKA		RYLEEHSAQQ		VDLIWEDALF		MFEYFKPKTL		PEFDSYKTST
VSADLANLLK		RIATIVPRTE		RPALSLDKVS		AYIEGTSTEV		PCLPEGADPS
PPVVNELYYL		LADYHFKNKE		QSKAIKFYMH		DICICPNRFD		SWAGMALARA
SRIQDKLNSN		ELKSDGPIWK		HATPVLNCFR		RALEIDSSNL		SLWIEYGTMS
YALHSFASRQ		LKQWRGELPP		ELVQQMEGRR		DSMLETAKHC		FTSAARCEGD
GDEEEWLIHY		MLGKVAEKQQ		QPPTVYLLHY		RQAGHYLHEE		AARYPKKIHY
HNPPELAMEA		LEVYFRLHAS		ILKLLGKPDS		GVGAEVLVNF		MKEAAEGPFA
RGEEKNTPKA		SEKEKACLVD		EDSHSSAGTL		PGPGASLPSS		SGPGLTSPPY
TATPIDHDYV		KCKKPHQQAT		PDDRSQDSTA		VALSDSSSTQ		DFFNEPTSLL
EGSRKSYTEK		RLPILSSQAG		ATGKDLQGAT		EERGKNEESL		ESTEGFRAAE
QGVQKPAAET		PASACIPGKP		SASTPTLWDG		KKRGDLPGEP		VAFPQGLPAG
AEEQRQFLTE		QCIASFRLCL		SRFPQHYKSL		YRLAFLYTYS		KTHRNLQWAR
DVLLGSSIPW		QQLQHMPAQG		LFCERNKTNF		FNGIWRIPVD		EIDRPGSFAW
HMNRSIVLLL		KVLAQLRDHS		TLLKVSSMLQ		RTPDQGKKYL		RDADRQVLAQ
RAFILTVKVL		EDTLSELAEG		SERPGPKVCG		LPGARMTTDV		SHKASPEDGQ
EGLPQPKKPP		LADGSGPGPE		PGGKVGLLNH		RPVAMDAGDS		ADQSGERKDK
ESPRAGPTEP		MDTSEATVCH		SDLERTPPLL		PGRPARDRGP		ESRPTELSLE
ELSISARQQP		TPLTPAQPAP		APAPATTTGT		RAGGHPEEPL		SRLSRKRKLL
EDTESGKTLL		LDAYRVWQQG		QKGVAYDLGR		VERIMSETYM		LIKQVDEEAA
LEQAVKFCQV		HLGAAAQRQA		SGDTPTTPKH		PKDSRENFFP		VTVVPTAPDP
VPADSVQRPS		DAHTKPRPAL		AAATTIITCP		PSASASTLDQ		SKDPGPPRPH
RPEATPSMAS		LGPEGEELAR		VAEGTSFPPQ		EPRHSPQVKM		APTSSPAEPH
CWPAEAALGT		GAEPTCSQEG		KLRPEPRRDG		EAQEAASETQ		PLSSPPTAAS
SKAPSSGSAQ		PPEGHPGKPE		PSRAKSRPLP		NMPKLVIPSA		ATKFPPEITV
TPPTPTLLSP		KGSISEETKQ		KLKSAILSAQ		SAANVRKESL		CQPALEVLET
SSQESSLESE		TDEDDDYMDI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tagami H., Ray-Gallet D., Almouzni G., Nakatani Y. (2004). Histone H3.1 and H3.3 complexes mediate nucleosome assembly pathways dependent or independent of DNA synthesis. Cell. 116: 51—61. PMID 14718166 DOI:10.1016/S0092-8674(03)01064-X

Див. також

• Хромосома 22