CAPRIN1

CAPRIN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4WBE, 4WBP
Ідентифікатори
Символи	CAPRIN1, GPIAP1, GPIP137, GRIP137, M11S1, RNG105, p137GPI, cell cycle associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601178 MGI: 1858234 HomoloGene: 4310 GeneCards: CAPRIN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • cytoplasmic stress granule • дендрит (нейробіологія) • P-body • integral component of plasma membrane • cell projection • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • синапс Біологічний процес • диференціація клітин • negative regulation of translation • positive regulation of dendrite morphogenesis • positive regulation of dendritic spine morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4076	53872
Ensembl	ENSG00000135387	ENSMUSG00000027184
UniProt	Q14444	Q60865
RefSeq (мРНК)	NM_005898 NM_203364	NM_001111289 NM_001111290 NM_001111291 NM_001111292 NM_016739
RefSeq (білок)	NP_005889 NP_976240	NP_001104759 NP_001104760 NP_001104761 NP_001104762 NP_058019
Локус (UCSC)	Хр. 11: 34.05 – 34.1 Mb	Хр. 2: 103.59 – 103.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAPRIN1 (англ. Cell cycle associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 709 амінокислот, а молекулярна маса — 78 366.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSATSHSGS		GSKSSGPPPP		SGSSGSEAAA		GAGAAAPASQ		HPATGTGAVQ
TEAMKQILGV		IDKKLRNLEK		KKGKLDDYQE		RMNKGERLNQ		DQLDAVSKYQ
EVTNNLEFAK		ELQRSFMALS		QDIQKTIKKT		ARREQLMREE		AEQKRLKTVL
ELQYVLDKLG		DDEVRTDLKQ		GLNGVPILSE		EELSLLDEFY		KLVDPERDMS
LRLNEQYEHA		SIHLWDLLEG		KEKPVCGTTY		KVLKEIVERV		FQSNYFDSTH
NHQNGLCEEE		EAASAPAVED		QVPEAEPEPA		EEYTEQSEVE		STEYVNRQFM
AETQFTSGEK		EQVDEWTVET		VEVVNSLQQQ		PQAASPSVPE		PHSLTPVAQA
DPLVRRQRVQ		DLMAQMQGPY		NFIQDSMLDF		ENQTLDPAIV		SAQPMNPTQN
MDMPQLVCPP		VHSESRLAQP		NQVPVQPEAT		QVPLVSSTSE		GYTASQPLYQ
PSHATEQRPQ		KEPIDQIQAT		ISLNTDQTTA		SSSLPAASQP		QVFQAGTSKP
LHSSGINVNA		APFQSMQTVF		NMNAPVPPVN		EPETLKQQNQ		YQASYNQSFS
SQPHQVEQTE		LQQEQLQTVV		GTYHGSPDQS		HQVTGNHQQP		PQQNTGFPRS
NQPYYNSRGV		SRGGSRGARG		LMNGYRGPAN		GFRGGYDGYR		PSFSNTPNSG
YTQSQFSAPR		DYSGYQRDGY		QQNFKRGSGQ		SGPRGAPRGR		GGPPRPNRGM
PQMNTQQVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів синтезу білка, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках.

Література

• Ellis J.A., Luzio J.P. (1995). Identification and characterization of a novel protein (p137) which transcytoses bidirectionally in Caco-2 cells. J. Biol. Chem. 270: 20717—20723. PMID 7657653 DOI:10.1074/jbc.270.35.20717
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gessler M., Klant B., Tsaoussidou S., Ellis J.A., Luzio J.P. (1996). The gene encoding the GPI-anchored membrane protein p137GPI (M11S1) maps to human chromosome 11p13 and is highly conserved in the mouse. Genomics. 32: 169—170. PMID 8786113 DOI:10.1006/geno.1996.0099
• Shiina N., Tokunaga M. (2010). RNA granule protein 140 (RNG140), a paralog of RNG105 localized to distinct RNA granules in neuronal dendrites in the adult vertebrate brain. J. Biol. Chem. 285: 24260—24269. PMID 20516077 DOI:10.1074/jbc.M110.108944

Див. також

• Хромосома 11