CC2D1B

CC2D1B
Ідентифікатори
Символи	CC2D1B, coiled-coil and C2 domain containing 1B, Lgd1
Зовнішні ІД	MGI: 2443076 HomoloGene: 70951 GeneCards: CC2D1B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	200014	319965
Ensembl	ENSG00000154222	ENSMUSG00000028582
UniProt	Q5T0F9	Q8BRN9
RefSeq (мРНК)	NM_032449 NM_001330585	NM_177045
RefSeq (білок)	NP_001317514 NP_115825	NP_796019
Локус (UCSC)	Хр. 1: 52.35 – 52.37 Mb	Хр. 4: 108.48 – 108.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CC2D1B (англ. Coiled-coil and C2 domain containing 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 94 224.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMPGPRPRKG		PQARGQGVAA		AKQMGLFMEF		GPEDMLLGMD		EAEDDEDLEA
ELLALTGEAQ		TTGKKPAPKG		QAPLPMAHIE		KLAADCMRDV		EEEEEEEGLE
EDAELLTELQ		EVLGVDEETE		PLDGDEVADP		GGSEEENGLE		DTEPPVQTAV
LTASAPAAQA		GASQGLHALL		EERIHNYREA		AASAKEAGEA		AKARRCERGL
KTLESQLASV		RRGRKINEDE		IPPPVALGKR		PLAPQEPANR		SPETDPPAPP
ALESDNPSQP		ETSLPGISAQ		PVSDLDPDPR		ALLSSRQREY		KVAALSAKRA
GELDRARELM		RIGKRFGAVL		EALEKGQPVD		LSAMPPAPED		LKPQQASQAP
TAPSVIPPAV		ERVQPVMAPD		VPATPVAPTE		SQTVLDALQQ		RLNKYREAGI
QARSGGDERK		ARMHERIAKQ		YQDAIRAHRA		GRKVNFAELP		VPPGFPPIPG
LESTMGVEED		AVAATLAAAE		KLASAEDSAP		ADKDEDEPPG		HLQGEPPAQA
PVAKKPARPT		VPSSQRLPEP		RASSSKESPS		PSVREQLALL		EARKLQYQRA
ALQAKRSQDL		EQAKAYLRVA		KWLEAQIIQA		RSGRPVDLSK		VPSPLTDEEG
DFILIHHEDL		RLSQKAEEVY		AQLQKMLLEQ		QEKCLLFSKQ		FMHQGNVAET
TRFEKLAQDR		KKQLEILQLA		QAQGLDPPTH		HFELKTFQTV		RIFSELNSTE
MHLIIVRGMN		LPAPPGVTPD		DLDAFVRFEF		HYPNSDQAQK		SKTAVVKNTN
SPEFDQLFKL		NINRNHRGFK		RVIQSKGIKF		EIFHKGSFFR		SDKLVGTAHL
KLERLENECE		IREIVEVLDG		RKPTGGKLEV		KVRLREPLSG		QDVQMVTENW
LVLEPRGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85

Див. також

• Хромосома 1