CAPRIN2

CAPRIN2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4OUL, 4OUM
Ідентифікатори
Символи	CAPRIN2, C1QDC1, EEG-1, EEG1, RNG140, caprin family member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610375 MGI: 2448541 HomoloGene: 11393 GeneCards: CAPRIN2
Онтологія гена Молекулярна функція • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • центросома • receptor complex • клітинне ядро • мітохондрія • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • мембрана Біологічний процес • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of growth • диференціація клітин • negative regulation of translation • positive regulation of protein binding • negative regulation of cell growth • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of dendrite morphogenesis • positive regulation of dendritic spine morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	65981	232560
Ensembl	ENSG00000110888	ENSMUSG00000030309
UniProt	Q6IMN6	Q05A80
RefSeq (мРНК)	NM_001002259 NM_001206856 NM_023925 NM_032156 NM_001319842 NM_001319843 NM_001319844 NM_001319845 NM_001319846	NM_001301351 NM_181541
RefSeq (білок)	NP_001002259 NP_001193785 NP_001306771 NP_001306772 NP_001306773 NP_001306774 NP_001306775 NP_076414 NP_115532	NP_001288280 NP_853519
Локус (UCSC)	Хр. 12: 30.71 – 30.75 Mb	Хр. 6: 148.74 – 148.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAPRIN2 (англ. Caprin family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 127 амінокислот, а молекулярна маса — 125 925.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVQVSQASL		GFELTSVEKS		LREWSRLSRE		VIAWLCPSSP		NFILNFPPPP
SASSVSMVQL		FSSPFGYQSP		SGHSEEEREG		NMKSAKPQVN		HSQHGESQRA
LSPLQSTLSS		AASPSQAYET		YIENGLICLK		HKIRNIEKKK		LKLEDYKDRL
KSGEHLNPDQ		LEAVEKYEEV		LHNLEFAKEL		QKTFSGLSLD		LLKAQKKAQR
REHMLKLEAE		KKKLRTILQV		QYVLQNLTQE		HVQKDFKGGL		NGAVYLPSKE
LDYLIKFSKL		TCPERNESLS		VEDQMEQSSL		YFWDLLEGSE		KAVVGTTYKH
LKDLLSKLLN		SGYFESIPVP		KNAKEKEVPL		EEEMLIQSEK		KTQLSKTESV
KESESLMEFA		QPEIQPQEFL		NRRYMTEVDY		SNKQGEEQPW		EADYARKPNL
PKRWDMLTEP		DGQEKKQESF		KSWEASGKHQ		EVSKPAVSLE		QRKQDTSKLR
STLPEEQKKQ		EISKSKPSPS		QWKQDTPKSK		AGYVQEEQKK		QETPKLWPVQ
LQKEQDPKKQ		TPKSWTPSMQ		SEQNTTKSWT		TPMCEEQDSK		QPETPKSWEN
NVESQKHSLT		SQSQISPKSW		GVATASLIPN		DQLLPRKLNT		EPKDVPKPVH
QPVGSSSTLP		KDPVLRKEKL		QDLMTQIQGT		CNFMQESVLD		FDKPSSAIPT
SQPPSATPGS		PVASKEQNLS		SQSDFLQEPL		QATSSPVTCS		SNACLVTTDQ
ASSGSETEFM		TSETPEAAIP		PGKQPSSLAS		PNPPMAKGSE		QGFQSPPASS
SSVTINTAPF		QAMQTVFNVN		APLPPRKEQE		IKESPYSPGY		NQSFTTASTQ
TPPQCQLPSI		HVEQTVHSQE		TAANYHPDGT		IQVSNGSLAF		YPAQTNVFPR
PTQPFVNSRG		SVRGCTRGGR		LITNSYRSPG		GYKGFDTYRG		LPSISNGNYS
QLQFQAREYS		GAPYSQRDNF		QQCYKRGGTS		GGPRANSRAG		WSDSSQVSSP
ERDNETFNSG		DSGQGDSRSM		TPVDVPVTNP		AATILPVHVY		PLPQQMRVAF
SAARTSNLAP		GTLDQPIVFD		LLLNNLGETF		DLQLGRFNCP		VNGTYVFIFH
MLKLAVNVPL		YVNLMKNEEV		LVSAYANDGA		PDHETASNHA		ILQLFQGDQI
WLRLHRGAIY		GSSWKYSTFS		GYLLYQD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів синтезу білка, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція росту, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, мітохондрії.

Література

• Aerbajinai W., Lee Y.T., Wojda U., Barr V.A., Miller J.L. (2004). Cloning and characterization of a gene expressed during terminal differentiation that encodes a novel inhibitor of growth. J. Biol. Chem. 279: 1916—1921. PMID 14593112 DOI:10.1074/jbc.M305634200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shiina N., Tokunaga M. (2010). RNA granule protein 140 (RNG140), a paralog of RNG105 localized to distinct RNA granules in neuronal dendrites in the adult vertebrate brain. J. Biol. Chem. 285: 24260—24269. PMID 20516077 DOI:10.1074/jbc.M110.108944
• Wang X., Jia Y., Fei C., Song X., Li L. (2016). Caprin-2 positively regulates CDK14/Cyclin Y-mediated LRP5/6 constitutive phosphorylation. J. Biol. Chem. 291: 26427—26434. PMID 27821587 DOI:10.1074/jbc.M116.744607

Див. також

• Хромосома 12